Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177D7N6

Protein Details
Accession A0A177D7N6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MIKAVKPKNARAKRAMAKREPQQNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-18KPKNARAKRAMAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG aalt:CC77DRAFT_1099466  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIKAVKPKNARAKRAMAKREPQQNENPKTTLFVSGQKTSQILKLAVADICTIKRPFIERFTKKNDIHPFDDASSLEFFSQKNDTSLLVLSLHSKKRPHCLTLARTFSYKMLDMLELYINAETFRTLQQFKNKKPSIGLKPLISFHGTVFEDPNQTKYTLAKSLFIDLFKGQDATEVDVEGLQYLISISAEEPTDALPNPQIKLRFYLLRTKRSGQKLPRIEVEEMGPRMDFALGREMFPDPDMLKESLKKPKGAEPRTKKNIDTDIMGDKTGKIHVGKQDFANLQTRKMKGLKRGRNEDEDEEVGVEDTASEGDDEEKTPKKVRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.81
4 0.8
5 0.81
6 0.84
7 0.79
8 0.76
9 0.77
10 0.77
11 0.75
12 0.72
13 0.65
14 0.55
15 0.52
16 0.47
17 0.41
18 0.33
19 0.33
20 0.33
21 0.35
22 0.35
23 0.34
24 0.34
25 0.31
26 0.31
27 0.28
28 0.23
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.16
36 0.16
37 0.2
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.32
44 0.42
45 0.45
46 0.52
47 0.61
48 0.68
49 0.66
50 0.7
51 0.71
52 0.67
53 0.63
54 0.58
55 0.53
56 0.44
57 0.44
58 0.35
59 0.27
60 0.21
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.14
77 0.2
78 0.23
79 0.26
80 0.3
81 0.32
82 0.41
83 0.46
84 0.44
85 0.45
86 0.5
87 0.54
88 0.58
89 0.61
90 0.53
91 0.49
92 0.47
93 0.4
94 0.34
95 0.27
96 0.18
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.1
112 0.13
113 0.16
114 0.26
115 0.35
116 0.4
117 0.5
118 0.5
119 0.48
120 0.5
121 0.55
122 0.53
123 0.54
124 0.52
125 0.43
126 0.43
127 0.43
128 0.4
129 0.32
130 0.24
131 0.15
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.17
138 0.16
139 0.18
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.18
153 0.13
154 0.14
155 0.11
156 0.11
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.06
167 0.05
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.19
190 0.22
191 0.23
192 0.24
193 0.33
194 0.37
195 0.43
196 0.46
197 0.47
198 0.52
199 0.55
200 0.62
201 0.59
202 0.63
203 0.63
204 0.62
205 0.63
206 0.59
207 0.53
208 0.45
209 0.4
210 0.35
211 0.29
212 0.26
213 0.2
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.07
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.1
228 0.12
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.21
233 0.26
234 0.34
235 0.37
236 0.38
237 0.37
238 0.45
239 0.53
240 0.58
241 0.63
242 0.63
243 0.71
244 0.77
245 0.78
246 0.71
247 0.67
248 0.65
249 0.56
250 0.49
251 0.42
252 0.39
253 0.36
254 0.35
255 0.29
256 0.22
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.14
261 0.18
262 0.26
263 0.3
264 0.32
265 0.32
266 0.39
267 0.37
268 0.38
269 0.43
270 0.36
271 0.38
272 0.42
273 0.42
274 0.41
275 0.46
276 0.49
277 0.5
278 0.6
279 0.63
280 0.67
281 0.76
282 0.76
283 0.77
284 0.77
285 0.71
286 0.66
287 0.58
288 0.48
289 0.39
290 0.32
291 0.25
292 0.19
293 0.14
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.09
302 0.1
303 0.15
304 0.21
305 0.25