Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177DVA1

Protein Details
Accession A0A177DVA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-254SDTATRRGRKRSRSPENDHVEGHydrophilic
451-476KSYRGGGRKWNSKGKGKYGRNGYSKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-243GRKR
443-475NRKDGDREKSYRGGGRKWNSKGKGKYGRNGYSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.166, cyto_mito 9.999, cyto 9.5, mito_nucl 9.499, mito 9, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG aalt:CC77DRAFT_1017951  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MTTPPKESRKVLEGIFAINKPQWASSAGVLRDLQDHFSRSPIFAPWLEAQKRSLIIADAKPKHLKNIKAKLGHGGTLDPMATGVLIVGTGKGTKCLQRFLECTKTYECVVLFGAATDSYDAVGKVVSKADYEHVTKELVEEKLAQFRGKIMQKPSVFSALKVDGKKMYEYAREGKDIPEVAARPVEVEELELVEWLEPGSHDFAWPKEEVDGAEMEGAKKLMGIRKEDAKVYSDTATRRGRKRSRSPENDHVEGAGQQPKILKKDSEHAMSGALPTEEASPDAASAENNAMEVSAEAPVSIKEKATASVEQAEAAEDPSTTQKPDIEATKTTTSAAISTSTAQPPAARLRMTVTSGFYVRSLCHDLGLACNSLGLMSSLIRSRQGDYTLGQNVLEYSDLEDPSKWEPQLQEQLEKFMEKENWEVEELDDDESWEARKKELMENRKDGDREKSYRGGGRKWNSKGKGKYGRNGYSKNMDGGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.36
4 0.33
5 0.29
6 0.31
7 0.25
8 0.24
9 0.21
10 0.18
11 0.2
12 0.21
13 0.28
14 0.26
15 0.29
16 0.28
17 0.28
18 0.3
19 0.28
20 0.28
21 0.24
22 0.27
23 0.24
24 0.28
25 0.28
26 0.25
27 0.26
28 0.24
29 0.25
30 0.22
31 0.27
32 0.27
33 0.35
34 0.37
35 0.36
36 0.35
37 0.35
38 0.35
39 0.31
40 0.27
41 0.21
42 0.24
43 0.29
44 0.38
45 0.37
46 0.42
47 0.49
48 0.48
49 0.55
50 0.56
51 0.59
52 0.59
53 0.66
54 0.69
55 0.68
56 0.68
57 0.67
58 0.63
59 0.56
60 0.46
61 0.37
62 0.29
63 0.24
64 0.23
65 0.14
66 0.11
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.06
77 0.06
78 0.09
79 0.12
80 0.18
81 0.2
82 0.27
83 0.3
84 0.34
85 0.39
86 0.43
87 0.51
88 0.46
89 0.47
90 0.44
91 0.42
92 0.37
93 0.35
94 0.28
95 0.19
96 0.19
97 0.16
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.17
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.2
125 0.16
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.22
130 0.24
131 0.22
132 0.18
133 0.19
134 0.26
135 0.29
136 0.33
137 0.3
138 0.37
139 0.38
140 0.4
141 0.41
142 0.41
143 0.36
144 0.31
145 0.32
146 0.29
147 0.33
148 0.31
149 0.31
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.24
157 0.29
158 0.29
159 0.29
160 0.29
161 0.28
162 0.28
163 0.24
164 0.21
165 0.18
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.1
209 0.12
210 0.15
211 0.17
212 0.23
213 0.24
214 0.25
215 0.25
216 0.24
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.18
221 0.17
222 0.23
223 0.29
224 0.33
225 0.37
226 0.45
227 0.5
228 0.57
229 0.67
230 0.71
231 0.74
232 0.78
233 0.81
234 0.81
235 0.8
236 0.72
237 0.62
238 0.51
239 0.41
240 0.32
241 0.26
242 0.21
243 0.14
244 0.13
245 0.16
246 0.18
247 0.2
248 0.21
249 0.2
250 0.17
251 0.24
252 0.28
253 0.28
254 0.26
255 0.24
256 0.23
257 0.21
258 0.2
259 0.14
260 0.09
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.14
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.05
304 0.06
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.16
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.25
316 0.26
317 0.25
318 0.24
319 0.22
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.11
324 0.09
325 0.11
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.15
332 0.2
333 0.22
334 0.18
335 0.18
336 0.21
337 0.24
338 0.26
339 0.25
340 0.21
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.17
345 0.15
346 0.13
347 0.16
348 0.19
349 0.17
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.21
355 0.17
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.09
366 0.1
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.19
371 0.21
372 0.21
373 0.2
374 0.25
375 0.26
376 0.25
377 0.22
378 0.19
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.1
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.19
390 0.23
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.29
395 0.38
396 0.39
397 0.44
398 0.4
399 0.44
400 0.42
401 0.41
402 0.34
403 0.3
404 0.31
405 0.24
406 0.27
407 0.25
408 0.26
409 0.26
410 0.27
411 0.21
412 0.21
413 0.2
414 0.19
415 0.16
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.15
420 0.17
421 0.17
422 0.16
423 0.2
424 0.22
425 0.31
426 0.41
427 0.49
428 0.53
429 0.6
430 0.63
431 0.66
432 0.64
433 0.59
434 0.58
435 0.58
436 0.54
437 0.53
438 0.55
439 0.54
440 0.59
441 0.61
442 0.6
443 0.61
444 0.65
445 0.68
446 0.7
447 0.75
448 0.76
449 0.8
450 0.8
451 0.8
452 0.82
453 0.8
454 0.8
455 0.8
456 0.82
457 0.81
458 0.78
459 0.74
460 0.71
461 0.66
462 0.63