FuNGI

A0A177VYH4

Protein Details

Accession

A0A177VYH4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
938-961	SSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 13, cyto 8.5, cyto_mito 5, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSLYVNEQEVMSPGSQQVKIAEGLIITVLTQDNYTVWANQMEAAFETLDLWESHIIGELPEKIERDYKLKEFKARGILQATVSSKFKFMLCDSNGVQLDARKIWVGLKNHYVDYCERSLTRSEEAMANLQYDPRKGVEELYNTMTSLRHKIAAANIFWGEKVFASRVMAKLVSKSREWRYFEGHTVRWTDEMLSPNKFLSELIEEEIKLINMGALPRHGVDDTIYEANYASRNHRNLRKGSTSHGPNAHGAKQGNSSRDDYFAANHEMDTYYRREQGRRPYEQRNDDQDRMPACHNCGNIGHYAKDCRPAPRNSNYRQSSPKFFSKGPRSNNQDRSRNNQSADGMFVAMDDKKRDIVIDEACSSIDRSDMFILDSGASSHMVCRPEWVYDFVPCSNRQVKASGQDMHNVIGTGTVEILCNIGHRTVSIQLGNVLVVPTFGVNLISENILEDKGCQISIFKKVRTIRKSNGEVIMTTRRDGGVNAVNCEAIISDEERAMAHNTVIATANHASEVFRKPTDTAGWHKRLGHINVESIKNLADKSEGLDIIPGKTKERSQCVACIKGKAVRHPFPKRSTHVATQVNVLLHMDLEGPFHDTALGGYKYYLIIVDDYSRYSHLYPMISKDQTFQRFKEHVAAVELSKGLPVRAIRTDNGGEFTSSAFQQFLKLKGIAVQRTTPYTPQQNGVAERKNRTIVSAVRAMFAGCKLGREFWAEAAMTAVYLQNRSPNKALSQRTPYELWTGELPKVMHLRTFGCAAYALRPKQLLTKLDTRTRRCIFIGYHSQAKAYKLFDLESKKMITSRDVEFAEEEFPSLSNPVRRNNTVPAMTLYEEAPLFTHSYNLGGVTPSVPIAIDNVVSPKTSETPGNPDCASTPIGGESEPGRRQVPRVVPTAMNTARMTVADRGTEVTTSDERITQEELLGRGISRNKAIKTSLNESSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAVQERPVDVMNRDRATMAAPIKSTVTADYPGAISEVDDASEPSIQAAVEQRMVEDLPTNTSQDDSDLEESDQYYSYTHGSGTSNADESNNAVAVISNGSSRNIVPETWQQAIVSSDADLWNAVKLILHYVQGTLSYALELGGTNASLSGYSDADWAGDVKTRKSTSGYLCYVGNALVSWRSSKQTCVAVSTMEAEYTAAESASRELLFLRDLLGELGFEQDGPTTLYCDSQSAISNMIGPSVVHEATKHIGIKINALRDRISQGLIKPEYIGTKDQVADILTKGLPRPAFEQFVNLLGLRECSRRGGVLDIGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.21
4	0.21
5	0.21
6	0.21
7	0.21
8	0.18
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.1
13	0.07
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.11
21	0.13
22	0.12
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.17
27	0.17
28	0.15
29	0.14
30	0.15
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.09
35	0.11
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.1
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.18
48	0.19
49	0.2
50	0.25
51	0.27
52	0.31
53	0.34
54	0.4
55	0.48
56	0.52
57	0.59
58	0.59
59	0.62
60	0.66
61	0.62
62	0.6
63	0.54
64	0.5
65	0.43
66	0.45
67	0.41
68	0.35
69	0.34
70	0.3
71	0.27
72	0.26
73	0.25
74	0.23
75	0.24
76	0.29
77	0.29
78	0.34
79	0.34
80	0.41
81	0.4
82	0.37
83	0.36
84	0.29
85	0.3
86	0.25
87	0.25
88	0.18
89	0.18
90	0.22
91	0.28
92	0.3
93	0.31
94	0.38
95	0.4
96	0.42
97	0.42
98	0.4
99	0.36
100	0.38
101	0.35
102	0.3
103	0.27
104	0.27
105	0.31
106	0.31
107	0.31
108	0.27
109	0.26
110	0.26
111	0.27
112	0.29
113	0.26
114	0.23
115	0.21
116	0.23
117	0.23
118	0.21
119	0.22
120	0.19
121	0.21
122	0.2
123	0.24
124	0.27
125	0.29
126	0.32
127	0.34
128	0.34
129	0.3
130	0.31
131	0.28
132	0.24
133	0.25
134	0.23
135	0.21
136	0.21
137	0.24
138	0.3
139	0.34
140	0.32
141	0.3
142	0.29
143	0.27
144	0.26
145	0.24
146	0.18
147	0.12
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.15
152	0.19
153	0.19
154	0.22
155	0.23
156	0.21
157	0.27
158	0.32
159	0.33
160	0.33
161	0.4
162	0.46
163	0.53
164	0.58
165	0.55
166	0.55
167	0.56
168	0.6
169	0.59
170	0.53
171	0.48
172	0.46
173	0.42
174	0.36
175	0.32
176	0.27
177	0.24
178	0.28
179	0.27
180	0.27
181	0.27
182	0.26
183	0.26
184	0.24
185	0.19
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.16
190	0.18
191	0.17
192	0.18
193	0.19
194	0.15
195	0.11
196	0.1
197	0.08
198	0.08
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.14
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.14
215	0.16
216	0.16
217	0.18
218	0.25
219	0.31
220	0.39
221	0.46
222	0.53
223	0.56
224	0.62
225	0.64
226	0.59
227	0.59
228	0.6
229	0.58
230	0.57
231	0.55
232	0.49
233	0.45
234	0.48
235	0.45
236	0.41
237	0.37
238	0.32
239	0.36
240	0.38
241	0.36
242	0.36
243	0.35
244	0.31
245	0.32
246	0.32
247	0.24
248	0.22
249	0.22
250	0.23
251	0.2
252	0.18
253	0.17
254	0.17
255	0.17
256	0.18
257	0.19
258	0.18
259	0.24
260	0.27
261	0.3
262	0.35
263	0.46
264	0.52
265	0.58
266	0.62
267	0.66
268	0.73
269	0.77
270	0.78
271	0.77
272	0.75
273	0.68
274	0.64
275	0.58
276	0.51
277	0.46
278	0.43
279	0.35
280	0.31
281	0.32
282	0.3
283	0.27
284	0.26
285	0.25
286	0.26
287	0.26
288	0.24
289	0.22
290	0.27
291	0.26
292	0.33
293	0.33
294	0.35
295	0.4
296	0.45
297	0.51
298	0.56
299	0.63
300	0.61
301	0.69
302	0.66
303	0.66
304	0.67
305	0.65
306	0.63
307	0.6
308	0.62
309	0.56
310	0.55
311	0.58
312	0.6
313	0.63
314	0.62
315	0.65
316	0.66
317	0.72
318	0.79
319	0.78
320	0.76
321	0.72
322	0.74
323	0.74
324	0.7
325	0.62
326	0.56
327	0.49
328	0.41
329	0.38
330	0.3
331	0.21
332	0.15
333	0.14
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.13
343	0.16
344	0.17
345	0.19
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.19
350	0.18
351	0.13
352	0.11
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.09
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.11
368	0.12
369	0.12
370	0.15
371	0.15
372	0.17
373	0.18
374	0.21
375	0.19
376	0.2
377	0.23
378	0.22
379	0.25
380	0.23
381	0.28
382	0.28
383	0.29
384	0.28
385	0.28
386	0.28
387	0.3
388	0.35
389	0.34
390	0.3
391	0.32
392	0.31
393	0.29
394	0.27
395	0.21
396	0.16
397	0.12
398	0.11
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.08
412	0.1
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.11
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.1
444	0.2
445	0.24
446	0.23
447	0.3
448	0.36
449	0.46
450	0.52
451	0.57
452	0.54
453	0.59
454	0.64
455	0.61
456	0.58
457	0.5
458	0.42
459	0.39
460	0.4
461	0.31
462	0.27
463	0.23
464	0.19
465	0.19
466	0.18
467	0.18
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.17
473	0.17
474	0.17
475	0.13
476	0.07
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.09
485	0.08
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.09
490	0.1
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.09
496	0.1
497	0.09
498	0.11
499	0.15
500	0.15
501	0.15
502	0.16
503	0.16
504	0.18
505	0.2
506	0.2
507	0.25
508	0.31
509	0.35
510	0.36
511	0.37
512	0.4
513	0.43
514	0.41
515	0.39
516	0.31
517	0.31
518	0.33
519	0.33
520	0.28
521	0.22
522	0.21
523	0.16
524	0.15
525	0.11
526	0.08
527	0.07
528	0.08
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.15
536	0.14
537	0.13
538	0.15
539	0.19
540	0.22
541	0.27
542	0.29
543	0.27
544	0.34
545	0.37
546	0.43
547	0.4
548	0.38
549	0.34
550	0.35
551	0.35
552	0.35
553	0.39
554	0.38
555	0.46
556	0.53
557	0.58
558	0.6
559	0.64
560	0.61
561	0.6
562	0.58
563	0.53
564	0.53
565	0.5
566	0.44
567	0.39
568	0.37
569	0.3
570	0.25
571	0.21
572	0.12
573	0.08
574	0.08
575	0.06
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.06
585	0.1
586	0.1
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.04
594	0.04
595	0.05
596	0.06
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.1
605	0.11
606	0.12
607	0.16
608	0.2
609	0.2
610	0.19
611	0.21
612	0.25
613	0.31
614	0.33
615	0.3
616	0.32
617	0.32
618	0.33
619	0.36
620	0.31
621	0.24
622	0.23
623	0.23
624	0.16
625	0.16
626	0.15
627	0.09
628	0.09
629	0.08
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.09
634	0.12
635	0.14
636	0.13
637	0.17
638	0.18
639	0.16
640	0.18
641	0.16
642	0.13
643	0.11
644	0.11
645	0.09
646	0.08
647	0.08
648	0.06
649	0.06
650	0.1
651	0.11
652	0.13
653	0.14
654	0.14
655	0.14
656	0.19
657	0.23
658	0.21
659	0.21
660	0.21
661	0.2
662	0.22
663	0.23
664	0.2
665	0.2
666	0.23
667	0.23
668	0.22
669	0.24
670	0.24
671	0.27
672	0.3
673	0.32
674	0.31
675	0.32
676	0.33
677	0.33
678	0.3
679	0.27
680	0.26
681	0.22
682	0.23
683	0.25
684	0.23
685	0.21
686	0.21
687	0.2
688	0.16
689	0.14
690	0.14
691	0.08
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.14
697	0.14
698	0.12
699	0.14
700	0.12
701	0.12
702	0.12
703	0.1
704	0.07
705	0.07
706	0.07
707	0.05
708	0.06
709	0.06
710	0.12
711	0.13
712	0.16
713	0.18
714	0.18
715	0.22
716	0.29
717	0.33
718	0.32
719	0.38
720	0.37
721	0.39
722	0.39
723	0.35
724	0.31
725	0.27
726	0.22
727	0.18
728	0.18
729	0.16
730	0.17
731	0.16
732	0.16
733	0.18
734	0.17
735	0.15
736	0.15
737	0.16
738	0.14
739	0.16
740	0.13
741	0.11
742	0.12
743	0.11
744	0.15
745	0.2
746	0.2
747	0.2
748	0.2
749	0.2
750	0.25
751	0.3
752	0.27
753	0.25
754	0.33
755	0.36
756	0.44
757	0.51
758	0.5
759	0.54
760	0.53
761	0.51
762	0.44
763	0.42
764	0.36
765	0.36
766	0.41
767	0.34
768	0.37
769	0.35
770	0.36
771	0.34
772	0.34
773	0.3
774	0.21
775	0.2
776	0.16
777	0.17
778	0.2
779	0.24
780	0.25
781	0.24
782	0.24
783	0.22
784	0.23
785	0.24
786	0.22
787	0.19
788	0.19
789	0.22
790	0.22
791	0.22
792	0.2
793	0.2
794	0.19
795	0.15
796	0.13
797	0.08
798	0.08
799	0.07
800	0.08
801	0.09
802	0.13
803	0.16
804	0.22
805	0.27
806	0.29
807	0.32
808	0.37
809	0.4
810	0.36
811	0.34
812	0.3
813	0.27
814	0.25
815	0.23
816	0.18
817	0.14
818	0.12
819	0.11
820	0.1
821	0.08
822	0.09
823	0.08
824	0.09
825	0.07
826	0.08
827	0.08
828	0.09
829	0.08
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.06
835	0.06
836	0.05
837	0.05
838	0.05
839	0.06
840	0.05
841	0.05
842	0.07
843	0.08
844	0.08
845	0.08
846	0.09
847	0.1
848	0.12
849	0.13
850	0.13
851	0.21
852	0.23
853	0.26
854	0.25
855	0.23
856	0.22
857	0.23
858	0.22
859	0.14
860	0.13
861	0.1
862	0.1
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.15
867	0.16
868	0.18
869	0.19
870	0.19
871	0.22
872	0.28
873	0.34
874	0.31
875	0.34
876	0.35
877	0.34
878	0.35
879	0.42
880	0.35
881	0.31
882	0.27
883	0.24
884	0.21
885	0.21
886	0.21
887	0.16
888	0.16
889	0.12
890	0.13
891	0.14
892	0.14
893	0.14
894	0.12
895	0.13
896	0.12
897	0.14
898	0.14
899	0.15
900	0.15
901	0.17
902	0.18
903	0.15
904	0.15
905	0.16
906	0.16
907	0.14
908	0.14
909	0.12
910	0.14
911	0.17
912	0.17
913	0.2
914	0.25
915	0.25
916	0.28
917	0.3
918	0.33
919	0.35
920	0.39
921	0.39
922	0.36
923	0.35
924	0.32
925	0.32
926	0.31
927	0.27
928	0.22
929	0.22
930	0.27
931	0.36
932	0.44
933	0.52
934	0.57
935	0.65
936	0.71
937	0.77
938	0.81
939	0.8
940	0.8
941	0.81
942	0.83
943	0.79
944	0.78
945	0.76
946	0.75
947	0.71
948	0.7
949	0.65
950	0.56
951	0.54
952	0.51
953	0.45
954	0.37
955	0.39
956	0.38
957	0.33
958	0.31
959	0.28
960	0.24
961	0.24
962	0.27
963	0.23
964	0.19
965	0.18
966	0.19
967	0.2
968	0.2
969	0.18
970	0.14
971	0.13
972	0.12
973	0.12
974	0.12
975	0.11
976	0.11
977	0.11
978	0.09
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.07
986	0.08
987	0.08
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.12
993	0.12
994	0.14
995	0.14
996	0.14
997	0.14
998	0.15
999	0.14
1000	0.13
1001	0.12
1002	0.14
1003	0.15
1004	0.16
1005	0.15
1006	0.16
1007	0.15
1008	0.13
1009	0.14
1010	0.13
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.15
1015	0.16
1016	0.15
1017	0.14
1018	0.11
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.14
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.15
1035	0.12
1036	0.1
1037	0.09
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.08
1043	0.09
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.14
1048	0.15
1049	0.14
1050	0.17
1051	0.24
1052	0.28
1053	0.28
1054	0.29
1055	0.25
1056	0.25
1057	0.26
1058	0.22
1059	0.15
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.1
1065	0.09
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.12
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.13
1075	0.14
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.15
1079	0.11
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.06
1087	0.06
1088	0.06
1089	0.06
1090	0.06
1091	0.06
1092	0.05
1093	0.07
1094	0.07
1095	0.07
1096	0.08
1097	0.09
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.08
1103	0.12
1104	0.14
1105	0.15
1106	0.23
1107	0.24
1108	0.26
1109	0.29
1110	0.35
1111	0.37
1112	0.44
1113	0.45
1114	0.39
1115	0.38
1116	0.37
1117	0.34
1118	0.27
1119	0.2
1120	0.11
1121	0.1
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.14
1125	0.15
1126	0.21
1127	0.22
1128	0.25
1129	0.28
1130	0.32
1131	0.33
1132	0.34
1133	0.32
1134	0.28
1135	0.28
1136	0.28
1137	0.23
1138	0.17
1139	0.15
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.1
1143	0.1
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.07
1147	0.08
1148	0.11
1149	0.1
1150	0.1
1151	0.1
1152	0.11
1153	0.12
1154	0.12
1155	0.12
1156	0.09
1157	0.1
1158	0.11
1159	0.1
1160	0.09
1161	0.08
1162	0.1
1163	0.08
1164	0.08
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.08
1168	0.1
1169	0.1
1170	0.1
1171	0.1
1172	0.12
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.13
1176	0.14
1177	0.16
1178	0.16
1179	0.17
1180	0.16
1181	0.18
1182	0.17
1183	0.17
1184	0.15
1185	0.12
1186	0.14
1187	0.15
1188	0.16
1189	0.13
1190	0.13
1191	0.16
1192	0.18
1193	0.23
1194	0.22
1195	0.2
1196	0.25
1197	0.25
1198	0.34
1199	0.36
1200	0.43
1201	0.42
1202	0.42
1203	0.42
1204	0.39
1205	0.43
1206	0.37
1207	0.34
1208	0.29
1209	0.28
1210	0.36
1211	0.36
1212	0.33
1213	0.3
1214	0.3
1215	0.32
1216	0.31
1217	0.31
1218	0.24
1219	0.27
1220	0.27
1221	0.26
1222	0.26
1223	0.23
1224	0.21
1225	0.19
1226	0.2
1227	0.16
1228	0.18
1229	0.19
1230	0.23
1231	0.23
1232	0.24
1233	0.27
1234	0.29
1235	0.33
1236	0.31
1237	0.35
1238	0.31
1239	0.32
1240	0.31
1241	0.27
1242	0.23
1243	0.18
1244	0.21
1245	0.19
1246	0.21
1247	0.2
1248	0.22
1249	0.23
1250	0.24
1251	0.25
1252	0.26

A0A177VYH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer