FuNGI

A0A168SDT0

Protein Details

Accession

A0A168SDT0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1240-1261	DNKTNKYSYKVKWKNFDHTQCT	Hydrophilic
1275-1310	RDYWDRIKQVPNKGSRKNKLRDDHHIKNNKRSRHES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1289-1295	SRKNKLR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.5, nucl 10, cyto 9, mito 2, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd00303 retropepsin_like cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSINNTIIEDATMVDTTNPLEMAKTTITTMMKNGAEDLKMITTTIASGQPCSNDLLAQCEENAKLLERTKALFNKAYPLEPMFAPVKDIKVPNIEANQVPGLRSETDPLLPGPIGDVYLDVTKFIQHFERIFKFKELNIDLFYNRYLEWSLGKAYAQHIANMRANMTQDTVENWEMVKTWLLQYKDTPAQRWKNLCELSRITLQHGESSDQMCRRVLQDAERLGLDRFSAAELLVAGVLRYRPDSWNQKVSDAMEKCIDLGESSLIDIIHRLSSLGLNSERTGKRKGMETAYATSSSSNSNSSSSSSNSSNSSTSNSSSSRNSNRTNSNSNNYTPAARPCKKDCGATYYHGHNAVCPRKHQTVDWKQVHQDNKRARAATKHHHHHQQQHQQHNDDQRRAVRSDIEASQSLQQSRYAPHNLVTASDADEVTNMTEQLSLDGYDDYDKIMCKYNRSSNKEHVKLNDSSCASDDDILVPITIEGHQILALVDGGANFSSLDQTFCTNKKISFVTFDQPHPISLADSDATGFIYGRTAPLTIHYRSKTYRAQFDVMHLSFGRNMCIGTDFMKVLGIAYTGLATSWTSPNRTEEESPFKDVVTPNQVPYGSPTFQSNLQAYIKPSIDANALIPTDSFCTHPDAMIRLDTPPDAAGYRAQYRIADALIPVVKETVQKWLNQGIVVRVPSNEDQFPLPKISDIFLKLKDAVIYTTLDLTNAFHRFKIYPPHQHKTTFTSVDGLQYMFRGCPFGLSSKFQRVMTSLFSQNPFHSYVATFVDDIVIYSASPKQHAHHVRSVIDELTRVNLMLNPNKCHFAQKTIYLLGFCIEANGKSRLDDRKVTNVQEWPEPTTGKQIQQFLGLVNYFRTYIPYFADLTAPLDTLRSHEGKLRHRWTSYHSHAFQRIKDALVHSTVLHAPKTDLPFHLATDASDVGIGAVLYQIGLNDEIYINGFMARSLSKSERNYAIMRTTHKRELDSDYMEPPTEAERKDILLKAHLFGHFGAEAIVKAIHNNGMHWTNLKKDALELVKKCTPCQRFNIVKTGYNPHKPIHALLPGDHWAIDLTGPLPTTAEHNTYLLVMVDICSRFVILRPIKDKTAESVVKAIIPVFCDFGIPMIVQSDNGKEFVNQVMTRFKTKAGFDHRLITPYYPQSNGSAERTVGTSKMVIKKLVDGAPEHWDICAPIAQLAINNKVSKRTNATPFSVMFGRKMNDFKNYNNELVATDGSQTDEANTYEVESILAHKQDNKTNKYSYKVKWKNFDHTQCTWEPSDNFLSDLCIRDYWDRIKQVPNKGSRKNKLRDDHHIKNNKRSRHEST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.08
7	0.09
8	0.09
9	0.13
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.19
14	0.2
15	0.21
16	0.22
17	0.25
18	0.25
19	0.24
20	0.27
21	0.24
22	0.23
23	0.23
24	0.23
25	0.18
26	0.17
27	0.17
28	0.14
29	0.11
30	0.12
31	0.13
32	0.15
33	0.14
34	0.16
35	0.18
36	0.2
37	0.21
38	0.23
39	0.2
40	0.18
41	0.18
42	0.22
43	0.21
44	0.2
45	0.2
46	0.2
47	0.2
48	0.19
49	0.2
50	0.17
51	0.2
52	0.22
53	0.27
54	0.26
55	0.28
56	0.35
57	0.39
58	0.42
59	0.43
60	0.41
61	0.45
62	0.46
63	0.45
64	0.4
65	0.37
66	0.34
67	0.28
68	0.31
69	0.25
70	0.22
71	0.24
72	0.23
73	0.24
74	0.27
75	0.29
76	0.28
77	0.31
78	0.34
79	0.36
80	0.37
81	0.38
82	0.32
83	0.34
84	0.35
85	0.3
86	0.27
87	0.23
88	0.22
89	0.21
90	0.22
91	0.21
92	0.19
93	0.2
94	0.21
95	0.2
96	0.2
97	0.17
98	0.16
99	0.14
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.09
105	0.12
106	0.12
107	0.11
108	0.11
109	0.13
110	0.14
111	0.16
112	0.18
113	0.19
114	0.22
115	0.3
116	0.37
117	0.39
118	0.42
119	0.45
120	0.43
121	0.41
122	0.48
123	0.44
124	0.4
125	0.39
126	0.38
127	0.35
128	0.34
129	0.32
130	0.24
131	0.19
132	0.18
133	0.15
134	0.14
135	0.15
136	0.15
137	0.17
138	0.17
139	0.17
140	0.17
141	0.18
142	0.23
143	0.22
144	0.23
145	0.25
146	0.3
147	0.33
148	0.32
149	0.32
150	0.27
151	0.28
152	0.25
153	0.23
154	0.18
155	0.14
156	0.16
157	0.19
158	0.18
159	0.17
160	0.16
161	0.15
162	0.15
163	0.15
164	0.15
165	0.11
166	0.15
167	0.2
168	0.22
169	0.23
170	0.24
171	0.31
172	0.37
173	0.39
174	0.4
175	0.45
176	0.52
177	0.58
178	0.62
179	0.58
180	0.6
181	0.63
182	0.59
183	0.56
184	0.51
185	0.48
186	0.48
187	0.46
188	0.4
189	0.38
190	0.37
191	0.33
192	0.31
193	0.29
194	0.24
195	0.26
196	0.28
197	0.26
198	0.27
199	0.24
200	0.24
201	0.23
202	0.26
203	0.26
204	0.26
205	0.31
206	0.32
207	0.32
208	0.32
209	0.31
210	0.26
211	0.24
212	0.18
213	0.12
214	0.1
215	0.09
216	0.09
217	0.07
218	0.07
219	0.06
220	0.07
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.09
228	0.11
229	0.13
230	0.22
231	0.31
232	0.37
233	0.44
234	0.45
235	0.45
236	0.45
237	0.45
238	0.47
239	0.39
240	0.35
241	0.29
242	0.27
243	0.25
244	0.23
245	0.21
246	0.11
247	0.11
248	0.09
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.09
261	0.09
262	0.13
263	0.14
264	0.15
265	0.16
266	0.24
267	0.27
268	0.29
269	0.32
270	0.31
271	0.32
272	0.36
273	0.41
274	0.38
275	0.41
276	0.41
277	0.4
278	0.4
279	0.38
280	0.32
281	0.28
282	0.23
283	0.19
284	0.17
285	0.15
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.2
293	0.2
294	0.2
295	0.21
296	0.23
297	0.21
298	0.2
299	0.22
300	0.2
301	0.2
302	0.22
303	0.22
304	0.23
305	0.26
306	0.33
307	0.37
308	0.42
309	0.45
310	0.48
311	0.54
312	0.57
313	0.62
314	0.6
315	0.59
316	0.57
317	0.53
318	0.5
319	0.44
320	0.4
321	0.35
322	0.37
323	0.4
324	0.41
325	0.45
326	0.45
327	0.54
328	0.53
329	0.56
330	0.5
331	0.47
332	0.46
333	0.45
334	0.45
335	0.39
336	0.4
337	0.37
338	0.34
339	0.31
340	0.36
341	0.39
342	0.37
343	0.36
344	0.4
345	0.42
346	0.44
347	0.45
348	0.47
349	0.5
350	0.58
351	0.61
352	0.58
353	0.56
354	0.61
355	0.65
356	0.59
357	0.57
358	0.55
359	0.57
360	0.59
361	0.57
362	0.52
363	0.53
364	0.55
365	0.56
366	0.58
367	0.59
368	0.61
369	0.68
370	0.73
371	0.74
372	0.77
373	0.77
374	0.76
375	0.76
376	0.75
377	0.69
378	0.68
379	0.69
380	0.65
381	0.58
382	0.54
383	0.49
384	0.48
385	0.45
386	0.41
387	0.33
388	0.28
389	0.29
390	0.27
391	0.25
392	0.22
393	0.22
394	0.25
395	0.25
396	0.24
397	0.21
398	0.21
399	0.19
400	0.21
401	0.25
402	0.24
403	0.22
404	0.22
405	0.25
406	0.23
407	0.22
408	0.2
409	0.15
410	0.14
411	0.14
412	0.13
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.08
418	0.06
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.17
435	0.17
436	0.2
437	0.27
438	0.35
439	0.45
440	0.51
441	0.56
442	0.57
443	0.67
444	0.67
445	0.65
446	0.6
447	0.55
448	0.53
449	0.49
450	0.46
451	0.36
452	0.32
453	0.29
454	0.27
455	0.22
456	0.18
457	0.16
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.09
462	0.07
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.09
487	0.12
488	0.13
489	0.17
490	0.17
491	0.18
492	0.2
493	0.22
494	0.2
495	0.22
496	0.24
497	0.28
498	0.29
499	0.3
500	0.31
501	0.29
502	0.29
503	0.24
504	0.22
505	0.15
506	0.12
507	0.12
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.05
522	0.1
523	0.14
524	0.15
525	0.21
526	0.22
527	0.25
528	0.26
529	0.32
530	0.35
531	0.35
532	0.39
533	0.37
534	0.38
535	0.35
536	0.37
537	0.39
538	0.32
539	0.3
540	0.23
541	0.2
542	0.2
543	0.2
544	0.17
545	0.1
546	0.1
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.07
557	0.07
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.08
568	0.1
569	0.11
570	0.12
571	0.15
572	0.17
573	0.2
574	0.21
575	0.22
576	0.29
577	0.3
578	0.33
579	0.31
580	0.28
581	0.28
582	0.26
583	0.25
584	0.24
585	0.23
586	0.2
587	0.22
588	0.22
589	0.19
590	0.22
591	0.24
592	0.16
593	0.16
594	0.17
595	0.16
596	0.17
597	0.19
598	0.16
599	0.15
600	0.16
601	0.17
602	0.17
603	0.19
604	0.18
605	0.16
606	0.15
607	0.13
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.08
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.07
620	0.12
621	0.12
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.13
626	0.13
627	0.13
628	0.09
629	0.09
630	0.09
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.09
638	0.11
639	0.12
640	0.12
641	0.11
642	0.12
643	0.12
644	0.11
645	0.08
646	0.06
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.08
654	0.09
655	0.14
656	0.15
657	0.15
658	0.17
659	0.2
660	0.2
661	0.2
662	0.2
663	0.14
664	0.15
665	0.15
666	0.14
667	0.1
668	0.12
669	0.13
670	0.15
671	0.13
672	0.12
673	0.12
674	0.13
675	0.14
676	0.13
677	0.12
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.12
682	0.14
683	0.15
684	0.14
685	0.16
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.13
690	0.11
691	0.09
692	0.09
693	0.08
694	0.09
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.11
700	0.13
701	0.13
702	0.12
703	0.14
704	0.15
705	0.17
706	0.26
707	0.28
708	0.36
709	0.43
710	0.5
711	0.51
712	0.53
713	0.53
714	0.49
715	0.49
716	0.4
717	0.32
718	0.28
719	0.25
720	0.24
721	0.23
722	0.17
723	0.11
724	0.1
725	0.1
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.06
730	0.07
731	0.08
732	0.11
733	0.13
734	0.16
735	0.2
736	0.24
737	0.27
738	0.26
739	0.26
740	0.24
741	0.24
742	0.24
743	0.25
744	0.21
745	0.21
746	0.23
747	0.23
748	0.22
749	0.23
750	0.21
751	0.17
752	0.15
753	0.13
754	0.13
755	0.14
756	0.14
757	0.12
758	0.09
759	0.1
760	0.09
761	0.08
762	0.07
763	0.05
764	0.04
765	0.05
766	0.08
767	0.08
768	0.1
769	0.11
770	0.11
771	0.2
772	0.27
773	0.31
774	0.34
775	0.37
776	0.37
777	0.38
778	0.38
779	0.29
780	0.23
781	0.19
782	0.13
783	0.11
784	0.1
785	0.08
786	0.07
787	0.09
788	0.12
789	0.18
790	0.21
791	0.23
792	0.24
793	0.27
794	0.27
795	0.3
796	0.27
797	0.28
798	0.28
799	0.28
800	0.3
801	0.29
802	0.29
803	0.24
804	0.23
805	0.17
806	0.14
807	0.1
808	0.08
809	0.07
810	0.07
811	0.1
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.17
816	0.22
817	0.25
818	0.3
819	0.31
820	0.38
821	0.42
822	0.43
823	0.42
824	0.41
825	0.39
826	0.37
827	0.35
828	0.29
829	0.27
830	0.25
831	0.22
832	0.26
833	0.27
834	0.27
835	0.29
836	0.29
837	0.28
838	0.29
839	0.29
840	0.21
841	0.2
842	0.17
843	0.13
844	0.11
845	0.11
846	0.1
847	0.1
848	0.12
849	0.11
850	0.12
851	0.13
852	0.14
853	0.15
854	0.14
855	0.15
856	0.12
857	0.13
858	0.12
859	0.11
860	0.09
861	0.09
862	0.08
863	0.09
864	0.13
865	0.12
866	0.13
867	0.17
868	0.24
869	0.31
870	0.41
871	0.45
872	0.46
873	0.46
874	0.47
875	0.48
876	0.52
877	0.52
878	0.51
879	0.48
880	0.48
881	0.55
882	0.57
883	0.52
884	0.49
885	0.42
886	0.34
887	0.33
888	0.3
889	0.24
890	0.22
891	0.22
892	0.15
893	0.16
894	0.18
895	0.17
896	0.15
897	0.14
898	0.14
899	0.17
900	0.21
901	0.2
902	0.19
903	0.21
904	0.21
905	0.21
906	0.22
907	0.17
908	0.14
909	0.15
910	0.14
911	0.1
912	0.09
913	0.08
914	0.06
915	0.06
916	0.06
917	0.03
918	0.03
919	0.03
920	0.03
921	0.03
922	0.03
923	0.04
924	0.04
925	0.04
926	0.05
927	0.05
928	0.05
929	0.07
930	0.07
931	0.06
932	0.06
933	0.06
934	0.05
935	0.07
936	0.07
937	0.07
938	0.11
939	0.15
940	0.21
941	0.24
942	0.28
943	0.31
944	0.34
945	0.35
946	0.33
947	0.36
948	0.33
949	0.36
950	0.38
951	0.41
952	0.44
953	0.44
954	0.43
955	0.4
956	0.44
957	0.44
958	0.41
959	0.38
960	0.34
961	0.33
962	0.31
963	0.28
964	0.21
965	0.2
966	0.19
967	0.18
968	0.18
969	0.18
970	0.19
971	0.24
972	0.26
973	0.23
974	0.25
975	0.25
976	0.24
977	0.27
978	0.26
979	0.23
980	0.2
981	0.21
982	0.15
983	0.14
984	0.13
985	0.09
986	0.09
987	0.09
988	0.09
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.11
993	0.11
994	0.12
995	0.15
996	0.16
997	0.17
998	0.19
999	0.2
1000	0.2
1001	0.25
1002	0.26
1003	0.21
1004	0.21
1005	0.27
1006	0.31
1007	0.38
1008	0.35
1009	0.37
1010	0.41
1011	0.41
1012	0.43
1013	0.45
1014	0.45
1015	0.42
1016	0.47
1017	0.51
1018	0.54
1019	0.58
1020	0.65
1021	0.59
1022	0.57
1023	0.56
1024	0.58
1025	0.56
1026	0.54
1027	0.53
1028	0.45
1029	0.46
1030	0.43
1031	0.41
1032	0.38
1033	0.36
1034	0.3
1035	0.28
1036	0.31
1037	0.28
1038	0.27
1039	0.25
1040	0.19
1041	0.14
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.08
1045	0.06
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.07
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.1
1052	0.12
1053	0.15
1054	0.14
1055	0.15
1056	0.15
1057	0.15
1058	0.15
1059	0.12
1060	0.1
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.2
1071	0.21
1072	0.29
1073	0.33
1074	0.37
1075	0.39
1076	0.42
1077	0.42
1078	0.36
1079	0.42
1080	0.36
1081	0.33
1082	0.33
1083	0.31
1084	0.29
1085	0.28
1086	0.25
1087	0.16
1088	0.16
1089	0.16
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.12
1093	0.12
1094	0.11
1095	0.11
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.09
1100	0.09
1101	0.11
1102	0.13
1103	0.13
1104	0.14
1105	0.14
1106	0.13
1107	0.15
1108	0.17
1109	0.22
1110	0.2
1111	0.21
1112	0.28
1113	0.3
1114	0.34
1115	0.34
1116	0.33
1117	0.32
1118	0.34
1119	0.4
1120	0.42
1121	0.47
1122	0.44
1123	0.51
1124	0.49
1125	0.46
1126	0.46
1127	0.39
1128	0.36
1129	0.36
1130	0.37
1131	0.31
1132	0.3
1133	0.31
1134	0.33
1135	0.35
1136	0.33
1137	0.28
1138	0.25
1139	0.25
1140	0.25
1141	0.24
1142	0.2
1143	0.17
1144	0.16
1145	0.21
1146	0.28
1147	0.3
1148	0.31
1149	0.31
1150	0.34
1151	0.39
1152	0.39
1153	0.34
1154	0.29
1155	0.29
1156	0.32
1157	0.33
1158	0.29
1159	0.23
1160	0.2
1161	0.19
1162	0.18
1163	0.18
1164	0.13
1165	0.11
1166	0.12
1167	0.12
1168	0.15
1169	0.18
1170	0.22
1171	0.24
1172	0.27
1173	0.27
1174	0.34
1175	0.37
1176	0.39
1177	0.44
1178	0.46
1179	0.51
1180	0.54
1181	0.57
1182	0.54
1183	0.52
1184	0.5
1185	0.47
1186	0.4
1187	0.33
1188	0.32
1189	0.29
1190	0.29
1191	0.34
1192	0.33
1193	0.37
1194	0.39
1195	0.42
1196	0.47
1197	0.5
1198	0.47
1199	0.43
1200	0.4
1201	0.32
1202	0.31
1203	0.27
1204	0.18
1205	0.14
1206	0.13
1207	0.14
1208	0.13
1209	0.13
1210	0.12
1211	0.13
1212	0.13
1213	0.13
1214	0.12
1215	0.12
1216	0.12
1217	0.12
1218	0.11
1219	0.09
1220	0.12
1221	0.15
1222	0.17
1223	0.17
1224	0.22
1225	0.27
1226	0.35
1227	0.44
1228	0.48
1229	0.5
1230	0.57
1231	0.61
1232	0.63
1233	0.66
1234	0.67
1235	0.69
1236	0.72
1237	0.75
1238	0.76
1239	0.78
1240	0.81
1241	0.82
1242	0.84
1243	0.8
1244	0.74
1245	0.72
1246	0.64
1247	0.62
1248	0.55
1249	0.5
1250	0.41
1251	0.39
1252	0.4
1253	0.35
1254	0.32
1255	0.27
1256	0.29
1257	0.25
1258	0.27
1259	0.24
1260	0.19
1261	0.22
1262	0.24
1263	0.3
1264	0.32
1265	0.38
1266	0.41
1267	0.43
1268	0.52
1269	0.57
1270	0.64
1271	0.67
1272	0.71
1273	0.73
1274	0.77
1275	0.84
1276	0.84
1277	0.87
1278	0.86
1279	0.87
1280	0.87
1281	0.86
1282	0.87
1283	0.86
1284	0.86
1285	0.86
1286	0.87
1287	0.84
1288	0.84
1289	0.85
1290	0.83
1291	0.82

A0A168SDT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer