Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WDA5

Protein Details
Accession A0A177WDA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47KVAPVKKAAPQKQTPQPKKDHydrophilic
261-286RFERNDRKAPRRDGEQRNTRNRNTGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-124KRGGGRGRGGRDHDRRSAAGHYKAG
230-240KSESARKNKEK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.833, cyto 14.5, nucl 11, cyto_mito 8.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSMTDSVVSKNLFAVLGDSSDTEVSVPKVAPVKKAAPQKQTPQPKKDAPTEGKSRGDRTSRPQTGNRQVNYRNPTGPRETGPFEQAPEQFTSTTSVRLDKRGGGRGRGGRDHDRRSAAGHYKAGEKKDVAGKGTWGDAITAEVDENGNPNPVLESEDAVANPASAEPKEADPEDSFKTLEQFMAEKKKSSVATEVVTRKANEGVDETKFKGVTKLEKPDEEFFGDLKKSKSESARKNKEKAAKATLDIQQTFTPVPRDNGRFERNDRKAPRRDGEQRNTRNRNTGHGQTRINVADTSAFPSLGSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.21
16 0.23
17 0.26
18 0.31
19 0.35
20 0.39
21 0.49
22 0.54
23 0.56
24 0.62
25 0.67
26 0.71
27 0.77
28 0.8
29 0.77
30 0.78
31 0.76
32 0.75
33 0.74
34 0.74
35 0.7
36 0.69
37 0.7
38 0.67
39 0.67
40 0.64
41 0.6
42 0.57
43 0.56
44 0.52
45 0.52
46 0.57
47 0.57
48 0.59
49 0.62
50 0.65
51 0.7
52 0.74
53 0.68
54 0.65
55 0.62
56 0.65
57 0.64
58 0.58
59 0.53
60 0.48
61 0.5
62 0.48
63 0.46
64 0.4
65 0.39
66 0.39
67 0.35
68 0.37
69 0.32
70 0.28
71 0.3
72 0.28
73 0.26
74 0.24
75 0.23
76 0.18
77 0.18
78 0.21
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.2
83 0.2
84 0.23
85 0.24
86 0.25
87 0.29
88 0.35
89 0.36
90 0.34
91 0.39
92 0.41
93 0.44
94 0.43
95 0.44
96 0.45
97 0.5
98 0.52
99 0.5
100 0.48
101 0.44
102 0.42
103 0.43
104 0.39
105 0.36
106 0.32
107 0.29
108 0.33
109 0.36
110 0.35
111 0.31
112 0.25
113 0.24
114 0.28
115 0.29
116 0.23
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.15
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.13
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.26
175 0.26
176 0.27
177 0.27
178 0.2
179 0.21
180 0.27
181 0.29
182 0.27
183 0.29
184 0.27
185 0.25
186 0.25
187 0.23
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.19
192 0.21
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.21
198 0.21
199 0.26
200 0.3
201 0.37
202 0.39
203 0.42
204 0.46
205 0.45
206 0.45
207 0.38
208 0.33
209 0.24
210 0.24
211 0.23
212 0.21
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.24
217 0.32
218 0.39
219 0.48
220 0.56
221 0.66
222 0.71
223 0.76
224 0.78
225 0.78
226 0.77
227 0.73
228 0.7
229 0.62
230 0.56
231 0.57
232 0.55
233 0.52
234 0.44
235 0.4
236 0.32
237 0.3
238 0.29
239 0.25
240 0.24
241 0.2
242 0.24
243 0.29
244 0.32
245 0.36
246 0.44
247 0.48
248 0.49
249 0.55
250 0.61
251 0.61
252 0.67
253 0.7
254 0.71
255 0.75
256 0.78
257 0.77
258 0.76
259 0.79
260 0.8
261 0.82
262 0.83
263 0.84
264 0.86
265 0.88
266 0.82
267 0.8
268 0.71
269 0.68
270 0.65
271 0.65
272 0.62
273 0.6
274 0.59
275 0.53
276 0.57
277 0.51
278 0.45
279 0.36
280 0.29
281 0.25
282 0.24
283 0.26
284 0.21
285 0.19