Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177DJA9

Protein Details
Accession A0A177DJA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSEKKRKRQEQNGERPKKKTSGBasic
52-71PSKLSFKPYKRTKILPQGESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-19KKRKRQEQNGERPKKK
440-446ARAKRRA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG aalt:CC77DRAFT_1031868  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSEKKRKRQEQNGERPKKKTSGAPQGNVRVQMVENKETLGPLLAVTPGLSMPSKLSFKPYKRTKILPQGESSELLFQSSDHPRLDYTASEEQDGSAESQLQDYIGVFDPATSKLQVVPVKRVVVRTTLRSEAQEMRDEQERLDAAVNTVTAKRAALAAEFGSKKSRKALEDRTLNAIKSGTGAEDAARTDAIAENVLQQMSSATAVMPNKDDLAAAVDSSKPRPIPNLTAEYPADVYPTDVVVGSELMTILDVKDWVQASSAGQGVNVTSKYVAKRIVKLAKNKQIQKLKVLRFILLCINFNSALFGGGGPRPKKIPMKGKLETAMGEDTPAGQIMAIRRKFAPEAGNGEMPRWNIDNLMTHIAAAALIVDDFEVDVNDLRDDLKLENKEIKQYFAELGCKLTAPTQTDLTRMKLTKAESANHFIAKLKLPLSFPRVGGARAKRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.85
3 0.81
4 0.76
5 0.69
6 0.67
7 0.67
8 0.67
9 0.69
10 0.72
11 0.74
12 0.76
13 0.75
14 0.68
15 0.58
16 0.48
17 0.4
18 0.4
19 0.37
20 0.31
21 0.28
22 0.27
23 0.27
24 0.25
25 0.24
26 0.18
27 0.13
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.1
39 0.16
40 0.19
41 0.19
42 0.27
43 0.35
44 0.41
45 0.51
46 0.59
47 0.63
48 0.67
49 0.74
50 0.75
51 0.77
52 0.8
53 0.75
54 0.69
55 0.64
56 0.6
57 0.54
58 0.45
59 0.37
60 0.28
61 0.23
62 0.18
63 0.13
64 0.18
65 0.22
66 0.25
67 0.22
68 0.23
69 0.22
70 0.25
71 0.26
72 0.2
73 0.22
74 0.25
75 0.25
76 0.25
77 0.25
78 0.23
79 0.22
80 0.21
81 0.16
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.14
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.18
102 0.22
103 0.23
104 0.27
105 0.3
106 0.34
107 0.35
108 0.36
109 0.31
110 0.35
111 0.35
112 0.34
113 0.34
114 0.34
115 0.34
116 0.32
117 0.35
118 0.34
119 0.33
120 0.33
121 0.29
122 0.29
123 0.33
124 0.32
125 0.28
126 0.25
127 0.22
128 0.19
129 0.19
130 0.17
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.2
149 0.21
150 0.22
151 0.27
152 0.3
153 0.29
154 0.36
155 0.45
156 0.47
157 0.53
158 0.54
159 0.55
160 0.52
161 0.49
162 0.41
163 0.32
164 0.23
165 0.17
166 0.15
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.04
190 0.03
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.06
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.09
209 0.1
210 0.13
211 0.15
212 0.18
213 0.22
214 0.27
215 0.26
216 0.29
217 0.28
218 0.26
219 0.24
220 0.19
221 0.16
222 0.1
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.1
258 0.11
259 0.13
260 0.2
261 0.2
262 0.24
263 0.32
264 0.4
265 0.43
266 0.52
267 0.59
268 0.62
269 0.67
270 0.7
271 0.71
272 0.7
273 0.67
274 0.67
275 0.67
276 0.62
277 0.62
278 0.57
279 0.5
280 0.42
281 0.42
282 0.38
283 0.3
284 0.27
285 0.2
286 0.22
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.12
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.16
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.24
301 0.31
302 0.37
303 0.45
304 0.47
305 0.56
306 0.57
307 0.6
308 0.58
309 0.53
310 0.45
311 0.37
312 0.31
313 0.21
314 0.19
315 0.14
316 0.12
317 0.1
318 0.1
319 0.07
320 0.05
321 0.07
322 0.11
323 0.21
324 0.21
325 0.23
326 0.23
327 0.26
328 0.27
329 0.29
330 0.28
331 0.24
332 0.29
333 0.31
334 0.35
335 0.32
336 0.33
337 0.32
338 0.28
339 0.26
340 0.22
341 0.18
342 0.14
343 0.16
344 0.19
345 0.2
346 0.23
347 0.21
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.11
353 0.07
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.18
372 0.19
373 0.23
374 0.31
375 0.32
376 0.41
377 0.4
378 0.42
379 0.36
380 0.36
381 0.36
382 0.32
383 0.34
384 0.25
385 0.27
386 0.24
387 0.23
388 0.21
389 0.21
390 0.22
391 0.22
392 0.24
393 0.28
394 0.28
395 0.34
396 0.36
397 0.37
398 0.4
399 0.37
400 0.37
401 0.36
402 0.37
403 0.4
404 0.42
405 0.44
406 0.41
407 0.47
408 0.48
409 0.45
410 0.43
411 0.37
412 0.36
413 0.34
414 0.33
415 0.28
416 0.28
417 0.3
418 0.36
419 0.41
420 0.41
421 0.37
422 0.38
423 0.39
424 0.37
425 0.43
426 0.46