FuNGI

A0A163KHX6

Protein Details

Accession

A0A163KHX6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1140-1159	MQTIRKQKISFDKTHKQVDF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.5, cyto 10, nucl 9, mito 3, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSINNATVIEDATMLDATNPLEMAKTTITTMIKNGAEDIKLITTTIASGLPCSNELIVQCEENAKLLDRTRALFHKAYPLEPMFAPVQDNKVPNIEANQVPGLRSETDPLLPGPIGDVYLDVTKFIQHFERIFKFKELNIDLFYNRYLEWSLGKAYAQHIANMRANMTQDTVENWELVKTWLLQYKDTPAQRWKNLCELSRITLQHGESSDQMCRRVLQDAERLGLDRFSAAELLVAGVLRYRPDSWNQKVSDAMEKCIDLGESSLIDIIHRLSTLGLNSERTGKRKGMETAYATSSSSNSNSSSNSYSNSSNSRTSNSRTSNSSSSRNSNSNRTNSNSNNYTPAARPCKKDCGATYYHGHNAVCPRKHQTVDWKQVHQDNKRARAATKHHHHHQQQHQQHNDDILVPITKEGHQILALDPYGSPTFQSNLQAYIKPSIDANALIPTDSFCTHPDAMIRLDTPPDAAGYRAQYRIADTLIPVVKETVQKWLNQGIVVRVPSNIYPPHQHKTTFTSVDGLQYMFRGCPFGLKPISSKFQRVMTSLFSQNPFHSYVATFVDDIVIYSASPEQHAHHVRSVIDELTRVNLMLNPNKCHFAQKTIYLLGFCIEANGKSRLDDRKVTNVQEWPEPTTGKQIQQFLGLVNYFRTYIPYFADLTAPLDTLRSHEGQLRHRWTSYHSHAFQRIKDALVHSTVLHAPKTDLPFHLATDASDVGIGAVLYQIGQNDEIYINGFMARSLSKSERNYAVTKKELLAIIFAFNKYHQHLWGRKFTLYTDHKALVYIHTQRDLNAMMTKWFDTLLDYNFEIVHLPGLQNVLPDRLSRLFPTVKELGEGEVDHKIQTQKELATNNENSKIMRTTHKRELDSDYMEPPTEAERKDILLKAHLFGHFGAEAIVKAIHNNGMHWTNLKKDALELVKKCTPCQRFNIVKTGYNPHKPIHALLPGDHWAIDLTGPLPTTEEHNAYLLVMVDICSRFVILRPIKDKTADSVVKAIIPVFCDFGIPMIVQSDNGKEFVNQVMTRFKTKAGFDHRLITPHYPQSNGSAERTVGTSKMVIKKLVDGAPEHWDICAPIAQLAINNKVSKRTNATPFSVMFGRKMNDFKNYNDEVNKQIPLSPDEIKNRVSELKNVVFPAIAEKTMQTIRKQKISFDKTHKQVDFPKGSYVMEKIHPNFRTKMDPRHEGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.08
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.07
8	0.08
9	0.09
10	0.11
11	0.11
12	0.12
13	0.12
14	0.18
15	0.19
16	0.19
17	0.21
18	0.25
19	0.25
20	0.24
21	0.26
22	0.24
23	0.23
24	0.23
25	0.23
26	0.18
27	0.17
28	0.17
29	0.14
30	0.11
31	0.11
32	0.12
33	0.11
34	0.09
35	0.11
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.14
41	0.14
42	0.15
43	0.18
44	0.18
45	0.17
46	0.17
47	0.18
48	0.18
49	0.18
50	0.19
51	0.17
52	0.2
53	0.22
54	0.28
55	0.27
56	0.3
57	0.33
58	0.37
59	0.41
60	0.39
61	0.38
62	0.42
63	0.42
64	0.4
65	0.42
66	0.38
67	0.35
68	0.32
69	0.34
70	0.25
71	0.24
72	0.26
73	0.21
74	0.24
75	0.27
76	0.28
77	0.27
78	0.28
79	0.28
80	0.27
81	0.28
82	0.29
83	0.25
84	0.26
85	0.29
86	0.26
87	0.25
88	0.26
89	0.25
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.19
94	0.2
95	0.21
96	0.2
97	0.19
98	0.17
99	0.16
100	0.14
101	0.12
102	0.11
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.12
107	0.12
108	0.11
109	0.11
110	0.13
111	0.13
112	0.16
113	0.18
114	0.19
115	0.22
116	0.29
117	0.37
118	0.39
119	0.42
120	0.44
121	0.43
122	0.41
123	0.47
124	0.43
125	0.39
126	0.38
127	0.38
128	0.34
129	0.33
130	0.32
131	0.24
132	0.19
133	0.17
134	0.15
135	0.13
136	0.15
137	0.15
138	0.16
139	0.16
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.23
144	0.21
145	0.23
146	0.24
147	0.29
148	0.33
149	0.32
150	0.31
151	0.26
152	0.27
153	0.25
154	0.23
155	0.17
156	0.14
157	0.15
158	0.19
159	0.17
160	0.16
161	0.15
162	0.14
163	0.14
164	0.15
165	0.14
166	0.11
167	0.15
168	0.2
169	0.21
170	0.22
171	0.24
172	0.3
173	0.36
174	0.38
175	0.4
176	0.44
177	0.51
178	0.57
179	0.62
180	0.58
181	0.59
182	0.62
183	0.58
184	0.56
185	0.51
186	0.47
187	0.48
188	0.45
189	0.39
190	0.38
191	0.36
192	0.33
193	0.31
194	0.28
195	0.24
196	0.25
197	0.27
198	0.25
199	0.26
200	0.23
201	0.23
202	0.23
203	0.25
204	0.25
205	0.26
206	0.31
207	0.31
208	0.32
209	0.31
210	0.31
211	0.26
212	0.24
213	0.18
214	0.11
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.09
229	0.11
230	0.13
231	0.21
232	0.31
233	0.36
234	0.44
235	0.44
236	0.44
237	0.44
238	0.45
239	0.46
240	0.38
241	0.34
242	0.28
243	0.26
244	0.25
245	0.23
246	0.2
247	0.11
248	0.1
249	0.09
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.15
267	0.23
268	0.26
269	0.28
270	0.31
271	0.3
272	0.31
273	0.35
274	0.4
275	0.36
276	0.39
277	0.4
278	0.39
279	0.39
280	0.37
281	0.31
282	0.27
283	0.22
284	0.19
285	0.16
286	0.14
287	0.13
288	0.14
289	0.15
290	0.17
291	0.2
292	0.19
293	0.2
294	0.22
295	0.22
296	0.23
297	0.27
298	0.27
299	0.28
300	0.28
301	0.3
302	0.31
303	0.34
304	0.4
305	0.41
306	0.41
307	0.4
308	0.44
309	0.47
310	0.47
311	0.5
312	0.45
313	0.46
314	0.47
315	0.51
316	0.49
317	0.51
318	0.54
319	0.53
320	0.53
321	0.51
322	0.54
323	0.5
324	0.54
325	0.49
326	0.43
327	0.41
328	0.38
329	0.36
330	0.31
331	0.36
332	0.39
333	0.39
334	0.43
335	0.44
336	0.52
337	0.52
338	0.55
339	0.49
340	0.45
341	0.45
342	0.44
343	0.43
344	0.38
345	0.38
346	0.36
347	0.33
348	0.29
349	0.34
350	0.38
351	0.36
352	0.35
353	0.38
354	0.4
355	0.42
356	0.43
357	0.46
358	0.48
359	0.57
360	0.59
361	0.56
362	0.54
363	0.59
364	0.63
365	0.57
366	0.56
367	0.53
368	0.55
369	0.57
370	0.55
371	0.51
372	0.51
373	0.53
374	0.55
375	0.57
376	0.57
377	0.59
378	0.66
379	0.71
380	0.72
381	0.75
382	0.75
383	0.74
384	0.75
385	0.73
386	0.66
387	0.62
388	0.54
389	0.44
390	0.34
391	0.25
392	0.17
393	0.13
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.12
405	0.11
406	0.1
407	0.09
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.08
413	0.1
414	0.11
415	0.14
416	0.12
417	0.16
418	0.18
419	0.19
420	0.2
421	0.23
422	0.21
423	0.18
424	0.18
425	0.15
426	0.14
427	0.13
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.08
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.15
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.1
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.11
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.14
460	0.15
461	0.16
462	0.14
463	0.12
464	0.09
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.12
469	0.12
470	0.13
471	0.15
472	0.16
473	0.19
474	0.19
475	0.2
476	0.22
477	0.25
478	0.24
479	0.22
480	0.22
481	0.16
482	0.17
483	0.17
484	0.15
485	0.12
486	0.12
487	0.11
488	0.14
489	0.14
490	0.13
491	0.18
492	0.23
493	0.27
494	0.29
495	0.29
496	0.28
497	0.33
498	0.37
499	0.33
500	0.28
501	0.26
502	0.24
503	0.25
504	0.23
505	0.17
506	0.11
507	0.1
508	0.1
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.06
513	0.1
514	0.1
515	0.15
516	0.16
517	0.16
518	0.19
519	0.21
520	0.27
521	0.25
522	0.26
523	0.24
524	0.27
525	0.28
526	0.27
527	0.26
528	0.23
529	0.26
530	0.26
531	0.26
532	0.23
533	0.22
534	0.21
535	0.21
536	0.2
537	0.16
538	0.15
539	0.12
540	0.12
541	0.13
542	0.13
543	0.11
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.06
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.07
556	0.07
557	0.14
558	0.17
559	0.19
560	0.19
561	0.21
562	0.2
563	0.21
564	0.21
565	0.14
566	0.12
567	0.11
568	0.09
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.06
573	0.08
574	0.1
575	0.15
576	0.18
577	0.19
578	0.2
579	0.23
580	0.23
581	0.25
582	0.23
583	0.23
584	0.23
585	0.24
586	0.25
587	0.24
588	0.24
589	0.2
590	0.19
591	0.14
592	0.12
593	0.08
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.09
598	0.11
599	0.1
600	0.11
601	0.15
602	0.19
603	0.22
604	0.26
605	0.26
606	0.33
607	0.36
608	0.37
609	0.36
610	0.35
611	0.34
612	0.32
613	0.3
614	0.24
615	0.22
616	0.21
617	0.18
618	0.22
619	0.23
620	0.23
621	0.25
622	0.25
623	0.24
624	0.25
625	0.25
626	0.18
627	0.17
628	0.14
629	0.11
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.1
635	0.09
636	0.1
637	0.11
638	0.12
639	0.13
640	0.12
641	0.13
642	0.1
643	0.11
644	0.11
645	0.1
646	0.08
647	0.07
648	0.07
649	0.08
650	0.1
651	0.1
652	0.1
653	0.14
654	0.19
655	0.24
656	0.32
657	0.36
658	0.35
659	0.35
660	0.34
661	0.34
662	0.38
663	0.39
664	0.39
665	0.37
666	0.39
667	0.46
668	0.48
669	0.45
670	0.43
671	0.37
672	0.3
673	0.29
674	0.26
675	0.21
676	0.19
677	0.19
678	0.13
679	0.13
680	0.15
681	0.14
682	0.13
683	0.12
684	0.11
685	0.15
686	0.17
687	0.17
688	0.16
689	0.18
690	0.18
691	0.18
692	0.18
693	0.15
694	0.12
695	0.13
696	0.12
697	0.08
698	0.07
699	0.07
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.04
709	0.04
710	0.05
711	0.05
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.1
725	0.13
726	0.18
727	0.2
728	0.24
729	0.27
730	0.31
731	0.34
732	0.35
733	0.37
734	0.34
735	0.33
736	0.3
737	0.29
738	0.26
739	0.22
740	0.19
741	0.14
742	0.14
743	0.14
744	0.13
745	0.11
746	0.11
747	0.13
748	0.14
749	0.15
750	0.16
751	0.22
752	0.29
753	0.33
754	0.41
755	0.41
756	0.4
757	0.4
758	0.37
759	0.4
760	0.37
761	0.37
762	0.32
763	0.31
764	0.29
765	0.3
766	0.3
767	0.22
768	0.23
769	0.24
770	0.22
771	0.23
772	0.23
773	0.22
774	0.24
775	0.23
776	0.19
777	0.16
778	0.15
779	0.14
780	0.15
781	0.15
782	0.13
783	0.12
784	0.1
785	0.1
786	0.12
787	0.12
788	0.14
789	0.13
790	0.14
791	0.13
792	0.13
793	0.11
794	0.09
795	0.08
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.08
800	0.08
801	0.09
802	0.09
803	0.1
804	0.1
805	0.1
806	0.13
807	0.14
808	0.16
809	0.16
810	0.2
811	0.21
812	0.21
813	0.27
814	0.26
815	0.24
816	0.23
817	0.23
818	0.18
819	0.17
820	0.17
821	0.12
822	0.13
823	0.13
824	0.12
825	0.14
826	0.16
827	0.15
828	0.18
829	0.18
830	0.18
831	0.22
832	0.25
833	0.25
834	0.3
835	0.33
836	0.34
837	0.35
838	0.33
839	0.29
840	0.29
841	0.29
842	0.25
843	0.3
844	0.34
845	0.38
846	0.47
847	0.54
848	0.53
849	0.53
850	0.58
851	0.54
852	0.51
853	0.45
854	0.38
855	0.32
856	0.31
857	0.27
858	0.21
859	0.19
860	0.19
861	0.17
862	0.18
863	0.18
864	0.19
865	0.23
866	0.25
867	0.22
868	0.24
869	0.25
870	0.24
871	0.27
872	0.25
873	0.23
874	0.2
875	0.21
876	0.15
877	0.14
878	0.13
879	0.09
880	0.09
881	0.08
882	0.09
883	0.06
884	0.07
885	0.08
886	0.11
887	0.11
888	0.11
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.19
893	0.19
894	0.2
895	0.25
896	0.25
897	0.21
898	0.2
899	0.27
900	0.31
901	0.37
902	0.35
903	0.36
904	0.41
905	0.41
906	0.43
907	0.45
908	0.45
909	0.42
910	0.47
911	0.5
912	0.54
913	0.57
914	0.65
915	0.59
916	0.57
917	0.55
918	0.58
919	0.55
920	0.54
921	0.53
922	0.44
923	0.46
924	0.43
925	0.41
926	0.38
927	0.35
928	0.3
929	0.28
930	0.31
931	0.28
932	0.27
933	0.24
934	0.19
935	0.14
936	0.13
937	0.12
938	0.08
939	0.06
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.08
944	0.08
945	0.12
946	0.15
947	0.16
948	0.16
949	0.16
950	0.16
951	0.16
952	0.16
953	0.12
954	0.09
955	0.07
956	0.07
957	0.09
958	0.09
959	0.09
960	0.08
961	0.08
962	0.08
963	0.1
964	0.19
965	0.21
966	0.29
967	0.33
968	0.37
969	0.39
970	0.42
971	0.42
972	0.36
973	0.42
974	0.36
975	0.33
976	0.33
977	0.31
978	0.29
979	0.28
980	0.25
981	0.16
982	0.16
983	0.16
984	0.13
985	0.13
986	0.12
987	0.12
988	0.11
989	0.11
990	0.09
991	0.08
992	0.09
993	0.09
994	0.09
995	0.11
996	0.13
997	0.13
998	0.14
999	0.14
1000	0.13
1001	0.15
1002	0.17
1003	0.23
1004	0.2
1005	0.21
1006	0.28
1007	0.3
1008	0.35
1009	0.34
1010	0.34
1011	0.33
1012	0.34
1013	0.41
1014	0.42
1015	0.47
1016	0.44
1017	0.51
1018	0.5
1019	0.48
1020	0.49
1021	0.45
1022	0.42
1023	0.43
1024	0.43
1025	0.37
1026	0.36
1027	0.38
1028	0.42
1029	0.4
1030	0.36
1031	0.3
1032	0.28
1033	0.28
1034	0.28
1035	0.24
1036	0.18
1037	0.16
1038	0.16
1039	0.21
1040	0.29
1041	0.3
1042	0.31
1043	0.31
1044	0.35
1045	0.39
1046	0.39
1047	0.35
1048	0.29
1049	0.29
1050	0.33
1051	0.34
1052	0.29
1053	0.23
1054	0.21
1055	0.19
1056	0.18
1057	0.18
1058	0.13
1059	0.11
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.15
1063	0.18
1064	0.22
1065	0.24
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.34
1069	0.37
1070	0.4
1071	0.44
1072	0.47
1073	0.52
1074	0.54
1075	0.58
1076	0.55
1077	0.52
1078	0.51
1079	0.47
1080	0.4
1081	0.33
1082	0.32
1083	0.3
1084	0.3
1085	0.34
1086	0.33
1087	0.37
1088	0.39
1089	0.4
1090	0.44
1091	0.46
1092	0.47
1093	0.47
1094	0.47
1095	0.44
1096	0.45
1097	0.43
1098	0.35
1099	0.34
1100	0.32
1101	0.3
1102	0.32
1103	0.31
1104	0.34
1105	0.39
1106	0.42
1107	0.41
1108	0.39
1109	0.4
1110	0.44
1111	0.41
1112	0.4
1113	0.41
1114	0.43
1115	0.45
1116	0.44
1117	0.41
1118	0.33
1119	0.31
1120	0.31
1121	0.25
1122	0.2
1123	0.17
1124	0.16
1125	0.21
1126	0.26
1127	0.3
1128	0.31
1129	0.38
1130	0.45
1131	0.53
1132	0.54
1133	0.58
1134	0.63
1135	0.67
1136	0.7
1137	0.7
1138	0.73
1139	0.71
1140	0.8
1141	0.74
1142	0.7
1143	0.7
1144	0.71
1145	0.69
1146	0.61
1147	0.6
1148	0.52
1149	0.51
1150	0.47
1151	0.41
1152	0.36
1153	0.33
1154	0.39
1155	0.37
1156	0.44
1157	0.47
1158	0.49
1159	0.51
1160	0.5
1161	0.56
1162	0.54
1163	0.6
1164	0.6

A0A163KHX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer