FuNGI

A0A177WG46

Protein Details

Accession

A0A177WG46

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
317-341	RQSSPKFFSKKPRSNNQDRSRNNQS	Hydrophilic
849-872	SSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 6, cysk 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSLYVNEQEVMSPGSQQVKIAEGLIITVLTQDNYTVWANQMEAALETLDLWESHIIGELPEKIERDYKLKEFKARGILQATVSSKFKFMLCDSNGVQLDARKIWVGLKNHYVDYCERSLTRSEEAMANLQYDPRKGVEELYNTMTSLRHKIAAANIFWGEKVFASRVMAKLVSKSREWRYFEGHTVRWTDEMLSPNKFLSELIEEEIKLINMGALPRHGVDDTIYEANYASRNHRNLRKGSTSHGPNAHGAKQGNSSRDDYFAANHEMDNYYRREQGRRPYEQRNDDQDRMPACHNCGNIGHYAKDCRPAPRNSNYRQSSPKFFSKKPRSNNQDRSRNNQSADGMFVAMDDKKRDVVIDEACSSIDRSDMFILDSGASSHMVTGLFPIQLGNVLVVPTFGVNLISENILEDKGCRISIFKKVRTIRKSNGEVIMTTRRDGGVNAVNCEAIISDEERAMAHATVIATANHASEVFRKPTDTAGWHKRLGHINVESIKNLADKSEGLDIIPGKTKERSQCVACIKGKAVRHPFPKTSTHVATQVNVLLHMDLEGPFHDTALGGYKYYLIIVDDYSRYSHLYPMISKDQTFQRFKEHVAAVELSKGLPVRAIRTDNGGEFTSSAFQQFLKLKGIAVQRTTPYTPQQNGVAERKNRTIVSAVRAMFAGCKLGREFWAEAAMTAVYLQNRSPNKALSQRTPYELWTGELPKVMHLRTFGCAAYALRPKQLLTKLDTRTRSNDTVTKGHHYLRIATIYAGGVTPSVPIAIDNVVSPKTSETPGNPDCASTPIGGESEPGRRQVPRVVPTARNTARMTVADRGTEVTTSDERITQEELLGRGISRNKAIKTSLNESSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAVQERPVDVMNRDRATMAAPTESTVTADYPGAISETADASEPSIQAAVEQRMVEDLPTNTSQDDSDLEESDQYYSYTHGSGTMAVISNGSSKEHLCPETWQQAMMSSDADLWNAVKLVLHYVQGTLSYALELGGTNASLSGYSDADWAGDVKTRKSTSGYLCYVGNALVSWRSSKQTCVAVSTMEAEYTAAESASRELLFLRDLLGELGFEQDGPTTLYCDSQSAISNMIGPSVVHEATKHIGIKINALRDRISQGLIKPEYIGTKDQVADILTKGLPRPAFEQFVNLLGLRECSRRGGVLDIGNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.21
4	0.21
5	0.21
6	0.21
7	0.21
8	0.18
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.1
13	0.07
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.11
21	0.13
22	0.12
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.16
28	0.13
29	0.12
30	0.12
31	0.11
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.07
37	0.08
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.1
42	0.1
43	0.09
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.18
48	0.19
49	0.2
50	0.25
51	0.27
52	0.3
53	0.34
54	0.4
55	0.47
56	0.52
57	0.59
58	0.58
59	0.62
60	0.66
61	0.62
62	0.6
63	0.53
64	0.5
65	0.43
66	0.45
67	0.4
68	0.35
69	0.34
70	0.29
71	0.27
72	0.26
73	0.25
74	0.23
75	0.24
76	0.29
77	0.29
78	0.34
79	0.34
80	0.41
81	0.4
82	0.37
83	0.35
84	0.28
85	0.3
86	0.25
87	0.25
88	0.18
89	0.18
90	0.22
91	0.28
92	0.29
93	0.31
94	0.38
95	0.4
96	0.41
97	0.42
98	0.39
99	0.36
100	0.37
101	0.34
102	0.3
103	0.27
104	0.27
105	0.3
106	0.31
107	0.31
108	0.26
109	0.26
110	0.25
111	0.27
112	0.29
113	0.25
114	0.23
115	0.2
116	0.23
117	0.23
118	0.21
119	0.21
120	0.18
121	0.21
122	0.2
123	0.24
124	0.26
125	0.29
126	0.31
127	0.34
128	0.33
129	0.3
130	0.31
131	0.28
132	0.24
133	0.25
134	0.23
135	0.21
136	0.21
137	0.23
138	0.3
139	0.34
140	0.31
141	0.3
142	0.29
143	0.27
144	0.26
145	0.24
146	0.18
147	0.12
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.15
152	0.18
153	0.19
154	0.21
155	0.23
156	0.21
157	0.27
158	0.32
159	0.33
160	0.33
161	0.39
162	0.46
163	0.53
164	0.57
165	0.55
166	0.54
167	0.55
168	0.6
169	0.59
170	0.52
171	0.48
172	0.45
173	0.42
174	0.36
175	0.32
176	0.26
177	0.24
178	0.27
179	0.27
180	0.27
181	0.27
182	0.26
183	0.25
184	0.23
185	0.19
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.17
191	0.17
192	0.18
193	0.18
194	0.15
195	0.11
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.14
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.14
215	0.16
216	0.16
217	0.18
218	0.24
219	0.3
220	0.38
221	0.46
222	0.52
223	0.55
224	0.61
225	0.64
226	0.58
227	0.58
228	0.59
229	0.57
230	0.56
231	0.54
232	0.49
233	0.45
234	0.47
235	0.44
236	0.4
237	0.36
238	0.31
239	0.35
240	0.37
241	0.36
242	0.35
243	0.35
244	0.31
245	0.32
246	0.31
247	0.24
248	0.21
249	0.22
250	0.22
251	0.2
252	0.18
253	0.18
254	0.18
255	0.18
256	0.2
257	0.21
258	0.2
259	0.25
260	0.27
261	0.31
262	0.36
263	0.45
264	0.51
265	0.56
266	0.61
267	0.66
268	0.73
269	0.75
270	0.77
271	0.76
272	0.74
273	0.68
274	0.63
275	0.58
276	0.5
277	0.45
278	0.42
279	0.34
280	0.3
281	0.31
282	0.29
283	0.26
284	0.25
285	0.24
286	0.25
287	0.25
288	0.23
289	0.21
290	0.26
291	0.25
292	0.32
293	0.32
294	0.34
295	0.39
296	0.44
297	0.5
298	0.55
299	0.62
300	0.6
301	0.68
302	0.65
303	0.65
304	0.67
305	0.64
306	0.62
307	0.59
308	0.63
309	0.59
310	0.61
311	0.66
312	0.68
313	0.72
314	0.73
315	0.78
316	0.78
317	0.82
318	0.88
319	0.87
320	0.86
321	0.81
322	0.8
323	0.79
324	0.75
325	0.65
326	0.58
327	0.5
328	0.4
329	0.38
330	0.3
331	0.2
332	0.15
333	0.13
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.15
344	0.17
345	0.18
346	0.19
347	0.18
348	0.18
349	0.18
350	0.17
351	0.13
352	0.11
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.08
400	0.09
401	0.08
402	0.1
403	0.12
404	0.23
405	0.3
406	0.32
407	0.4
408	0.47
409	0.56
410	0.62
411	0.66
412	0.64
413	0.65
414	0.66
415	0.61
416	0.59
417	0.5
418	0.43
419	0.39
420	0.4
421	0.31
422	0.27
423	0.23
424	0.19
425	0.19
426	0.18
427	0.18
428	0.17
429	0.17
430	0.19
431	0.18
432	0.18
433	0.17
434	0.17
435	0.13
436	0.07
437	0.06
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.09
459	0.13
460	0.15
461	0.15
462	0.16
463	0.16
464	0.18
465	0.2
466	0.2
467	0.25
468	0.31
469	0.35
470	0.37
471	0.37
472	0.4
473	0.43
474	0.41
475	0.39
476	0.31
477	0.31
478	0.33
479	0.33
480	0.28
481	0.22
482	0.21
483	0.16
484	0.15
485	0.11
486	0.08
487	0.07
488	0.08
489	0.1
490	0.1
491	0.09
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.15
496	0.14
497	0.13
498	0.15
499	0.19
500	0.22
501	0.27
502	0.29
503	0.27
504	0.34
505	0.37
506	0.43
507	0.4
508	0.37
509	0.33
510	0.35
511	0.35
512	0.35
513	0.39
514	0.38
515	0.43
516	0.47
517	0.48
518	0.47
519	0.5
520	0.47
521	0.45
522	0.4
523	0.35
524	0.36
525	0.33
526	0.3
527	0.26
528	0.24
529	0.18
530	0.15
531	0.13
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.04
537	0.05
538	0.05
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.1
546	0.1
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.08
561	0.09
562	0.09
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.12
567	0.15
568	0.2
569	0.2
570	0.19
571	0.21
572	0.25
573	0.31
574	0.33
575	0.29
576	0.32
577	0.32
578	0.33
579	0.36
580	0.3
581	0.24
582	0.23
583	0.23
584	0.16
585	0.16
586	0.15
587	0.09
588	0.09
589	0.08
590	0.06
591	0.07
592	0.07
593	0.09
594	0.12
595	0.14
596	0.14
597	0.17
598	0.18
599	0.16
600	0.18
601	0.16
602	0.13
603	0.11
604	0.11
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.06
609	0.06
610	0.1
611	0.11
612	0.13
613	0.15
614	0.15
615	0.14
616	0.19
617	0.23
618	0.21
619	0.21
620	0.22
621	0.2
622	0.23
623	0.24
624	0.21
625	0.21
626	0.24
627	0.23
628	0.23
629	0.25
630	0.24
631	0.27
632	0.3
633	0.33
634	0.31
635	0.33
636	0.34
637	0.34
638	0.31
639	0.28
640	0.27
641	0.23
642	0.23
643	0.26
644	0.24
645	0.21
646	0.21
647	0.2
648	0.17
649	0.14
650	0.14
651	0.08
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.11
656	0.14
657	0.15
658	0.12
659	0.14
660	0.13
661	0.12
662	0.12
663	0.11
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.05
668	0.06
669	0.06
670	0.12
671	0.14
672	0.17
673	0.18
674	0.18
675	0.22
676	0.3
677	0.33
678	0.33
679	0.39
680	0.38
681	0.4
682	0.39
683	0.36
684	0.31
685	0.28
686	0.23
687	0.19
688	0.19
689	0.16
690	0.18
691	0.17
692	0.16
693	0.18
694	0.18
695	0.16
696	0.15
697	0.16
698	0.15
699	0.16
700	0.14
701	0.11
702	0.12
703	0.11
704	0.16
705	0.21
706	0.2
707	0.2
708	0.21
709	0.21
710	0.26
711	0.3
712	0.27
713	0.26
714	0.34
715	0.37
716	0.43
717	0.47
718	0.44
719	0.44
720	0.46
721	0.44
722	0.39
723	0.38
724	0.36
725	0.37
726	0.36
727	0.37
728	0.34
729	0.33
730	0.33
731	0.3
732	0.28
733	0.25
734	0.25
735	0.2
736	0.17
737	0.16
738	0.13
739	0.12
740	0.1
741	0.07
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.04
746	0.04
747	0.03
748	0.03
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.08
758	0.1
759	0.11
760	0.13
761	0.13
762	0.21
763	0.22
764	0.25
765	0.24
766	0.23
767	0.22
768	0.22
769	0.22
770	0.13
771	0.13
772	0.1
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.15
778	0.16
779	0.18
780	0.19
781	0.19
782	0.21
783	0.27
784	0.33
785	0.31
786	0.36
787	0.39
788	0.42
789	0.45
790	0.53
791	0.48
792	0.45
793	0.42
794	0.38
795	0.35
796	0.32
797	0.31
798	0.26
799	0.26
800	0.21
801	0.2
802	0.2
803	0.18
804	0.17
805	0.14
806	0.12
807	0.12
808	0.14
809	0.14
810	0.14
811	0.15
812	0.16
813	0.18
814	0.14
815	0.15
816	0.15
817	0.15
818	0.14
819	0.13
820	0.12
821	0.13
822	0.16
823	0.17
824	0.2
825	0.24
826	0.24
827	0.27
828	0.3
829	0.32
830	0.34
831	0.38
832	0.38
833	0.35
834	0.34
835	0.32
836	0.32
837	0.3
838	0.26
839	0.22
840	0.21
841	0.27
842	0.35
843	0.44
844	0.51
845	0.56
846	0.64
847	0.71
848	0.77
849	0.8
850	0.79
851	0.8
852	0.81
853	0.83
854	0.78
855	0.77
856	0.75
857	0.74
858	0.71
859	0.7
860	0.64
861	0.56
862	0.54
863	0.5
864	0.44
865	0.37
866	0.38
867	0.37
868	0.32
869	0.3
870	0.27
871	0.24
872	0.23
873	0.24
874	0.18
875	0.13
876	0.12
877	0.12
878	0.14
879	0.13
880	0.12
881	0.11
882	0.1
883	0.09
884	0.09
885	0.09
886	0.07
887	0.08
888	0.08
889	0.07
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.09
898	0.09
899	0.08
900	0.08
901	0.07
902	0.08
903	0.12
904	0.13
905	0.14
906	0.14
907	0.13
908	0.14
909	0.14
910	0.14
911	0.13
912	0.12
913	0.14
914	0.15
915	0.16
916	0.15
917	0.15
918	0.15
919	0.13
920	0.14
921	0.13
922	0.14
923	0.15
924	0.15
925	0.15
926	0.15
927	0.15
928	0.14
929	0.11
930	0.09
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.09
935	0.09
936	0.09
937	0.1
938	0.1
939	0.11
940	0.1
941	0.1
942	0.1
943	0.09
944	0.11
945	0.11
946	0.11
947	0.11
948	0.11
949	0.15
950	0.2
951	0.21
952	0.2
953	0.23
954	0.29
955	0.35
956	0.34
957	0.31
958	0.27
959	0.29
960	0.28
961	0.25
962	0.18
963	0.12
964	0.13
965	0.13
966	0.13
967	0.1
968	0.09
969	0.09
970	0.08
971	0.08
972	0.07
973	0.07
974	0.11
975	0.12
976	0.13
977	0.13
978	0.13
979	0.14
980	0.13
981	0.14
982	0.11
983	0.09
984	0.08
985	0.08
986	0.07
987	0.07
988	0.06
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.05
993	0.06
994	0.06
995	0.05
996	0.06
997	0.07
998	0.07
999	0.08
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.09
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.12
1007	0.13
1008	0.15
1009	0.23
1010	0.24
1011	0.25
1012	0.28
1013	0.34
1014	0.37
1015	0.44
1016	0.44
1017	0.39
1018	0.38
1019	0.37
1020	0.34
1021	0.27
1022	0.2
1023	0.11
1024	0.1
1025	0.1
1026	0.11
1027	0.14
1028	0.15
1029	0.2
1030	0.21
1031	0.24
1032	0.28
1033	0.32
1034	0.32
1035	0.33
1036	0.32
1037	0.28
1038	0.27
1039	0.28
1040	0.23
1041	0.16
1042	0.15
1043	0.11
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.06
1048	0.06
1049	0.07
1050	0.08
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.09
1054	0.1
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.09
1060	0.1
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.09
1064	0.08
1065	0.1
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.12
1076	0.13
1077	0.13
1078	0.13
1079	0.14
1080	0.16
1081	0.15
1082	0.17
1083	0.16
1084	0.18
1085	0.17
1086	0.17
1087	0.15
1088	0.12
1089	0.13
1090	0.15
1091	0.15
1092	0.13
1093	0.13
1094	0.16
1095	0.18
1096	0.23
1097	0.22
1098	0.2
1099	0.25
1100	0.25
1101	0.34
1102	0.36
1103	0.42
1104	0.41
1105	0.42
1106	0.42
1107	0.39
1108	0.43
1109	0.37
1110	0.34
1111	0.29
1112	0.28
1113	0.36
1114	0.36
1115	0.33
1116	0.3
1117	0.3
1118	0.32
1119	0.31
1120	0.31
1121	0.24
1122	0.27
1123	0.27
1124	0.26
1125	0.25
1126	0.23
1127	0.21
1128	0.19
1129	0.2
1130	0.16
1131	0.18
1132	0.18
1133	0.23
1134	0.23
1135	0.23
1136	0.27
1137	0.29
1138	0.33
1139	0.31
1140	0.35
1141	0.31
1142	0.32
1143	0.31
1144	0.27
1145	0.22
1146	0.18
1147	0.21
1148	0.19
1149	0.21
1150	0.2
1151	0.22
1152	0.23
1153	0.24
1154	0.25
1155	0.26
1156	0.29

A0A177WG46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer