Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A163IW30

Protein Details
Accession A0A163IW30    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-202DDDTSGNKKKKKKKKEMGPGASARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
186-195KKKKKKKKEM
338-356RGGRGRPRGRKSEGSKRGR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MDTFISSDIHQQRADLGPESTFQLPSLQQNVEPPSTYMNTELLASMMNKLAKSMDVPHLESSAVVYLALATQQRLQECIVTMIEASRHRVDSQAVEIPPLDPKDQQPLYKVSNVQDIRKQLLAIERVEREEERKRRQALAERERNAHLSDGGGPGGGGGTGTGSGSGGGGAGGDGDDGDDDTSGNKKKKKKKKEMGPGASARNMSEDIYKQATNKTALMSAGGIRKSWMLAGMASNATSGGVAPKETPSTASPSVSESSHQLPSSTSSSPAAAATTTTTNTTTTTTTATTKLPTSSSRLSLAQDFNSTTHSSPSLPSSLPSTSSFKSELVSTEDTSARGGRGRPRGRKSEGSKRGRSSSSSSSSVASSKRERTQDFYLPPSMIGRHHSHHSHHQTRLGEQPSRTVTLIDAVHALEYELDSGCECGNRALIKSYNQYLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.28
3 0.24
4 0.22
5 0.23
6 0.26
7 0.24
8 0.2
9 0.17
10 0.18
11 0.19
12 0.23
13 0.27
14 0.25
15 0.25
16 0.3
17 0.34
18 0.33
19 0.32
20 0.27
21 0.27
22 0.27
23 0.27
24 0.24
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.17
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.13
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.16
40 0.19
41 0.24
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.22
49 0.16
50 0.12
51 0.09
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.12
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.19
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.22
77 0.23
78 0.22
79 0.25
80 0.26
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.24
86 0.23
87 0.2
88 0.16
89 0.18
90 0.26
91 0.29
92 0.3
93 0.3
94 0.33
95 0.36
96 0.39
97 0.4
98 0.32
99 0.39
100 0.39
101 0.39
102 0.39
103 0.38
104 0.36
105 0.34
106 0.32
107 0.25
108 0.28
109 0.28
110 0.25
111 0.27
112 0.25
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.25
117 0.32
118 0.39
119 0.42
120 0.49
121 0.51
122 0.53
123 0.58
124 0.63
125 0.64
126 0.66
127 0.67
128 0.63
129 0.63
130 0.6
131 0.55
132 0.46
133 0.36
134 0.26
135 0.17
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.05
144 0.03
145 0.02
146 0.02
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.08
170 0.13
171 0.18
172 0.24
173 0.32
174 0.43
175 0.54
176 0.64
177 0.72
178 0.78
179 0.84
180 0.9
181 0.92
182 0.89
183 0.86
184 0.79
185 0.7
186 0.62
187 0.51
188 0.4
189 0.3
190 0.23
191 0.16
192 0.14
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.1
235 0.1
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.19
242 0.17
243 0.16
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.14
250 0.17
251 0.2
252 0.18
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.21
282 0.22
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.28
288 0.28
289 0.24
290 0.23
291 0.21
292 0.19
293 0.21
294 0.2
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.17
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.17
306 0.19
307 0.21
308 0.23
309 0.21
310 0.23
311 0.25
312 0.21
313 0.22
314 0.2
315 0.18
316 0.19
317 0.21
318 0.19
319 0.21
320 0.21
321 0.21
322 0.21
323 0.2
324 0.15
325 0.16
326 0.19
327 0.23
328 0.33
329 0.42
330 0.51
331 0.58
332 0.65
333 0.69
334 0.75
335 0.76
336 0.76
337 0.78
338 0.77
339 0.78
340 0.76
341 0.75
342 0.68
343 0.64
344 0.59
345 0.57
346 0.53
347 0.48
348 0.43
349 0.38
350 0.37
351 0.37
352 0.33
353 0.3
354 0.31
355 0.35
356 0.41
357 0.47
358 0.48
359 0.51
360 0.56
361 0.58
362 0.56
363 0.54
364 0.51
365 0.44
366 0.42
367 0.37
368 0.32
369 0.25
370 0.26
371 0.26
372 0.26
373 0.33
374 0.37
375 0.4
376 0.48
377 0.57
378 0.6
379 0.6
380 0.63
381 0.59
382 0.58
383 0.61
384 0.57
385 0.52
386 0.45
387 0.47
388 0.45
389 0.45
390 0.42
391 0.34
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.21
396 0.18
397 0.15
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.15
413 0.16
414 0.18
415 0.23
416 0.27
417 0.32
418 0.38