Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177DH04

Protein Details
Accession A0A177DH04    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-189MASLPRYKNKDRRKQPSGPAPIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
451-464RGRGRGDARERGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.333, nucl 9, cyto_mito 7.666, cyto 7.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG aalt:CC77DRAFT_1010278  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTLPNARVVRLTNVPYDVAEEDIRQLFGSCVVVDQIRTIDPQVGTNSSVYVLFSTVQDSNAVVERYGDLYIDGHRVNTMLAPTGNYSFNASQEGFARPRDTDTASAAAESLSTALNRTISNILALGITREKGARVQQEQQESIREERSRADYTNEQVIRRVLMERMMASLPRYKNKDRRKQPSGPAPIKHVVPAPDLQNRQDPRNRVLLITDLPTEADNDAVMTFLQEYRPESIDRTQIGGNWMVSALVLMQTTKGRDWAVKNLSGGMIQGQRVTVQTFSNLTQDVLDRIMNPEASVPDANANSPGRSRIARSTVPPAAKAPYVPFGSPPAQAPVASAPSTSYLPFGSSNPLPAASAAPKPSAIASILGDKTPNQESPQAPSDRTHEDTRGRRDQIAAGNQGVVVASQNRRNNFWTNLDHVTRERAEEQDPAADRVSPEDARSRSHSSQNRGRGRGDARERGRGNRPGGFDGLSRDEAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.31
4 0.26
5 0.22
6 0.2
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.19
11 0.16
12 0.16
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.18
27 0.17
28 0.2
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.17
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.14
54 0.13
55 0.09
56 0.1
57 0.12
58 0.15
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.15
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.19
80 0.24
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.2
85 0.23
86 0.25
87 0.25
88 0.22
89 0.23
90 0.24
91 0.21
92 0.21
93 0.18
94 0.14
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.07
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.18
120 0.23
121 0.26
122 0.34
123 0.38
124 0.43
125 0.45
126 0.43
127 0.42
128 0.38
129 0.36
130 0.34
131 0.3
132 0.26
133 0.27
134 0.31
135 0.29
136 0.28
137 0.3
138 0.28
139 0.3
140 0.38
141 0.37
142 0.32
143 0.31
144 0.3
145 0.26
146 0.23
147 0.22
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.12
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.19
157 0.2
158 0.25
159 0.31
160 0.37
161 0.46
162 0.57
163 0.66
164 0.69
165 0.77
166 0.79
167 0.82
168 0.82
169 0.83
170 0.82
171 0.78
172 0.7
173 0.65
174 0.59
175 0.51
176 0.44
177 0.36
178 0.27
179 0.22
180 0.23
181 0.21
182 0.25
183 0.26
184 0.26
185 0.31
186 0.31
187 0.35
188 0.37
189 0.37
190 0.34
191 0.4
192 0.38
193 0.31
194 0.3
195 0.27
196 0.23
197 0.21
198 0.19
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.08
204 0.07
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.15
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.14
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.12
245 0.14
246 0.21
247 0.23
248 0.24
249 0.24
250 0.24
251 0.23
252 0.2
253 0.18
254 0.13
255 0.11
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.18
296 0.19
297 0.24
298 0.26
299 0.28
300 0.34
301 0.37
302 0.37
303 0.35
304 0.32
305 0.28
306 0.26
307 0.24
308 0.19
309 0.19
310 0.2
311 0.19
312 0.18
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.21
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.17
321 0.15
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.09
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.17
337 0.16
338 0.17
339 0.15
340 0.14
341 0.16
342 0.14
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.16
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.18
362 0.24
363 0.24
364 0.3
365 0.37
366 0.36
367 0.34
368 0.35
369 0.37
370 0.36
371 0.39
372 0.37
373 0.35
374 0.41
375 0.48
376 0.54
377 0.59
378 0.56
379 0.53
380 0.52
381 0.51
382 0.5
383 0.49
384 0.44
385 0.35
386 0.33
387 0.31
388 0.29
389 0.23
390 0.15
391 0.1
392 0.12
393 0.15
394 0.22
395 0.28
396 0.3
397 0.33
398 0.38
399 0.42
400 0.42
401 0.45
402 0.42
403 0.43
404 0.48
405 0.46
406 0.45
407 0.41
408 0.42
409 0.36
410 0.35
411 0.32
412 0.28
413 0.28
414 0.28
415 0.28
416 0.29
417 0.3
418 0.28
419 0.27
420 0.25
421 0.23
422 0.23
423 0.27
424 0.21
425 0.21
426 0.27
427 0.28
428 0.31
429 0.37
430 0.42
431 0.42
432 0.51
433 0.56
434 0.58
435 0.65
436 0.71
437 0.75
438 0.71
439 0.68
440 0.66
441 0.64
442 0.65
443 0.65
444 0.64
445 0.6
446 0.66
447 0.68
448 0.67
449 0.7
450 0.68
451 0.65
452 0.61
453 0.6
454 0.54
455 0.53
456 0.47
457 0.4
458 0.37
459 0.37