Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177E1M6

Protein Details
Accession A0A177E1M6    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-70MSKSKIDTPEKKRKRDAEVAEDAPKKSKKSKKADNVEDAPVDATEVKKEKKDKKDKKSKKSKDNVDTSAIHydrophilic
72-101DALEDAKKDKKEKKSKKSKKSKDADASEDABasic
129-160TEDAPAKKEKKSKKDKKDKKSKKSKDAATSEDBasic
178-210DAESKAEKKEKKKDKKEKKDKKEKKAKKAAEAABasic
376-400EVEMKQSERKQKKEAKSGKKGGDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-33EKKRKRDAEVAEDAPKKSKKSKKA
47-62KKEKKDKKDKKSKKSK
78-93KKDKKEKKSKKSKKSK
134-153AKKEKKSKKDKKDKKSKKSK
182-206KAEKKEKKKDKKEKKDKKEKKAKKA
330-336KKKEGRK
349-396SEARKTKIAAKNEKLHDERARDRVKKTEVEMKQSERKQKKEAKSGKKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG aalt:CC77DRAFT_1015220  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKSKIDTPEKKRKRDAEVAEDAPKKSKKSKKADNVEDAPVDATEVKKEKKDKKDKKSKKSKDNVDTSAIDDALEDAKKDKKEKKSKKSKKSKDADASEDAPEAELIEEMKSSENFISVNDDEPMPDATEDAPAKKEKKSKKDKKDKKSKKSKDAATSEDTPMEDAAEDASAETNGVDAESKAEKKEKKKDKKEKKDKKEKKAKKAAEAATNGETSAEEPQAEANGDAAAESAEVEVEGGEEREIEGEEAQAAIEANKGRFIVFVGNLPYSATKEQIEKHFEKIKPTEVRLRTYKGTEKFMGTCFIEFDRYDRMVTCLKKYHHSVFPDPKKKEGRKINVELSAGGGGNSEARKTKIAAKNEKLHDERARDRVKKTEVEMKQSERKQKKEAKSGKKGGDDAEAAEPEQPDEATTFGMNPARLAMMQGPERPQHRSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.82
4 0.8
5 0.79
6 0.74
7 0.73
8 0.69
9 0.61
10 0.59
11 0.55
12 0.51
13 0.52
14 0.57
15 0.58
16 0.65
17 0.75
18 0.77
19 0.84
20 0.89
21 0.89
22 0.85
23 0.79
24 0.69
25 0.59
26 0.48
27 0.37
28 0.28
29 0.2
30 0.15
31 0.16
32 0.22
33 0.24
34 0.3
35 0.4
36 0.48
37 0.58
38 0.69
39 0.74
40 0.79
41 0.88
42 0.92
43 0.94
44 0.96
45 0.95
46 0.95
47 0.94
48 0.94
49 0.93
50 0.91
51 0.84
52 0.79
53 0.69
54 0.6
55 0.52
56 0.41
57 0.3
58 0.21
59 0.17
60 0.14
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.17
65 0.22
66 0.3
67 0.37
68 0.45
69 0.56
70 0.67
71 0.76
72 0.82
73 0.88
74 0.92
75 0.95
76 0.95
77 0.95
78 0.93
79 0.92
80 0.91
81 0.86
82 0.81
83 0.75
84 0.67
85 0.57
86 0.48
87 0.37
88 0.27
89 0.21
90 0.15
91 0.09
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.15
105 0.13
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.15
120 0.19
121 0.22
122 0.27
123 0.35
124 0.39
125 0.49
126 0.6
127 0.68
128 0.74
129 0.84
130 0.89
131 0.92
132 0.94
133 0.95
134 0.94
135 0.95
136 0.94
137 0.93
138 0.92
139 0.89
140 0.87
141 0.82
142 0.75
143 0.69
144 0.63
145 0.53
146 0.45
147 0.37
148 0.27
149 0.21
150 0.16
151 0.11
152 0.07
153 0.06
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.03
166 0.06
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.17
171 0.23
172 0.31
173 0.41
174 0.5
175 0.59
176 0.69
177 0.79
178 0.84
179 0.91
180 0.94
181 0.95
182 0.95
183 0.96
184 0.95
185 0.95
186 0.95
187 0.93
188 0.92
189 0.92
190 0.85
191 0.81
192 0.8
193 0.73
194 0.68
195 0.6
196 0.52
197 0.43
198 0.38
199 0.3
200 0.21
201 0.17
202 0.1
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.13
262 0.17
263 0.23
264 0.3
265 0.29
266 0.34
267 0.41
268 0.41
269 0.45
270 0.44
271 0.46
272 0.44
273 0.47
274 0.5
275 0.45
276 0.5
277 0.48
278 0.5
279 0.44
280 0.44
281 0.48
282 0.43
283 0.45
284 0.41
285 0.39
286 0.37
287 0.35
288 0.34
289 0.27
290 0.23
291 0.19
292 0.18
293 0.18
294 0.15
295 0.16
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.2
301 0.23
302 0.26
303 0.29
304 0.3
305 0.32
306 0.37
307 0.42
308 0.46
309 0.46
310 0.5
311 0.54
312 0.58
313 0.67
314 0.71
315 0.67
316 0.68
317 0.72
318 0.73
319 0.73
320 0.73
321 0.72
322 0.72
323 0.77
324 0.75
325 0.7
326 0.65
327 0.55
328 0.46
329 0.37
330 0.27
331 0.2
332 0.13
333 0.08
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.15
340 0.17
341 0.27
342 0.32
343 0.41
344 0.5
345 0.56
346 0.64
347 0.67
348 0.74
349 0.67
350 0.67
351 0.64
352 0.61
353 0.59
354 0.6
355 0.64
356 0.61
357 0.62
358 0.63
359 0.62
360 0.6
361 0.58
362 0.59
363 0.54
364 0.58
365 0.6
366 0.59
367 0.62
368 0.64
369 0.7
370 0.69
371 0.7
372 0.71
373 0.75
374 0.78
375 0.79
376 0.83
377 0.83
378 0.85
379 0.88
380 0.86
381 0.82
382 0.75
383 0.66
384 0.61
385 0.51
386 0.43
387 0.38
388 0.31
389 0.25
390 0.25
391 0.23
392 0.18
393 0.18
394 0.14
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.13
402 0.17
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.2
411 0.24
412 0.28
413 0.31
414 0.36
415 0.39
416 0.44