Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WQJ2

Protein Details
Accession A0A177WQJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-310DDDRSRNRSRRSRSPSSEREEYRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSDQPYERKNIHGTNPQFLIEKILRERIYESAYWKEKLFGVSAETLLDRAVELQAIGGQFGSQKPTEFICLALKILQLQPDDEIITLFLTNSDFKYLTALAAFYIRLTESHSQVYRRLEPLLQDRRKLRRRTNDLLLEDRMCDTILPRLTKRYILEDQGDLEPRASPLDMELDDLDAEESIQSLDDFQQHSDEKPHTKDVRVVSSNSSPILHHKSDVTKRIKTNEDDRSTRHEARSSDRTQYQGRSSYRENKGDYESSRRSYRDERDERDRRSYRDERDRRSRSAYHDDDRSRNRSRRSRSPSSEREEYRRNSRTKTNGLDGHSNENQDTHNGKVGRSEAFDSNLKSANSIDAASSHGSRVKHTWSRKRVDALFKKPGSKKPDAGSTQQVEKSGGGGSEVLSVDEANKIRASLGLKPLQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.53
4 0.47
5 0.4
6 0.4
7 0.32
8 0.34
9 0.32
10 0.38
11 0.36
12 0.37
13 0.39
14 0.35
15 0.37
16 0.33
17 0.33
18 0.35
19 0.39
20 0.39
21 0.37
22 0.36
23 0.34
24 0.33
25 0.31
26 0.22
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.17
32 0.15
33 0.13
34 0.12
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.1
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.15
52 0.16
53 0.2
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.19
63 0.21
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.14
70 0.13
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.11
95 0.14
96 0.15
97 0.21
98 0.24
99 0.25
100 0.29
101 0.34
102 0.34
103 0.32
104 0.32
105 0.28
106 0.3
107 0.38
108 0.45
109 0.43
110 0.45
111 0.51
112 0.59
113 0.67
114 0.71
115 0.71
116 0.71
117 0.76
118 0.77
119 0.79
120 0.77
121 0.72
122 0.68
123 0.61
124 0.51
125 0.42
126 0.35
127 0.26
128 0.18
129 0.14
130 0.1
131 0.13
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.24
136 0.25
137 0.29
138 0.29
139 0.31
140 0.3
141 0.3
142 0.31
143 0.27
144 0.28
145 0.27
146 0.27
147 0.21
148 0.18
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.07
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.22
182 0.29
183 0.28
184 0.28
185 0.33
186 0.32
187 0.36
188 0.34
189 0.33
190 0.28
191 0.29
192 0.28
193 0.24
194 0.21
195 0.14
196 0.17
197 0.21
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.24
202 0.29
203 0.38
204 0.39
205 0.38
206 0.4
207 0.45
208 0.48
209 0.44
210 0.48
211 0.48
212 0.48
213 0.45
214 0.45
215 0.48
216 0.5
217 0.5
218 0.43
219 0.38
220 0.34
221 0.38
222 0.44
223 0.39
224 0.38
225 0.36
226 0.38
227 0.37
228 0.38
229 0.36
230 0.36
231 0.34
232 0.34
233 0.37
234 0.43
235 0.47
236 0.48
237 0.46
238 0.41
239 0.44
240 0.44
241 0.41
242 0.4
243 0.37
244 0.36
245 0.38
246 0.36
247 0.37
248 0.4
249 0.45
250 0.47
251 0.51
252 0.53
253 0.6
254 0.67
255 0.67
256 0.71
257 0.67
258 0.6
259 0.62
260 0.63
261 0.62
262 0.65
263 0.69
264 0.67
265 0.74
266 0.76
267 0.71
268 0.7
269 0.66
270 0.62
271 0.63
272 0.61
273 0.54
274 0.57
275 0.57
276 0.58
277 0.6
278 0.6
279 0.59
280 0.59
281 0.63
282 0.64
283 0.68
284 0.71
285 0.74
286 0.77
287 0.77
288 0.81
289 0.81
290 0.79
291 0.8
292 0.73
293 0.71
294 0.69
295 0.65
296 0.65
297 0.65
298 0.61
299 0.57
300 0.61
301 0.62
302 0.62
303 0.62
304 0.6
305 0.57
306 0.57
307 0.59
308 0.53
309 0.52
310 0.46
311 0.42
312 0.34
313 0.3
314 0.27
315 0.24
316 0.24
317 0.18
318 0.23
319 0.22
320 0.22
321 0.25
322 0.26
323 0.24
324 0.25
325 0.27
326 0.22
327 0.25
328 0.28
329 0.26
330 0.27
331 0.29
332 0.27
333 0.24
334 0.22
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.14
339 0.1
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.23
348 0.29
349 0.36
350 0.46
351 0.55
352 0.6
353 0.68
354 0.71
355 0.76
356 0.74
357 0.77
358 0.77
359 0.75
360 0.76
361 0.73
362 0.76
363 0.75
364 0.75
365 0.73
366 0.7
367 0.67
368 0.63
369 0.68
370 0.64
371 0.63
372 0.63
373 0.59
374 0.59
375 0.55
376 0.5
377 0.42
378 0.37
379 0.33
380 0.25
381 0.2
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.16
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.19
398 0.21
399 0.23
400 0.31