Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2WS80

Protein Details
Accession G2WS80    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-49GPNHPTPRPGSSRGKRKGRPRGARTLALAHydrophilic
412-433QEAFRRLQQRPKKIRAMLNGSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-43TPRPGSSRGKRKGRPRGA
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 9, mito 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG vda:VDAG_00413  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSGISNQGLIDFPAGATSKSGPNHPTPRPGSSRGKRKGRPRGARTLALACSQAQQEAGELFQTAFDDTVGACFHSGFQSIDNVAVSTDGPPPRDLTTEPQELTLFYHDMEIHLNDICFLSDDSFLFDEETAEDFRMMYVSGETAEPSVETTNIIEGIVREQVVELLKQCTDQAARRGSRSININDLIFQIRHDTAKVSRLRTFLSWKDVRKNVKDSDDKGGDADLGAGEDPVGGVAAGGPVDDAAKKNKKAKVGLPWEPSSFYPVDVPERDDEEDEEEEEMNFITLQRLRKADERTKAMTKEEYVTWSEYRQASFTYRKGKRFREWAGFGIVTDSKPSDDIVDILGFLTFEMVQTLTEGALKVKEQEDLVKAQSGGGGGVDGEGASKKRKAQQGLFDPPSEGKTPIEPRHVQEAFRRLQQRPKKIRAMLNGSRLPIHTNLNII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.15
5 0.19
6 0.21
7 0.26
8 0.28
9 0.36
10 0.45
11 0.48
12 0.55
13 0.55
14 0.61
15 0.62
16 0.66
17 0.68
18 0.69
19 0.75
20 0.75
21 0.81
22 0.81
23 0.85
24 0.89
25 0.89
26 0.9
27 0.87
28 0.88
29 0.84
30 0.81
31 0.75
32 0.7
33 0.61
34 0.52
35 0.45
36 0.35
37 0.31
38 0.26
39 0.22
40 0.17
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.14
75 0.15
76 0.17
77 0.17
78 0.19
79 0.2
80 0.22
81 0.23
82 0.24
83 0.29
84 0.33
85 0.32
86 0.32
87 0.3
88 0.28
89 0.28
90 0.24
91 0.17
92 0.12
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.15
159 0.2
160 0.26
161 0.28
162 0.29
163 0.32
164 0.3
165 0.32
166 0.35
167 0.3
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.23
172 0.24
173 0.21
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.19
183 0.23
184 0.24
185 0.26
186 0.27
187 0.29
188 0.29
189 0.33
190 0.28
191 0.32
192 0.34
193 0.34
194 0.39
195 0.44
196 0.47
197 0.47
198 0.5
199 0.45
200 0.48
201 0.5
202 0.45
203 0.46
204 0.42
205 0.37
206 0.32
207 0.28
208 0.2
209 0.15
210 0.12
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.12
232 0.17
233 0.22
234 0.29
235 0.32
236 0.37
237 0.4
238 0.45
239 0.48
240 0.51
241 0.55
242 0.53
243 0.53
244 0.48
245 0.46
246 0.41
247 0.34
248 0.26
249 0.18
250 0.15
251 0.13
252 0.17
253 0.16
254 0.18
255 0.15
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.07
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.18
276 0.2
277 0.26
278 0.34
279 0.39
280 0.43
281 0.47
282 0.49
283 0.53
284 0.52
285 0.49
286 0.43
287 0.38
288 0.33
289 0.29
290 0.26
291 0.23
292 0.24
293 0.22
294 0.2
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.19
300 0.21
301 0.26
302 0.3
303 0.36
304 0.41
305 0.49
306 0.57
307 0.63
308 0.65
309 0.69
310 0.71
311 0.7
312 0.67
313 0.61
314 0.58
315 0.5
316 0.42
317 0.36
318 0.3
319 0.21
320 0.18
321 0.16
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.18
354 0.2
355 0.21
356 0.23
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.2
361 0.16
362 0.13
363 0.1
364 0.08
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.06
371 0.08
372 0.12
373 0.15
374 0.21
375 0.28
376 0.36
377 0.44
378 0.5
379 0.59
380 0.65
381 0.72
382 0.71
383 0.64
384 0.59
385 0.52
386 0.48
387 0.4
388 0.31
389 0.22
390 0.26
391 0.34
392 0.38
393 0.45
394 0.46
395 0.47
396 0.56
397 0.57
398 0.52
399 0.51
400 0.54
401 0.49
402 0.54
403 0.57
404 0.51
405 0.6
406 0.67
407 0.7
408 0.72
409 0.77
410 0.79
411 0.8
412 0.84
413 0.83
414 0.83
415 0.8
416 0.79
417 0.74
418 0.66
419 0.6
420 0.53
421 0.46
422 0.4
423 0.37