FuNGI

A0A168S604

Protein Details

Accession

A0A168S604

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
419-445	DERQARERDQIRRDRQKQREREMRMSH	Basic
592-613	LDTFLNKAKKGKRARTDDDSDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
600-604	KKGKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MATLSSLLPKPRQTSTTRITSDNNTGKQSVSNQLISKRSAQAIPPYGKRTTFRPRFPEDFGNGGAFPEIAMAQYPLDMGRKKSAKTETSGGTLTLQVDSDGNVAYEDIARQGHGKDRIVHTSLKDLVPMKERKDMDVEKLVMDRPGEEEVMSVAEKTKAALERIVQGKIKAAQPKNVVSTSGGGSGTNKDPTYIRYTPSQVQGNDSLNSGAKQRIIRMVDAPVDPMAPPSFLHKKVPRGPPSPPAPVMHSPPRKLSAKEQAEWVIPPCISNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDNFAKFSEALYAADRHAREEVRQRNLMQQKLAQKEKDAEEEKLRELAQKAREERSGFKPSASSSSQAVPANRPTAASLMPDYDSSDESSGSDRSDSEDSDKDGGSKSHRGRTREELVEEDERQARERDQIRRDRQKQREREMRMSHMGTEAKAKHLAKEHGRDISEKIALGLAKPSASKDSMYDARLFNQSEGINSGFKGDDSYSLYDKPLFNQTSSSIYKFRGDQNDSDVLGSTDAEELERSIHQDKFGVKRGFKGAESSNDQAGGSSGPVEFEKETLGGARPSTDKDVFGLDTFLNKAKKGKRARTDDDSDDDQRRKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.57
4	0.55
5	0.54
6	0.53
7	0.53
8	0.59
9	0.58
10	0.56
11	0.49
12	0.47
13	0.44
14	0.43
15	0.42
16	0.4
17	0.36
18	0.37
19	0.37
20	0.43
21	0.46
22	0.45
23	0.46
24	0.42
25	0.41
26	0.39
27	0.39
28	0.41
29	0.46
30	0.5
31	0.52
32	0.52
33	0.52
34	0.53
35	0.51
36	0.51
37	0.53
38	0.56
39	0.58
40	0.61
41	0.66
42	0.68
43	0.71
44	0.71
45	0.64
46	0.58
47	0.51
48	0.45
49	0.37
50	0.32
51	0.26
52	0.17
53	0.13
54	0.1
55	0.08
56	0.06
57	0.06
58	0.07
59	0.06
60	0.07
61	0.07
62	0.08
63	0.13
64	0.16
65	0.18
66	0.27
67	0.31
68	0.32
69	0.4
70	0.47
71	0.46
72	0.48
73	0.52
74	0.45
75	0.45
76	0.44
77	0.37
78	0.3
79	0.27
80	0.23
81	0.17
82	0.14
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.08
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.1
98	0.11
99	0.18
100	0.23
101	0.26
102	0.3
103	0.34
104	0.4
105	0.41
106	0.42
107	0.37
108	0.38
109	0.38
110	0.32
111	0.32
112	0.29
113	0.29
114	0.35
115	0.39
116	0.36
117	0.4
118	0.4
119	0.38
120	0.44
121	0.43
122	0.4
123	0.43
124	0.4
125	0.33
126	0.34
127	0.33
128	0.27
129	0.24
130	0.19
131	0.14
132	0.15
133	0.14
134	0.12
135	0.11
136	0.1
137	0.11
138	0.1
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.13
145	0.13
146	0.15
147	0.17
148	0.17
149	0.23
150	0.26
151	0.29
152	0.27
153	0.24
154	0.27
155	0.29
156	0.32
157	0.34
158	0.34
159	0.37
160	0.4
161	0.43
162	0.44
163	0.4
164	0.37
165	0.29
166	0.28
167	0.23
168	0.2
169	0.17
170	0.13
171	0.13
172	0.15
173	0.17
174	0.18
175	0.16
176	0.15
177	0.16
178	0.19
179	0.26
180	0.24
181	0.24
182	0.25
183	0.29
184	0.32
185	0.37
186	0.4
187	0.32
188	0.34
189	0.36
190	0.35
191	0.31
192	0.28
193	0.23
194	0.18
195	0.18
196	0.16
197	0.13
198	0.14
199	0.15
200	0.16
201	0.21
202	0.22
203	0.23
204	0.23
205	0.24
206	0.23
207	0.22
208	0.22
209	0.15
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.1
214	0.08
215	0.08
216	0.13
217	0.19
218	0.2
219	0.28
220	0.31
221	0.39
222	0.47
223	0.57
224	0.58
225	0.56
226	0.58
227	0.58
228	0.59
229	0.56
230	0.49
231	0.41
232	0.39
233	0.38
234	0.4
235	0.41
236	0.41
237	0.38
238	0.39
239	0.43
240	0.4
241	0.4
242	0.41
243	0.42
244	0.42
245	0.41
246	0.41
247	0.38
248	0.35
249	0.34
250	0.28
251	0.2
252	0.14
253	0.13
254	0.11
255	0.18
256	0.18
257	0.22
258	0.26
259	0.31
260	0.35
261	0.35
262	0.38
263	0.31
264	0.33
265	0.33
266	0.36
267	0.33
268	0.33
269	0.35
270	0.31
271	0.3
272	0.3
273	0.26
274	0.18
275	0.17
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.12
281	0.13
282	0.12
283	0.14
284	0.12
285	0.11
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.1
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.1
299	0.13
300	0.13
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.14
305	0.22
306	0.29
307	0.31
308	0.34
309	0.33
310	0.4
311	0.45
312	0.44
313	0.37
314	0.35
315	0.37
316	0.41
317	0.44
318	0.36
319	0.32
320	0.34
321	0.34
322	0.36
323	0.32
324	0.28
325	0.28
326	0.29
327	0.29
328	0.27
329	0.25
330	0.2
331	0.2
332	0.23
333	0.24
334	0.29
335	0.31
336	0.32
337	0.35
338	0.35
339	0.38
340	0.39
341	0.4
342	0.34
343	0.31
344	0.3
345	0.27
346	0.3
347	0.27
348	0.21
349	0.17
350	0.18
351	0.22
352	0.23
353	0.23
354	0.2
355	0.22
356	0.22
357	0.2
358	0.19
359	0.16
360	0.15
361	0.14
362	0.13
363	0.11
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.11
380	0.12
381	0.12
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.18
386	0.18
387	0.15
388	0.16
389	0.17
390	0.17
391	0.24
392	0.26
393	0.32
394	0.37
395	0.4
396	0.44
397	0.5
398	0.53
399	0.49
400	0.47
401	0.41
402	0.41
403	0.42
404	0.38
405	0.33
406	0.29
407	0.25
408	0.25
409	0.24
410	0.2
411	0.24
412	0.3
413	0.36
414	0.41
415	0.51
416	0.6
417	0.69
418	0.78
419	0.81
420	0.85
421	0.86
422	0.87
423	0.87
424	0.87
425	0.84
426	0.84
427	0.79
428	0.74
429	0.7
430	0.61
431	0.52
432	0.46
433	0.4
434	0.31
435	0.32
436	0.27
437	0.23
438	0.28
439	0.28
440	0.27
441	0.32
442	0.39
443	0.4
444	0.46
445	0.47
446	0.46
447	0.47
448	0.45
449	0.41
450	0.38
451	0.32
452	0.25
453	0.21
454	0.18
455	0.17
456	0.15
457	0.15
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.15
465	0.14
466	0.2
467	0.23
468	0.25
469	0.27
470	0.25
471	0.27
472	0.31
473	0.31
474	0.24
475	0.25
476	0.23
477	0.2
478	0.21
479	0.2
480	0.17
481	0.15
482	0.17
483	0.12
484	0.12
485	0.13
486	0.11
487	0.13
488	0.16
489	0.19
490	0.2
491	0.2
492	0.22
493	0.24
494	0.24
495	0.23
496	0.29
497	0.27
498	0.25
499	0.27
500	0.27
501	0.3
502	0.33
503	0.34
504	0.28
505	0.28
506	0.3
507	0.31
508	0.37
509	0.39
510	0.4
511	0.39
512	0.42
513	0.45
514	0.42
515	0.39
516	0.33
517	0.24
518	0.2
519	0.18
520	0.13
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.09
527	0.09
528	0.13
529	0.16
530	0.17
531	0.18
532	0.21
533	0.27
534	0.32
535	0.42
536	0.46
537	0.42
538	0.47
539	0.53
540	0.53
541	0.48
542	0.46
543	0.41
544	0.41
545	0.47
546	0.44
547	0.39
548	0.36
549	0.35
550	0.29
551	0.25
552	0.18
553	0.12
554	0.1
555	0.08
556	0.09
557	0.09
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.12
562	0.11
563	0.12
564	0.13
565	0.15
566	0.14
567	0.14
568	0.17
569	0.18
570	0.22
571	0.28
572	0.27
573	0.25
574	0.25
575	0.28
576	0.26
577	0.25
578	0.24
579	0.17
580	0.19
581	0.2
582	0.25
583	0.24
584	0.24
585	0.32
586	0.37
587	0.46
588	0.54
589	0.62
590	0.66
591	0.74
592	0.81
593	0.81
594	0.82
595	0.78
596	0.74
597	0.7
598	0.66
599	0.64

A0A168S604

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer