Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WZK0

Protein Details
Accession A0A177WZK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-354IQQQKITIRRKGKAKKIKGRTKTGTNRLTKHydrophilic
393-419NGVGKTTKTLKFNKKFHNLKRHGTSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-346IRRKGKAKKIKGRTK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 6.5, cyto_nucl 6, nucl 4.5, extr 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MTAELAKVKIFLQLVYYFCNASYHSTISSLPKSFVDSPLLAQGWIPLRDLATFKKMKGLITQPADIAESIIYSSSELFELSVDGVYLRRKTEFVASKVFKEMFNISLLAGYAMEAVGFDQLVTVVEVEAYFSRFGEIQNVSKHIGISTWDERYNLSFFIEFKELDSMIKSLAATHMYEDSSIQVRAHRKPDVSAAMVVISQAGSTYPKGKIVEFKLVSDVIESVEQYSIQEQFEKYATVAMIDYVKGNATGYIEFKQSVALEAISVIFNNGGLHIQGEPIQLRALVEDEEQMYWMVKAEKQMIQGPNRISVLDLAHAAKFSKQAIQQQKITIRRKGKAKKIKGRTKTGTNRLTKYHSREIKDCDSKLTDTAKSTNIHIDETVLSALGVKHGKNGVGKTTKTLKFNKKFHNLKRHGTSDSNAMQNLLEGFDRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.26
4 0.22
5 0.21
6 0.23
7 0.19
8 0.21
9 0.23
10 0.21
11 0.21
12 0.22
13 0.25
14 0.29
15 0.34
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.32
20 0.33
21 0.33
22 0.32
23 0.27
24 0.27
25 0.31
26 0.31
27 0.25
28 0.22
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.23
33 0.18
34 0.18
35 0.2
36 0.23
37 0.23
38 0.26
39 0.28
40 0.27
41 0.34
42 0.35
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.42
47 0.43
48 0.45
49 0.37
50 0.36
51 0.36
52 0.28
53 0.22
54 0.13
55 0.09
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.17
78 0.26
79 0.32
80 0.32
81 0.4
82 0.41
83 0.41
84 0.46
85 0.45
86 0.36
87 0.32
88 0.3
89 0.21
90 0.21
91 0.19
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.1
96 0.08
97 0.07
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.23
129 0.23
130 0.17
131 0.16
132 0.13
133 0.17
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.2
139 0.22
140 0.21
141 0.16
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.13
171 0.18
172 0.22
173 0.26
174 0.28
175 0.27
176 0.27
177 0.31
178 0.3
179 0.26
180 0.22
181 0.18
182 0.15
183 0.15
184 0.13
185 0.09
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.05
192 0.08
193 0.08
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.19
198 0.2
199 0.29
200 0.26
201 0.26
202 0.25
203 0.24
204 0.23
205 0.18
206 0.15
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.12
285 0.15
286 0.18
287 0.2
288 0.27
289 0.31
290 0.33
291 0.37
292 0.36
293 0.36
294 0.34
295 0.31
296 0.24
297 0.21
298 0.18
299 0.14
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.16
309 0.19
310 0.28
311 0.37
312 0.43
313 0.45
314 0.49
315 0.56
316 0.61
317 0.64
318 0.63
319 0.61
320 0.62
321 0.68
322 0.72
323 0.75
324 0.76
325 0.81
326 0.83
327 0.86
328 0.9
329 0.88
330 0.89
331 0.86
332 0.85
333 0.85
334 0.84
335 0.83
336 0.8
337 0.75
338 0.69
339 0.7
340 0.67
341 0.65
342 0.65
343 0.63
344 0.61
345 0.63
346 0.65
347 0.68
348 0.68
349 0.61
350 0.57
351 0.53
352 0.49
353 0.48
354 0.45
355 0.38
356 0.33
357 0.35
358 0.35
359 0.32
360 0.32
361 0.34
362 0.31
363 0.29
364 0.26
365 0.24
366 0.2
367 0.2
368 0.18
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.13
374 0.15
375 0.13
376 0.18
377 0.2
378 0.23
379 0.27
380 0.29
381 0.34
382 0.38
383 0.39
384 0.41
385 0.5
386 0.52
387 0.54
388 0.62
389 0.64
390 0.67
391 0.76
392 0.79
393 0.8
394 0.85
395 0.88
396 0.9
397 0.86
398 0.86
399 0.86
400 0.81
401 0.76
402 0.7
403 0.62
404 0.59
405 0.57
406 0.51
407 0.42
408 0.37
409 0.31
410 0.28
411 0.27
412 0.19