FuNGI

A0A177WVT7

Protein Details

Accession

A0A177WVT7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
884-907	SSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 13, cyto 9, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSLYVNEQEVMSPDSQQVKIAEGLIITVLTQDNYTVWANQMEAAFETLDLWESHIIGELPEKIERDYKLKEFKARGILQATVSSKFKFMLCDSNGIQLDARKIWVGLKNHYVDYCERSLTRSEEAMANLQYDPRKGVEELYNTMTSLRHKIAAAKYILGEWRYFEGHTVRWTDEMLSPNKFLSELIEEEIKLINMGALPRHGVDDTIYEANYASRNHRNLRKGSTSHGPNAHGAKQGNSSRDDYFAANHEMDNYYRRDQGRRPYEQRNDDQDRMPACHNCGNIGHYAKDCRPAPRNGNYRQSSPKFFSKGPRSNNQDRSRNNQSADGMFVAMDDKKRDVVIDEACSSIDRSDMFILDSGASSHMVCRPEWVYDFVPCSNRQVKASGQDMHNVIGTGTVEILCNIGHRTVSIQLGNVLVVPTFGVNLISENILEDKGCRISIFKKVRTIRKSNGEVIMTTRRDGGVNAVNCEAIISDEERAMAHATVIATANHASEVFRKPTDTAGWHKRLGHINVEAIKNLADKSEGLDIIPGKTKERSQCVACIEGKAVRHPFPKRSTHVATQVNVLLHMDLEGPFHDTALGGYKYYLIIVDDYSRYSHLYPMISKDQTFQRFKEHVAAVELSKGLPVRAIRTDNGGEFTSSAFQQFLKLKGIAVQRTTPYTPQQNGVAERKNRTIVSAVRAMFAGCKLGREFWAEAAMTAVYLQNRSPNKALGQRTPYELWTGELPKAKAYKLFDLESKKMITSRDVDFAEEEFPSLSNPVRRNNTVPAMTLYEGAPLFTHSYNLRGGVTPSVPIVIDNVVSPKTSETPGNPDCASTPIGGESEPGRRQVPRVVPTARNTARMTVADRGTEVTTSDERITQEELLGRGISRNKAIKTSLNESSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAVQERPVDVMNRDRATMAAPTESTVTADYPGSDIREWVEDLPTITSQDDSDLEESDQYYSYTHGSGTSNADESNNTVAVISDGSSRNIVPETWQQAMMSSDADLWNAVKLVLHYVQGTLSYALELGGTNASLSGYSDADWAGDVKTRKSTSGYLCYVGNALVSWRSSKQTCVAVSTMEAEYTAAESASRELLFLRDLLGELGFEQDGPTTLYCDSQSAISNMIGPSVVHEATKHIGIKINALRDRISQGLIKPEYIGTKDQVADILTKGLPRPAFEQFVNLLGLRECSRRGGVLDIGNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.26
4	0.24
5	0.24
6	0.25
7	0.24
8	0.21
9	0.15
10	0.15
11	0.12
12	0.11
13	0.08
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.11
21	0.13
22	0.12
23	0.13
24	0.14
25	0.14
26	0.17
27	0.17
28	0.15
29	0.14
30	0.15
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.09
35	0.11
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.1
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.18
48	0.19
49	0.2
50	0.25
51	0.27
52	0.3
53	0.34
54	0.4
55	0.47
56	0.52
57	0.59
58	0.58
59	0.62
60	0.66
61	0.62
62	0.6
63	0.53
64	0.5
65	0.43
66	0.45
67	0.4
68	0.35
69	0.34
70	0.29
71	0.27
72	0.26
73	0.25
74	0.23
75	0.24
76	0.29
77	0.29
78	0.34
79	0.34
80	0.41
81	0.4
82	0.37
83	0.35
84	0.28
85	0.3
86	0.25
87	0.25
88	0.18
89	0.18
90	0.22
91	0.28
92	0.29
93	0.31
94	0.38
95	0.4
96	0.41
97	0.42
98	0.39
99	0.36
100	0.37
101	0.34
102	0.3
103	0.27
104	0.27
105	0.3
106	0.31
107	0.31
108	0.26
109	0.26
110	0.25
111	0.27
112	0.29
113	0.25
114	0.23
115	0.2
116	0.23
117	0.23
118	0.21
119	0.21
120	0.19
121	0.21
122	0.2
123	0.24
124	0.26
125	0.29
126	0.31
127	0.34
128	0.33
129	0.3
130	0.31
131	0.28
132	0.24
133	0.25
134	0.23
135	0.21
136	0.21
137	0.29
138	0.32
139	0.38
140	0.36
141	0.33
142	0.31
143	0.31
144	0.34
145	0.28
146	0.24
147	0.19
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.2
154	0.24
155	0.25
156	0.24
157	0.23
158	0.24
159	0.23
160	0.24
161	0.28
162	0.28
163	0.27
164	0.27
165	0.26
166	0.26
167	0.24
168	0.19
169	0.17
170	0.16
171	0.15
172	0.16
173	0.18
174	0.17
175	0.18
176	0.19
177	0.15
178	0.11
179	0.1
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.14
193	0.15
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.14
198	0.16
199	0.16
200	0.19
201	0.25
202	0.31
203	0.39
204	0.47
205	0.53
206	0.56
207	0.62
208	0.65
209	0.59
210	0.59
211	0.6
212	0.58
213	0.57
214	0.55
215	0.5
216	0.46
217	0.48
218	0.45
219	0.41
220	0.37
221	0.32
222	0.36
223	0.38
224	0.37
225	0.36
226	0.36
227	0.31
228	0.32
229	0.32
230	0.24
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.2
235	0.19
236	0.19
237	0.18
238	0.19
239	0.21
240	0.21
241	0.2
242	0.25
243	0.28
244	0.32
245	0.36
246	0.46
247	0.52
248	0.57
249	0.62
250	0.67
251	0.74
252	0.76
253	0.77
254	0.77
255	0.75
256	0.69
257	0.64
258	0.59
259	0.51
260	0.46
261	0.43
262	0.35
263	0.31
264	0.32
265	0.3
266	0.27
267	0.26
268	0.25
269	0.26
270	0.26
271	0.24
272	0.22
273	0.27
274	0.26
275	0.33
276	0.33
277	0.35
278	0.39
279	0.45
280	0.5
281	0.55
282	0.62
283	0.61
284	0.69
285	0.65
286	0.65
287	0.67
288	0.65
289	0.61
290	0.58
291	0.58
292	0.52
293	0.52
294	0.56
295	0.57
296	0.6
297	0.61
298	0.65
299	0.66
300	0.72
301	0.79
302	0.78
303	0.76
304	0.72
305	0.73
306	0.74
307	0.7
308	0.62
309	0.56
310	0.49
311	0.41
312	0.38
313	0.3
314	0.21
315	0.15
316	0.14
317	0.11
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.16
327	0.17
328	0.19
329	0.19
330	0.19
331	0.19
332	0.19
333	0.18
334	0.13
335	0.11
336	0.08
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.09
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.11
351	0.12
352	0.12
353	0.15
354	0.15
355	0.17
356	0.18
357	0.21
358	0.19
359	0.2
360	0.23
361	0.22
362	0.25
363	0.23
364	0.28
365	0.28
366	0.29
367	0.28
368	0.28
369	0.28
370	0.3
371	0.35
372	0.34
373	0.3
374	0.32
375	0.31
376	0.29
377	0.27
378	0.21
379	0.16
380	0.12
381	0.11
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.08
395	0.1
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.1
403	0.08
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.12
427	0.22
428	0.3
429	0.32
430	0.4
431	0.47
432	0.56
433	0.62
434	0.66
435	0.63
436	0.64
437	0.66
438	0.61
439	0.58
440	0.5
441	0.42
442	0.39
443	0.39
444	0.31
445	0.26
446	0.23
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.17
452	0.17
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.16
458	0.13
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.09
482	0.13
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.16
487	0.18
488	0.2
489	0.2
490	0.24
491	0.31
492	0.34
493	0.36
494	0.36
495	0.39
496	0.43
497	0.41
498	0.37
499	0.3
500	0.29
501	0.31
502	0.31
503	0.26
504	0.2
505	0.18
506	0.15
507	0.13
508	0.1
509	0.06
510	0.06
511	0.07
512	0.09
513	0.09
514	0.08
515	0.1
516	0.1
517	0.11
518	0.15
519	0.13
520	0.13
521	0.15
522	0.19
523	0.21
524	0.26
525	0.29
526	0.27
527	0.31
528	0.31
529	0.34
530	0.31
531	0.27
532	0.22
533	0.21
534	0.2
535	0.2
536	0.21
537	0.2
538	0.25
539	0.28
540	0.34
541	0.38
542	0.44
543	0.44
544	0.48
545	0.49
546	0.47
547	0.52
548	0.49
549	0.43
550	0.39
551	0.37
552	0.29
553	0.24
554	0.2
555	0.12
556	0.08
557	0.08
558	0.06
559	0.04
560	0.05
561	0.05
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.1
569	0.1
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.04
577	0.04
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.09
586	0.1
587	0.1
588	0.11
589	0.12
590	0.15
591	0.2
592	0.19
593	0.19
594	0.21
595	0.25
596	0.31
597	0.33
598	0.29
599	0.32
600	0.32
601	0.33
602	0.36
603	0.31
604	0.24
605	0.24
606	0.24
607	0.17
608	0.16
609	0.15
610	0.09
611	0.09
612	0.08
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.09
617	0.12
618	0.14
619	0.14
620	0.17
621	0.18
622	0.17
623	0.18
624	0.16
625	0.13
626	0.11
627	0.12
628	0.09
629	0.08
630	0.08
631	0.06
632	0.06
633	0.1
634	0.12
635	0.13
636	0.15
637	0.15
638	0.14
639	0.19
640	0.24
641	0.22
642	0.21
643	0.22
644	0.2
645	0.23
646	0.24
647	0.21
648	0.21
649	0.24
650	0.24
651	0.23
652	0.25
653	0.25
654	0.28
655	0.31
656	0.33
657	0.31
658	0.33
659	0.34
660	0.34
661	0.31
662	0.28
663	0.27
664	0.23
665	0.23
666	0.26
667	0.24
668	0.21
669	0.21
670	0.2
671	0.17
672	0.14
673	0.14
674	0.08
675	0.09
676	0.09
677	0.1
678	0.12
679	0.14
680	0.15
681	0.12
682	0.14
683	0.13
684	0.12
685	0.12
686	0.11
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.05
691	0.06
692	0.06
693	0.12
694	0.14
695	0.17
696	0.18
697	0.19
698	0.22
699	0.29
700	0.32
701	0.32
702	0.36
703	0.34
704	0.37
705	0.36
706	0.33
707	0.28
708	0.24
709	0.19
710	0.17
711	0.18
712	0.17
713	0.19
714	0.19
715	0.2
716	0.22
717	0.21
718	0.22
719	0.23
720	0.25
721	0.25
722	0.26
723	0.28
724	0.32
725	0.34
726	0.32
727	0.3
728	0.25
729	0.24
730	0.23
731	0.21
732	0.19
733	0.19
734	0.22
735	0.21
736	0.21
737	0.2
738	0.2
739	0.19
740	0.15
741	0.13
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.09
747	0.12
748	0.16
749	0.22
750	0.27
751	0.29
752	0.32
753	0.36
754	0.4
755	0.35
756	0.34
757	0.29
758	0.27
759	0.25
760	0.23
761	0.18
762	0.15
763	0.13
764	0.12
765	0.1
766	0.09
767	0.1
768	0.09
769	0.11
770	0.09
771	0.12
772	0.12
773	0.13
774	0.13
775	0.11
776	0.12
777	0.13
778	0.13
779	0.11
780	0.11
781	0.1
782	0.09
783	0.08
784	0.08
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.08
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.09
793	0.1
794	0.11
795	0.13
796	0.13
797	0.21
798	0.22
799	0.26
800	0.24
801	0.23
802	0.22
803	0.22
804	0.22
805	0.14
806	0.13
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.1
812	0.15
813	0.16
814	0.18
815	0.19
816	0.19
817	0.21
818	0.28
819	0.33
820	0.31
821	0.36
822	0.4
823	0.43
824	0.45
825	0.54
826	0.48
827	0.46
828	0.43
829	0.38
830	0.35
831	0.32
832	0.32
833	0.27
834	0.26
835	0.21
836	0.21
837	0.2
838	0.18
839	0.17
840	0.14
841	0.13
842	0.12
843	0.14
844	0.14
845	0.15
846	0.15
847	0.16
848	0.18
849	0.15
850	0.15
851	0.16
852	0.15
853	0.14
854	0.14
855	0.12
856	0.14
857	0.17
858	0.17
859	0.2
860	0.25
861	0.25
862	0.28
863	0.3
864	0.33
865	0.35
866	0.39
867	0.39
868	0.35
869	0.35
870	0.32
871	0.32
872	0.3
873	0.26
874	0.22
875	0.21
876	0.27
877	0.36
878	0.44
879	0.52
880	0.56
881	0.65
882	0.71
883	0.77
884	0.81
885	0.8
886	0.8
887	0.81
888	0.83
889	0.79
890	0.77
891	0.76
892	0.74
893	0.71
894	0.7
895	0.65
896	0.56
897	0.54
898	0.51
899	0.45
900	0.37
901	0.39
902	0.38
903	0.33
904	0.31
905	0.27
906	0.24
907	0.24
908	0.24
909	0.18
910	0.13
911	0.12
912	0.13
913	0.14
914	0.14
915	0.13
916	0.11
917	0.1
918	0.1
919	0.1
920	0.09
921	0.09
922	0.1
923	0.12
924	0.11
925	0.11
926	0.11
927	0.13
928	0.14
929	0.13
930	0.14
931	0.12
932	0.13
933	0.15
934	0.14
935	0.13
936	0.12
937	0.12
938	0.1
939	0.11
940	0.11
941	0.11
942	0.12
943	0.12
944	0.12
945	0.12
946	0.13
947	0.12
948	0.12
949	0.1
950	0.09
951	0.09
952	0.1
953	0.1
954	0.09
955	0.11
956	0.11
957	0.14
958	0.17
959	0.17
960	0.17
961	0.17
962	0.18
963	0.16
964	0.16
965	0.17
966	0.13
967	0.11
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.1
972	0.09
973	0.1
974	0.11
975	0.13
976	0.14
977	0.13
978	0.14
979	0.15
980	0.14
981	0.14
982	0.2
983	0.24
984	0.25
985	0.26
986	0.24
987	0.25
988	0.26
989	0.22
990	0.15
991	0.11
992	0.11
993	0.1
994	0.11
995	0.1
996	0.09
997	0.09
998	0.09
999	0.08
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.12
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.14
1008	0.13
1009	0.14
1010	0.11
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.08
1014	0.07
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.06
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.05
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.05
1024	0.06
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.08
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.12
1035	0.13
1036	0.15
1037	0.23
1038	0.24
1039	0.26
1040	0.29
1041	0.34
1042	0.37
1043	0.44
1044	0.44
1045	0.39
1046	0.38
1047	0.37
1048	0.34
1049	0.27
1050	0.2
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.11
1055	0.14
1056	0.15
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.24
1060	0.28
1061	0.32
1062	0.32
1063	0.33
1064	0.32
1065	0.28
1066	0.28
1067	0.28
1068	0.23
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.11
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.06
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.1
1082	0.1
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.09
1088	0.1
1089	0.11
1090	0.1
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.1
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.07
1098	0.08
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.1
1102	0.1
1103	0.12
1104	0.13
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.14
1108	0.16
1109	0.15
1110	0.17
1111	0.16
1112	0.18
1113	0.17
1114	0.17
1115	0.15
1116	0.12
1117	0.13
1118	0.15
1119	0.15
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.16
1123	0.18
1124	0.23
1125	0.22
1126	0.2
1127	0.25
1128	0.25
1129	0.34
1130	0.36
1131	0.42
1132	0.41
1133	0.42
1134	0.42
1135	0.39
1136	0.43
1137	0.37
1138	0.34
1139	0.29
1140	0.28
1141	0.36
1142	0.36
1143	0.33
1144	0.3
1145	0.3
1146	0.32
1147	0.31
1148	0.31
1149	0.24
1150	0.27
1151	0.27
1152	0.26
1153	0.25
1154	0.23
1155	0.21
1156	0.19
1157	0.2
1158	0.16
1159	0.18
1160	0.18
1161	0.23
1162	0.23
1163	0.23
1164	0.27
1165	0.29
1166	0.33
1167	0.31
1168	0.35
1169	0.31
1170	0.32
1171	0.31
1172	0.27
1173	0.22
1174	0.18
1175	0.21
1176	0.19
1177	0.21
1178	0.2
1179	0.22
1180	0.23
1181	0.24
1182	0.25
1183	0.26
1184	0.29

A0A177WVT7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer