Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2WYB3

Protein Details
Accession G2WYB3    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-54ELPVASSHKTEKKQKKEKKKRSREEDPLVTDERKHKRSKSTANRAISPDHydrophilic
66-93SVAEAEKPTKKSKKSKKSKQEAPADAGDHydrophilic
118-144ELKASAKKSSSKKKSKKEPTPESSEAEHydrophilic
415-436QQELRRRKGKSGGVLRKERRYVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-30KTEKKQKKEKKKRSREE
38-43RKHKRS
72-84KPTKKSKKSKKSK
101-107KKKRRMS
117-135SELKASAKKSSSKKKSKKE
419-433RRRKGKSGGVLRKER
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG vda:VDAG_02595  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAVKEELPVASSHKTEKKQKKEKKKRSREEDPLVTDERKHKRSKSTANRAISPDLSASANTDANDSVAEAEKPTKKSKKSKKSKQEAPADAGDAVQVVADKKKRRMSRSQDDEDGRSELKASAKKSSSKKKSKKEPTPESSEAEQASESSEDDEAENPDAMDIDTPLQPNPPKSTSRLHQPLDTPAKPRYPFFTQTVSLFLPIYPIGWAGPCTAAATQHLQPMVNRYVPVLGGVLLGFRNVAVSERPGREDAATSDSDVCKLGAIDEFAVGFGWVTADVDLFVPKRGAWMEGSINLESEGHVGVVCWGKFNASIESARLPPAWRWVHLGTDETAATSAHDDTVSNFTAEEQHGAVRQIHATGYWVDEAGQKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEAEARQRDAQQELRRRKGKSGGVLRKERRYVPDFSITKFGEVENEEEKALAQEVWEHTEPAKDAAETAQDGEYAGLSHEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.61
4 0.68
5 0.76
6 0.85
7 0.88
8 0.92
9 0.95
10 0.95
11 0.96
12 0.96
13 0.95
14 0.96
15 0.95
16 0.93
17 0.91
18 0.86
19 0.8
20 0.74
21 0.65
22 0.59
23 0.58
24 0.57
25 0.55
26 0.57
27 0.58
28 0.64
29 0.72
30 0.78
31 0.8
32 0.82
33 0.84
34 0.83
35 0.82
36 0.76
37 0.7
38 0.6
39 0.5
40 0.4
41 0.32
42 0.26
43 0.2
44 0.18
45 0.16
46 0.17
47 0.15
48 0.16
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.17
58 0.22
59 0.26
60 0.36
61 0.43
62 0.5
63 0.61
64 0.71
65 0.75
66 0.81
67 0.88
68 0.9
69 0.92
70 0.93
71 0.92
72 0.92
73 0.86
74 0.8
75 0.72
76 0.62
77 0.51
78 0.41
79 0.31
80 0.2
81 0.14
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.12
86 0.18
87 0.24
88 0.31
89 0.4
90 0.47
91 0.54
92 0.63
93 0.68
94 0.73
95 0.77
96 0.77
97 0.76
98 0.73
99 0.68
100 0.59
101 0.52
102 0.41
103 0.31
104 0.26
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.24
109 0.28
110 0.32
111 0.4
112 0.48
113 0.57
114 0.62
115 0.69
116 0.77
117 0.8
118 0.87
119 0.9
120 0.92
121 0.92
122 0.91
123 0.87
124 0.87
125 0.8
126 0.73
127 0.64
128 0.56
129 0.46
130 0.35
131 0.28
132 0.19
133 0.16
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.13
155 0.15
156 0.17
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.27
161 0.33
162 0.33
163 0.41
164 0.47
165 0.44
166 0.44
167 0.43
168 0.48
169 0.51
170 0.49
171 0.42
172 0.38
173 0.42
174 0.4
175 0.39
176 0.36
177 0.33
178 0.35
179 0.35
180 0.36
181 0.31
182 0.31
183 0.33
184 0.28
185 0.23
186 0.19
187 0.15
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.18
210 0.19
211 0.16
212 0.15
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.07
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.12
278 0.14
279 0.17
280 0.15
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.1
285 0.1
286 0.07
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.06
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.15
306 0.15
307 0.13
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.25
312 0.25
313 0.27
314 0.26
315 0.27
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.12
354 0.14
355 0.14
356 0.18
357 0.17
358 0.21
359 0.25
360 0.32
361 0.34
362 0.42
363 0.49
364 0.53
365 0.57
366 0.63
367 0.61
368 0.61
369 0.57
370 0.5
371 0.41
372 0.34
373 0.3
374 0.21
375 0.19
376 0.12
377 0.1
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.08
395 0.09
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.16
400 0.21
401 0.3
402 0.35
403 0.45
404 0.53
405 0.62
406 0.67
407 0.67
408 0.69
409 0.7
410 0.68
411 0.68
412 0.69
413 0.69
414 0.72
415 0.8
416 0.81
417 0.81
418 0.79
419 0.74
420 0.7
421 0.65
422 0.6
423 0.56
424 0.59
425 0.53
426 0.5
427 0.53
428 0.46
429 0.42
430 0.38
431 0.32
432 0.26
433 0.26
434 0.27
435 0.21
436 0.22
437 0.2
438 0.19
439 0.2
440 0.16
441 0.15
442 0.11
443 0.09
444 0.13
445 0.15
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.22
450 0.25
451 0.26
452 0.24
453 0.24
454 0.17
455 0.17
456 0.18
457 0.21
458 0.18
459 0.19
460 0.17
461 0.15
462 0.15
463 0.14
464 0.13
465 0.09
466 0.09