Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177DTT5

Protein Details
Accession A0A177DTT5    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-125ELQKGRKNPSPVKRPRPPMSLHydrophilic
307-332EEELKVMFKTKRKKRKSDGTIEDDAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-120GRKNPSPVKRPR
316-322TKRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG aalt:CC77DRAFT_931696  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MADSLKIESRPIPAFYCCYLLRSKNRKAFYIGSTPNPARRLGQHNGSSKGGAKRTSMQGKRPWEMTCIVTGFPSRFAALQFEWAWQNTHATRHIERDVRDARLEELQKGRKNPSPVKRPRPPMSLEARLKNLHHLLGVGSFSRWPLHIRFFAQDVFTQWEKHISKMKTTLRKDITIRVTPAELPKLAPDVQSEMRTHFIPEIIRAIPVAYEDCKTHVEKSKMMLGDDQKRVCAVCKEDVSPDTSLVLVCPVETCHVVSHMACMSQKFLAEESNIDAFIPVQGTCPSCRSSLRWSDLMKELSLRMYGEEELKVMFKTKRKKRKSDGTIEDDAEEFPDIDDLDVNLDEDLDETWVENVNDDEDKPQGSNTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.34
4 0.29
5 0.29
6 0.33
7 0.38
8 0.46
9 0.52
10 0.6
11 0.63
12 0.67
13 0.67
14 0.67
15 0.64
16 0.59
17 0.6
18 0.54
19 0.51
20 0.56
21 0.55
22 0.55
23 0.51
24 0.47
25 0.39
26 0.42
27 0.44
28 0.42
29 0.48
30 0.5
31 0.54
32 0.57
33 0.56
34 0.51
35 0.49
36 0.49
37 0.44
38 0.39
39 0.36
40 0.37
41 0.45
42 0.54
43 0.53
44 0.55
45 0.59
46 0.64
47 0.65
48 0.62
49 0.54
50 0.47
51 0.44
52 0.38
53 0.34
54 0.27
55 0.23
56 0.21
57 0.22
58 0.19
59 0.18
60 0.18
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.17
65 0.15
66 0.2
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.21
71 0.22
72 0.18
73 0.23
74 0.19
75 0.22
76 0.24
77 0.27
78 0.29
79 0.32
80 0.38
81 0.38
82 0.37
83 0.43
84 0.43
85 0.4
86 0.4
87 0.36
88 0.31
89 0.33
90 0.34
91 0.29
92 0.33
93 0.37
94 0.4
95 0.43
96 0.46
97 0.44
98 0.5
99 0.55
100 0.57
101 0.61
102 0.67
103 0.73
104 0.77
105 0.82
106 0.8
107 0.77
108 0.71
109 0.68
110 0.65
111 0.65
112 0.61
113 0.56
114 0.53
115 0.5
116 0.46
117 0.43
118 0.37
119 0.28
120 0.22
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.12
133 0.16
134 0.18
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.23
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.19
143 0.18
144 0.17
145 0.15
146 0.23
147 0.22
148 0.24
149 0.31
150 0.27
151 0.29
152 0.36
153 0.44
154 0.45
155 0.47
156 0.53
157 0.48
158 0.52
159 0.5
160 0.49
161 0.48
162 0.41
163 0.4
164 0.32
165 0.29
166 0.26
167 0.26
168 0.2
169 0.15
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.17
203 0.24
204 0.25
205 0.26
206 0.28
207 0.32
208 0.3
209 0.3
210 0.3
211 0.28
212 0.34
213 0.37
214 0.35
215 0.3
216 0.29
217 0.29
218 0.27
219 0.25
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.23
224 0.25
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.2
229 0.15
230 0.13
231 0.12
232 0.09
233 0.09
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.06
267 0.07
268 0.09
269 0.11
270 0.13
271 0.15
272 0.17
273 0.18
274 0.2
275 0.23
276 0.29
277 0.36
278 0.4
279 0.44
280 0.43
281 0.45
282 0.49
283 0.47
284 0.4
285 0.32
286 0.28
287 0.24
288 0.23
289 0.19
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.13
299 0.16
300 0.2
301 0.25
302 0.35
303 0.46
304 0.56
305 0.65
306 0.76
307 0.81
308 0.87
309 0.9
310 0.91
311 0.9
312 0.87
313 0.83
314 0.73
315 0.64
316 0.53
317 0.43
318 0.33
319 0.24
320 0.16
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.15
348 0.17
349 0.16