FuNGI

A0A177WIR3

Protein Details

Accession

A0A177WIR3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
878-897	TSGPIRTKCQKREEGKPAYR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 11.5, nucl 8.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MSTYSINSNPGSVTGVSGSGAITPPVLDQGRALEEALGVVKVQSYHMRRCLNTNKLMDALKHASTMLAELRTSVLTPKYYYELYMAIFDEIRHLSTYLYETHVSGRHHLSDLYELVQYAANIIPRLYLMITVGAVYMRVSRETFSIVDKPSDSGGDKENVSPNDPSLTETVQEKKPEEQDIPPIKELMRDMLDMTRGVQHPTRGLFLRYYLSGLTRDFLPDGSDQHVSPHGGIDDSIHFVLQNFIEMNKLWVRLQHQGHSRDREKREIERKELRLLVGSNLVRLSQLEDLSLAMYQGNIMPQLLEEIVSCRDVIAQEYLMEVVIQVFPDDFHLRCLDMFLSATARLQRTVNVKQIVISLIDRFSGYAARAREEATGAKDAQTISGIPDDVKLFDVFWTQITELIKARPEFTLQDTIALLVSLANLSLNCYPDELGHIDKVLGIAKTKVQEALLVDELTLTDSKTKSLLLQLLLGPVQTYNSNVLRILDFPSSSTHDSEDASDASSSGVCLGGNYTKLLFLQPYGIRRQVAHAFATHALRAAVHDDFKITTIEGVNFILGEIGTIMVRDQIDGGLFGAKPKPHGQLSGPSSVVSRVDESRYASNEPDIPLDWEDAREEQTYLAKLIHTFRADDNSLDQEYKLLVVARNHFGEGGDIRIRFTLPPLVTCLIKLARKCYYAPWNATLAAESMALTGHATNPRDLVPQILKTIHETITSLSRAQEHFSDDDGYKPLFKDDYGSASSTIPRIGHGLMSPPDVSLRLHLLAAQVSDSMHQEEMCYEFFVQALVVYEESVSESKAQVNAITQIMGTLYGTTVFGYENYETLITKCAVHCSRLLRRVDQCRGVVLLSHLFWADAGQVDTVLNGSSSALLSTVTSSTSGPIRTKCQKREEGKPAYRDARRVLECLQKALKIADSVMDPSVNVELFVEILERYIWFFSDRNEAVSVKYISSLVDLIQTNLGACNGAEDEEDTDLNGRLSTNTGGIGGPLNTSKPPVSIFRERSKKVSQQTATHFKNVLAYLRFKRDIERDGLDSGLVVPGMSSGFAGGEVGGGRWGSIEIPRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.12
4	0.12
5	0.11
6	0.1
7	0.1
8	0.09
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.14
13	0.15
14	0.14
15	0.14
16	0.17
17	0.2
18	0.2
19	0.2
20	0.15
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.11
25	0.08
26	0.07
27	0.08
28	0.08
29	0.11
30	0.19
31	0.24
32	0.32
33	0.4
34	0.47
35	0.47
36	0.56
37	0.63
38	0.63
39	0.66
40	0.62
41	0.57
42	0.55
43	0.56
44	0.47
45	0.45
46	0.41
47	0.33
48	0.3
49	0.27
50	0.23
51	0.2
52	0.22
53	0.18
54	0.15
55	0.14
56	0.14
57	0.15
58	0.15
59	0.15
60	0.17
61	0.16
62	0.17
63	0.19
64	0.21
65	0.23
66	0.24
67	0.24
68	0.23
69	0.21
70	0.2
71	0.2
72	0.18
73	0.16
74	0.16
75	0.14
76	0.16
77	0.15
78	0.16
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.15
83	0.17
84	0.15
85	0.18
86	0.17
87	0.16
88	0.2
89	0.25
90	0.25
91	0.27
92	0.29
93	0.29
94	0.29
95	0.29
96	0.27
97	0.26
98	0.25
99	0.23
100	0.19
101	0.16
102	0.16
103	0.16
104	0.14
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.1
112	0.12
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.08
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.09
124	0.09
125	0.11
126	0.11
127	0.12
128	0.14
129	0.16
130	0.17
131	0.19
132	0.24
133	0.24
134	0.26
135	0.25
136	0.26
137	0.24
138	0.25
139	0.22
140	0.19
141	0.21
142	0.21
143	0.22
144	0.24
145	0.3
146	0.28
147	0.3
148	0.29
149	0.26
150	0.26
151	0.25
152	0.23
153	0.19
154	0.19
155	0.18
156	0.2
157	0.25
158	0.27
159	0.3
160	0.3
161	0.33
162	0.37
163	0.39
164	0.39
165	0.36
166	0.42
167	0.47
168	0.5
169	0.45
170	0.42
171	0.38
172	0.37
173	0.35
174	0.29
175	0.22
176	0.18
177	0.19
178	0.19
179	0.21
180	0.18
181	0.18
182	0.2
183	0.18
184	0.21
185	0.22
186	0.22
187	0.25
188	0.26
189	0.29
190	0.25
191	0.26
192	0.24
193	0.23
194	0.24
195	0.21
196	0.2
197	0.17
198	0.17
199	0.17
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.14
204	0.13
205	0.13
206	0.14
207	0.13
208	0.14
209	0.16
210	0.17
211	0.15
212	0.17
213	0.2
214	0.18
215	0.17
216	0.16
217	0.14
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.11
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.12
228	0.1
229	0.11
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.13
235	0.14
236	0.15
237	0.14
238	0.17
239	0.21
240	0.28
241	0.31
242	0.34
243	0.4
244	0.46
245	0.53
246	0.59
247	0.62
248	0.63
249	0.64
250	0.66
251	0.63
252	0.66
253	0.69
254	0.67
255	0.69
256	0.69
257	0.68
258	0.66
259	0.63
260	0.53
261	0.46
262	0.4
263	0.33
264	0.3
265	0.27
266	0.22
267	0.2
268	0.19
269	0.16
270	0.15
271	0.16
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.08
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.07
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.08
316	0.11
317	0.1
318	0.11
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.14
323	0.11
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.12
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.17
335	0.22
336	0.27
337	0.32
338	0.31
339	0.3
340	0.3
341	0.31
342	0.27
343	0.22
344	0.18
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.15
360	0.16
361	0.14
362	0.16
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.1
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.09
375	0.09
376	0.09
377	0.1
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.1
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.09
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.17
392	0.16
393	0.17
394	0.15
395	0.16
396	0.16
397	0.18
398	0.22
399	0.18
400	0.19
401	0.18
402	0.18
403	0.16
404	0.14
405	0.1
406	0.04
407	0.05
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.05
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.13
439	0.13
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.08
453	0.11
454	0.13
455	0.11
456	0.13
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.12
461	0.09
462	0.07
463	0.07
464	0.05
465	0.06
466	0.08
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.13
474	0.11
475	0.1
476	0.1
477	0.12
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.13
482	0.13
483	0.13
484	0.13
485	0.13
486	0.1
487	0.09
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.1
508	0.12
509	0.14
510	0.17
511	0.18
512	0.19
513	0.19
514	0.22
515	0.21
516	0.21
517	0.19
518	0.16
519	0.16
520	0.18
521	0.18
522	0.15
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.09
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.05
545	0.04
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.09
564	0.09
565	0.11
566	0.14
567	0.17
568	0.17
569	0.19
570	0.2
571	0.25
572	0.29
573	0.3
574	0.27
575	0.24
576	0.23
577	0.22
578	0.2
579	0.13
580	0.11
581	0.09
582	0.11
583	0.12
584	0.14
585	0.16
586	0.17
587	0.18
588	0.16
589	0.16
590	0.17
591	0.16
592	0.15
593	0.13
594	0.13
595	0.12
596	0.13
597	0.12
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.1
603	0.1
604	0.09
605	0.11
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.09
610	0.1
611	0.12
612	0.15
613	0.14
614	0.15
615	0.15
616	0.19
617	0.19
618	0.18
619	0.18
620	0.17
621	0.17
622	0.16
623	0.15
624	0.11
625	0.1
626	0.1
627	0.09
628	0.07
629	0.09
630	0.12
631	0.15
632	0.17
633	0.18
634	0.18
635	0.17
636	0.16
637	0.15
638	0.13
639	0.13
640	0.13
641	0.12
642	0.13
643	0.13
644	0.13
645	0.12
646	0.13
647	0.15
648	0.13
649	0.14
650	0.17
651	0.18
652	0.17
653	0.17
654	0.19
655	0.16
656	0.19
657	0.19
658	0.21
659	0.24
660	0.26
661	0.26
662	0.29
663	0.34
664	0.38
665	0.4
666	0.38
667	0.36
668	0.34
669	0.33
670	0.28
671	0.19
672	0.14
673	0.11
674	0.08
675	0.06
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.07
681	0.11
682	0.12
683	0.12
684	0.13
685	0.14
686	0.16
687	0.16
688	0.17
689	0.16
690	0.17
691	0.19
692	0.19
693	0.19
694	0.2
695	0.23
696	0.19
697	0.17
698	0.15
699	0.14
700	0.18
701	0.18
702	0.16
703	0.14
704	0.16
705	0.16
706	0.18
707	0.18
708	0.16
709	0.16
710	0.17
711	0.19
712	0.16
713	0.17
714	0.18
715	0.17
716	0.15
717	0.14
718	0.15
719	0.12
720	0.12
721	0.13
722	0.13
723	0.17
724	0.17
725	0.18
726	0.18
727	0.18
728	0.19
729	0.16
730	0.17
731	0.12
732	0.11
733	0.12
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.14
738	0.14
739	0.16
740	0.15
741	0.13
742	0.14
743	0.14
744	0.13
745	0.11
746	0.12
747	0.11
748	0.11
749	0.11
750	0.12
751	0.12
752	0.11
753	0.1
754	0.08
755	0.07
756	0.08
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.08
761	0.08
762	0.09
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.1
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.08
771	0.06
772	0.07
773	0.07
774	0.06
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.08
779	0.08
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.1
784	0.11
785	0.12
786	0.11
787	0.12
788	0.14
789	0.13
790	0.13
791	0.11
792	0.1
793	0.09
794	0.09
795	0.07
796	0.05
797	0.04
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.09
805	0.09
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.1
810	0.11
811	0.13
812	0.11
813	0.12
814	0.13
815	0.2
816	0.21
817	0.23
818	0.26
819	0.31
820	0.39
821	0.45
822	0.48
823	0.47
824	0.54
825	0.62
826	0.65
827	0.63
828	0.55
829	0.49
830	0.46
831	0.4
832	0.32
833	0.25
834	0.21
835	0.15
836	0.15
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.09
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.07
848	0.07
849	0.06
850	0.05
851	0.04
852	0.05
853	0.05
854	0.05
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.07
860	0.07
861	0.07
862	0.08
863	0.08
864	0.09
865	0.12
866	0.15
867	0.18
868	0.21
869	0.29
870	0.38
871	0.48
872	0.54
873	0.61
874	0.67
875	0.7
876	0.78
877	0.8
878	0.81
879	0.79
880	0.76
881	0.75
882	0.74
883	0.71
884	0.65
885	0.6
886	0.58
887	0.53
888	0.5
889	0.48
890	0.48
891	0.45
892	0.47
893	0.44
894	0.36
895	0.35
896	0.34
897	0.31
898	0.22
899	0.21
900	0.17
901	0.16
902	0.16
903	0.16
904	0.14
905	0.12
906	0.12
907	0.14
908	0.11
909	0.1
910	0.08
911	0.07
912	0.07
913	0.08
914	0.07
915	0.05
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.07
920	0.08
921	0.08
922	0.1
923	0.11
924	0.13
925	0.22
926	0.22
927	0.24
928	0.26
929	0.25
930	0.24
931	0.3
932	0.29
933	0.2
934	0.21
935	0.18
936	0.16
937	0.17
938	0.16
939	0.1
940	0.14
941	0.14
942	0.14
943	0.15
944	0.15
945	0.14
946	0.14
947	0.13
948	0.08
949	0.08
950	0.09
951	0.08
952	0.09
953	0.09
954	0.09
955	0.1
956	0.12
957	0.12
958	0.1
959	0.11
960	0.12
961	0.12
962	0.11
963	0.1
964	0.09
965	0.12
966	0.12
967	0.12
968	0.11
969	0.12
970	0.11
971	0.12
972	0.13
973	0.11
974	0.11
975	0.12
976	0.13
977	0.13
978	0.16
979	0.16
980	0.16
981	0.19
982	0.24
983	0.31
984	0.39
985	0.46
986	0.53
987	0.63
988	0.64
989	0.68
990	0.7
991	0.71
992	0.69
993	0.72
994	0.68
995	0.66
996	0.73
997	0.77
998	0.72
999	0.68
1000	0.61
1001	0.51
1002	0.51
1003	0.45
1004	0.42
1005	0.35
1006	0.39
1007	0.41
1008	0.48
1009	0.51
1010	0.46
1011	0.51
1012	0.5
1013	0.52
1014	0.5
1015	0.49
1016	0.43
1017	0.41
1018	0.41
1019	0.33
1020	0.27
1021	0.22
1022	0.16
1023	0.11
1024	0.08
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.07
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.05
1031	0.05
1032	0.05
1033	0.06
1034	0.05
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.07
1042	0.08
1043	0.08

A0A177WIR3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer