Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WCF4

Protein Details
Accession A0A177WCF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-395NTATTKSEKDRHSKKKRKIDTVNDAKIQHydrophilic
477-497KSIYTKTSQQHQDKMKRLKLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-385DRHSKKKRK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MTATLLSFNVVNRHNLSTLSLTINHILSRAHHVALDAEFTGLGDPQLTRQRVLSVEILGFKSLSKHLMALNPNVNIEDRYRELANVARTHALVAFGLSIFEQPDPKHHPEQFTVNTFQFTMLSCKEHRVNPSSLAFLAEHKFDFNDQISNGIPYMPGNDIAGETDSGLNAIMRSILNQIIIGKIPTVVHNGLLDSMFVYQSFYAELPKDLTMFIADLNGMFRGGIYDTKYVSEFVTRESRTFLSYLFRKYERIQLQRQKANAPPYLTLAVKNRIQHKYTLTTSTLAELGLVSNPTASNKAGGKNKSQKAKNMYVSNRPYCEQYAAHGFCSLYSACAKSHDLDMILDWEEKDIAAAHGGQKVLLEKADNTATTKSEKDRHSKKKRKIDTVNDAKIQSEQTPNLASLATETVSEKLVDSSPKPPVGPAPIFETYHSACFDAYMTGFIFCHQCLECPNLMKEHGDRLYLIGKDMPIRVEKSIYTKTSQQHQDKMKRLKLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.29
4 0.26
5 0.26
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.25
10 0.25
11 0.22
12 0.2
13 0.18
14 0.17
15 0.24
16 0.24
17 0.22
18 0.21
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.12
33 0.21
34 0.22
35 0.23
36 0.24
37 0.27
38 0.27
39 0.31
40 0.27
41 0.22
42 0.23
43 0.25
44 0.25
45 0.22
46 0.21
47 0.17
48 0.18
49 0.17
50 0.17
51 0.14
52 0.15
53 0.17
54 0.24
55 0.27
56 0.31
57 0.34
58 0.33
59 0.33
60 0.32
61 0.3
62 0.25
63 0.23
64 0.22
65 0.19
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.21
70 0.24
71 0.29
72 0.26
73 0.26
74 0.24
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.19
79 0.13
80 0.11
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.11
89 0.1
90 0.17
91 0.24
92 0.3
93 0.37
94 0.4
95 0.43
96 0.44
97 0.52
98 0.5
99 0.48
100 0.47
101 0.39
102 0.37
103 0.33
104 0.3
105 0.23
106 0.18
107 0.18
108 0.15
109 0.18
110 0.18
111 0.23
112 0.27
113 0.3
114 0.35
115 0.36
116 0.37
117 0.38
118 0.39
119 0.35
120 0.32
121 0.29
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.13
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.14
138 0.11
139 0.1
140 0.07
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.1
221 0.12
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.2
226 0.2
227 0.19
228 0.19
229 0.17
230 0.15
231 0.18
232 0.2
233 0.21
234 0.21
235 0.23
236 0.24
237 0.32
238 0.34
239 0.38
240 0.44
241 0.49
242 0.56
243 0.58
244 0.58
245 0.53
246 0.49
247 0.49
248 0.43
249 0.36
250 0.29
251 0.27
252 0.28
253 0.24
254 0.23
255 0.2
256 0.21
257 0.22
258 0.25
259 0.3
260 0.32
261 0.33
262 0.34
263 0.34
264 0.36
265 0.35
266 0.35
267 0.29
268 0.26
269 0.25
270 0.23
271 0.19
272 0.13
273 0.11
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.11
286 0.17
287 0.23
288 0.26
289 0.34
290 0.42
291 0.48
292 0.54
293 0.55
294 0.56
295 0.58
296 0.64
297 0.62
298 0.6
299 0.59
300 0.6
301 0.65
302 0.62
303 0.56
304 0.49
305 0.45
306 0.37
307 0.36
308 0.27
309 0.22
310 0.27
311 0.26
312 0.25
313 0.24
314 0.22
315 0.19
316 0.21
317 0.18
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.1
322 0.13
323 0.15
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.12
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.18
359 0.21
360 0.23
361 0.29
362 0.34
363 0.42
364 0.51
365 0.61
366 0.7
367 0.78
368 0.83
369 0.86
370 0.9
371 0.91
372 0.9
373 0.9
374 0.89
375 0.9
376 0.86
377 0.8
378 0.7
379 0.6
380 0.51
381 0.43
382 0.35
383 0.3
384 0.23
385 0.22
386 0.23
387 0.22
388 0.21
389 0.19
390 0.15
391 0.11
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.16
403 0.17
404 0.22
405 0.27
406 0.29
407 0.28
408 0.28
409 0.3
410 0.34
411 0.34
412 0.31
413 0.32
414 0.33
415 0.34
416 0.34
417 0.34
418 0.28
419 0.29
420 0.28
421 0.22
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.12
432 0.13
433 0.11
434 0.15
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.23
439 0.25
440 0.28
441 0.31
442 0.3
443 0.31
444 0.34
445 0.33
446 0.36
447 0.34
448 0.31
449 0.29
450 0.28
451 0.33
452 0.29
453 0.28
454 0.22
455 0.22
456 0.24
457 0.25
458 0.25
459 0.24
460 0.27
461 0.27
462 0.27
463 0.28
464 0.32
465 0.38
466 0.38
467 0.38
468 0.42
469 0.46
470 0.53
471 0.61
472 0.61
473 0.62
474 0.7
475 0.75
476 0.79
477 0.84