FuNGI

A0A177DJ47

Protein Details

Accession

A0A177DJ47

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
446-470	NHHSVGKSGRRVKKGKQQSGLEQLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
347-354	RHKKRKGA
455-459	RRVKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	aalt:CC77DRAFT_146386 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRQFIDKKNATNFRLVHRAQNDPRIHDEDAPQMVFAETSAPNQREEDQPAGSSRASQYSSVTGRSAIKSRRDLESEYGDKVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHMRDLGSGGGDAYFVEAKAEKKGKQKMDLADMLRDASLSDSRSQADLSVSSNISSVSDFFGEDMAPSEFVRKTTYQDQQNIPDALRGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVEDDEDIFNDLTQDGYEVDQREFESTDFDNAGDDDRNPMDRFLDGDDDAGWESDDTVKAPSPRQKPASGEMPAPDEAPAPADAADLAYLDEFKKFKQDVKAAKPQNNNDAANRGIPDNQSFITGASGLTSGGRHKKRKGAKTSTSGYSMSSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEEYADDGFGNYDDMPDDASMVSGMSKMSKMSGMSGMSAWSSSEAPPLRSDFDSIMDDFLGNHHSVGKSGRRVKKGKQQSGLEQLEEVRRGLGAPRVKPQDKFSVLRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.64
3	0.65
4	0.57
5	0.56
6	0.51
7	0.59
8	0.57
9	0.64
10	0.61
11	0.56
12	0.61
13	0.57
14	0.55
15	0.49
16	0.46
17	0.43
18	0.43
19	0.38
20	0.31
21	0.27
22	0.24
23	0.2
24	0.17
25	0.14
26	0.1
27	0.15
28	0.22
29	0.23
30	0.24
31	0.26
32	0.29
33	0.3
34	0.35
35	0.34
36	0.29
37	0.29
38	0.3
39	0.31
40	0.28
41	0.26
42	0.23
43	0.24
44	0.24
45	0.23
46	0.22
47	0.26
48	0.29
49	0.28
50	0.26
51	0.24
52	0.26
53	0.29
54	0.35
55	0.35
56	0.4
57	0.46
58	0.48
59	0.51
60	0.51
61	0.51
62	0.49
63	0.51
64	0.46
65	0.42
66	0.44
67	0.41
68	0.39
69	0.38
70	0.4
71	0.33
72	0.34
73	0.38
74	0.37
75	0.39
76	0.38
77	0.4
78	0.33
79	0.31
80	0.27
81	0.19
82	0.15
83	0.12
84	0.12
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.15
90	0.2
91	0.23
92	0.24
93	0.24
94	0.25
95	0.25
96	0.25
97	0.23
98	0.18
99	0.14
100	0.12
101	0.1
102	0.07
103	0.07
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.07
109	0.08
110	0.09
111	0.17
112	0.22
113	0.25
114	0.33
115	0.42
116	0.46
117	0.51
118	0.57
119	0.54
120	0.56
121	0.57
122	0.51
123	0.45
124	0.4
125	0.33
126	0.27
127	0.22
128	0.15
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.14
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.14
164	0.14
165	0.18
166	0.24
167	0.32
168	0.35
169	0.41
170	0.44
171	0.44
172	0.48
173	0.45
174	0.38
175	0.33
176	0.27
177	0.22
178	0.2
179	0.17
180	0.12
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.18
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.21
189	0.2
190	0.18
191	0.16
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.05
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.06
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.06
258	0.08
259	0.1
260	0.14
261	0.22
262	0.26
263	0.32
264	0.35
265	0.37
266	0.39
267	0.41
268	0.44
269	0.38
270	0.35
271	0.29
272	0.29
273	0.26
274	0.23
275	0.19
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.09
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.14
295	0.15
296	0.2
297	0.27
298	0.34
299	0.41
300	0.48
301	0.58
302	0.58
303	0.65
304	0.67
305	0.63
306	0.63
307	0.61
308	0.54
309	0.46
310	0.42
311	0.36
312	0.31
313	0.28
314	0.21
315	0.17
316	0.16
317	0.16
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.11
324	0.1
325	0.09
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.1
332	0.19
333	0.27
334	0.33
335	0.37
336	0.46
337	0.55
338	0.64
339	0.71
340	0.72
341	0.73
342	0.75
343	0.76
344	0.7
345	0.64
346	0.54
347	0.45
348	0.36
349	0.28
350	0.21
351	0.18
352	0.15
353	0.15
354	0.16
355	0.15
356	0.14
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.18
363	0.18
364	0.21
365	0.2
366	0.2
367	0.19
368	0.19
369	0.18
370	0.15
371	0.18
372	0.15
373	0.19
374	0.2
375	0.18
376	0.17
377	0.16
378	0.15
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.1
401	0.11
402	0.12
403	0.16
404	0.15
405	0.16
406	0.16
407	0.16
408	0.14
409	0.13
410	0.11
411	0.09
412	0.1
413	0.09
414	0.16
415	0.18
416	0.19
417	0.22
418	0.24
419	0.26
420	0.26
421	0.28
422	0.22
423	0.23
424	0.25
425	0.22
426	0.21
427	0.17
428	0.16
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.11
433	0.11
434	0.13
435	0.13
436	0.15
437	0.21
438	0.27
439	0.33
440	0.43
441	0.52
442	0.58
443	0.64
444	0.72
445	0.77
446	0.81
447	0.81
448	0.81
449	0.79
450	0.78
451	0.82
452	0.77
453	0.67
454	0.57
455	0.51
456	0.47
457	0.41
458	0.33
459	0.22
460	0.19
461	0.19
462	0.2
463	0.24
464	0.26
465	0.28
466	0.37
467	0.47
468	0.51
469	0.55
470	0.58
471	0.61
472	0.6

A0A177DJ47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer