FuNGI

A0A177DLH6

Protein Details

Accession

A0A177DLH6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
486-509	DYDLPKDKTKYPNGKPRKAGNGKE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_mito 8.5, pero 4, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018606 Arb1 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0033167 C:ARC complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	aalt:CC77DRAFT_1020756 -
Pfam	View protein in Pfam PF09692 Arb1 PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd08029 LA_like_fungal

Amino Acid Sequences

MATAITAPIVDAGPTDEASSNSTATSAIEDHPDGAEIRRQVEFYFSDENLPTDKHLLQCCGGRENLPVSISRIRGFQRMRQYKPKTLVTAALRLSAFLEVSADGKTIKRKVPLTGKNILDPDYFDAEDDDDIAYAPGSRKAKAQQPAQYPVPLLPQTKAKYPEGVSKNMLKATGFEKAYIEPVLTPVEAAEEEEMYALTKPFVERIEIAIQRFKQKRRMHEMYAHVFNKLMRFGGVESGPRMYQGLSKHEMNEMGPEELARALAVHNVPWDRSNENKWVVDFVALCKAFLSSWYPAHYGYASYAIKNACQVPRSFLGYLRFHRVCPEFDDQLATALQICDQAEQELPKVNSLGLALPGDFNKSASVLFGGAQAGMYTGNKSWAEDLKKEGLAVVEIGIRDEEARIKFGTGIAVLGSEAQYDMFESGQLKVLGKDTAYLEVTAINLPDNDTKSAYAEQSEAFKHKLGQLGPLGKLSCKTWHTDDCDDYDLPKDKTKYPNGKPRKAGNGKEYEFWIEESILEDCFVGLKMDATILLLSGGLTILDDIKETMCSFYTWIPNELWMERKPKEVRWLKKGLGLDEDEDEVEILGGNKASADKDASDDDFDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.12
3	0.12
4	0.13
5	0.16
6	0.17
7	0.15
8	0.14
9	0.14
10	0.12
11	0.11
12	0.13
13	0.12
14	0.12
15	0.15
16	0.16
17	0.16
18	0.16
19	0.17
20	0.16
21	0.16
22	0.2
23	0.18
24	0.2
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.24
29	0.23
30	0.23
31	0.26
32	0.24
33	0.27
34	0.27
35	0.28
36	0.25
37	0.25
38	0.22
39	0.21
40	0.23
41	0.25
42	0.27
43	0.29
44	0.3
45	0.34
46	0.35
47	0.35
48	0.33
49	0.29
50	0.29
51	0.29
52	0.28
53	0.25
54	0.23
55	0.24
56	0.28
57	0.29
58	0.26
59	0.29
60	0.28
61	0.36
62	0.39
63	0.41
64	0.47
65	0.54
66	0.61
67	0.67
68	0.72
69	0.73
70	0.76
71	0.76
72	0.69
73	0.62
74	0.62
75	0.56
76	0.55
77	0.47
78	0.43
79	0.36
80	0.32
81	0.3
82	0.23
83	0.19
84	0.11
85	0.11
86	0.07
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.11
92	0.17
93	0.22
94	0.26
95	0.32
96	0.34
97	0.42
98	0.52
99	0.58
100	0.58
101	0.61
102	0.59
103	0.57
104	0.56
105	0.5
106	0.4
107	0.33
108	0.3
109	0.25
110	0.23
111	0.18
112	0.18
113	0.16
114	0.15
115	0.14
116	0.1
117	0.06
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.08
123	0.13
124	0.15
125	0.15
126	0.19
127	0.24
128	0.32
129	0.38
130	0.45
131	0.47
132	0.52
133	0.58
134	0.57
135	0.54
136	0.47
137	0.4
138	0.38
139	0.34
140	0.28
141	0.23
142	0.28
143	0.29
144	0.34
145	0.38
146	0.33
147	0.35
148	0.36
149	0.44
150	0.4
151	0.42
152	0.39
153	0.4
154	0.41
155	0.37
156	0.35
157	0.26
158	0.24
159	0.22
160	0.25
161	0.21
162	0.19
163	0.19
164	0.19
165	0.21
166	0.19
167	0.16
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.07
174	0.08
175	0.07
176	0.08
177	0.07
178	0.05
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.14
193	0.21
194	0.22
195	0.23
196	0.26
197	0.27
198	0.35
199	0.4
200	0.41
201	0.44
202	0.47
203	0.55
204	0.6
205	0.65
206	0.62
207	0.63
208	0.66
209	0.63
210	0.65
211	0.56
212	0.46
213	0.41
214	0.36
215	0.3
216	0.23
217	0.17
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.12
225	0.13
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.09
230	0.11
231	0.13
232	0.17
233	0.2
234	0.21
235	0.21
236	0.22
237	0.23
238	0.19
239	0.19
240	0.15
241	0.12
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.08
246	0.08
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.11
257	0.13
258	0.13
259	0.16
260	0.19
261	0.22
262	0.25
263	0.26
264	0.24
265	0.24
266	0.22
267	0.2
268	0.17
269	0.12
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.13
274	0.13
275	0.12
276	0.12
277	0.15
278	0.1
279	0.11
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.14
285	0.11
286	0.09
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.14
294	0.17
295	0.13
296	0.15
297	0.15
298	0.16
299	0.18
300	0.21
301	0.2
302	0.2
303	0.24
304	0.27
305	0.28
306	0.33
307	0.31
308	0.28
309	0.32
310	0.31
311	0.27
312	0.28
313	0.3
314	0.23
315	0.23
316	0.24
317	0.2
318	0.19
319	0.17
320	0.12
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.13
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.12
369	0.17
370	0.2
371	0.21
372	0.24
373	0.24
374	0.24
375	0.24
376	0.22
377	0.17
378	0.14
379	0.12
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.1
389	0.09
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.09
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.05
409	0.04
410	0.05
411	0.06
412	0.07
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.14
418	0.14
419	0.13
420	0.14
421	0.12
422	0.14
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.1
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.12
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.15
438	0.17
439	0.19
440	0.18
441	0.15
442	0.15
443	0.14
444	0.16
445	0.18
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.19
450	0.2
451	0.24
452	0.22
453	0.25
454	0.28
455	0.31
456	0.31
457	0.33
458	0.31
459	0.26
460	0.27
461	0.24
462	0.24
463	0.22
464	0.25
465	0.28
466	0.34
467	0.4
468	0.43
469	0.44
470	0.41
471	0.43
472	0.39
473	0.34
474	0.34
475	0.33
476	0.3
477	0.34
478	0.33
479	0.36
480	0.44
481	0.54
482	0.58
483	0.62
484	0.71
485	0.75
486	0.81
487	0.82
488	0.82
489	0.82
490	0.81
491	0.79
492	0.77
493	0.77
494	0.7
495	0.65
496	0.59
497	0.52
498	0.43
499	0.37
500	0.29
501	0.19
502	0.17
503	0.17
504	0.15
505	0.12
506	0.11
507	0.09
508	0.07
509	0.08
510	0.08
511	0.07
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.09
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.12
539	0.17
540	0.24
541	0.25
542	0.27
543	0.26
544	0.28
545	0.31
546	0.32
547	0.32
548	0.3
549	0.35
550	0.34
551	0.43
552	0.44
553	0.46
554	0.55
555	0.6
556	0.64
557	0.66
558	0.73
559	0.66
560	0.67
561	0.66
562	0.58
563	0.54
564	0.47
565	0.4
566	0.34
567	0.33
568	0.27
569	0.23
570	0.19
571	0.13
572	0.1
573	0.09
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.08
579	0.09
580	0.1
581	0.11
582	0.13
583	0.13
584	0.16
585	0.2
586	0.21
587	0.22

A0A177DLH6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer