FuNGI

A0A177WX34

Protein Details

Accession

A0A177WX34

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
177-196	TYYRRDQGRRPYEQRNDDQD	Hydrophilic
225-244	QSSPKFFSKGPRSNNQDRSR	Hydrophilic
847-870	SSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, nucl 8.5, mito 5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MKYSSTPGKSGSDSRIHYVDFCERSPTRSEEAMANLQYDPRMGVEELYITMTSLRHKIAAANIFWGEKVFASRVMAKLVSKSREWRYFEGHTVRWTDEMLSPNKFLSELIEEEIKLINMGALPRHGVDDTIYEANYASRNHRNLRKGSTSHGPNAHGAKQGNSSRDDYFAANHEMDTYYRRDQGRRPYEQRNDDQDRMPACHNCGNIGHYAKDCRPAPRNGNYRQSSPKFFSKGPRSNNQDRSRNNQSADGMFVAMDNKKRDIVIDEACNSIDRSDMFILDSGASSHMVCRPEWVYDFVPCSNRQVKASGQDMHNVIGTGTVEILCNVGHRTVSIQLGNVLVVPTFGVNLISENILEDKGCRISIFKKVRTIRKSNGEVIMTTRRDGGVNAVNCEAIISDEERAMAHNTVIATANHASEVFRKPTDTAGWHKRLGHINVESIKNLADKSEGLDIIPGKTKERSQCVACIKGKAVRHPFPKRSTHVATQVNVLLHMDLEGPFHDTALGGYKYYLIIVDDYSRYSHLYPMISKDQTFQRFKEHVAAVELSKGLPVRAIRTDNGGEFTSSAFQQFLKLKGIAVQRTTPYTPQQNGVAERKNRTIVSAVRAMFAGCKLGREFWAEAAMTAVYLQNRSPNKALGQRTPYELWTGELPKVMHLRTFGCAAYALRPKQLLAKLDTRTRRCIFIGYHSQAKAYKLFELEGKKMITSRDVEFAEEEFPSLSNPVRRSNAVQVMTLYEGAPLFTHSYNLGGVTPSVPIAIDNVVSPKTPETPGNPGNPDCASTPIGGESEPGRRQVPRVVPTAMNTARMTVPDRGTEVTTSDERITQELLGRGISRNKAIKTSLNESSLAGYRKPNQKPRSKSQGSRKAVQERPVDVMNRDRATMTAPTESTVTADYPGAISETADASEPSIQAAVEQRMVEDLPTNTSQDDSDLEESDQYYSYTHGSGTSNADELNNAVAVISNGSSRNIVPETWQQAMMSSDADLWNAVKLILHYVQGTLSYALELGGTNASLSGYSDADWAGDVKTRKSTSGYLCYVGNALVSWRSSKQTCVAVSTMEAEYTAAESASRELLFLRDLLGELGFKQDGPTTLYCDSQSAISNMIEPSVVHEATKHIGIKINALRDRISQGLIKPEYIGTKDQVADILTKGLPRPAFEQFVNLLGLRECSRRGGVLDIGNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.45
3	0.42
4	0.39
5	0.39
6	0.4
7	0.36
8	0.33
9	0.37
10	0.35
11	0.37
12	0.41
13	0.42
14	0.38
15	0.37
16	0.38
17	0.33
18	0.38
19	0.42
20	0.37
21	0.34
22	0.29
23	0.28
24	0.27
25	0.23
26	0.18
27	0.12
28	0.14
29	0.13
30	0.13
31	0.12
32	0.13
33	0.14
34	0.15
35	0.14
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.15
40	0.17
41	0.18
42	0.17
43	0.18
44	0.21
45	0.27
46	0.32
47	0.29
48	0.3
49	0.31
50	0.3
51	0.29
52	0.27
53	0.2
54	0.14
55	0.16
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.21
60	0.22
61	0.25
62	0.26
63	0.24
64	0.3
65	0.36
66	0.36
67	0.37
68	0.44
69	0.49
70	0.56
71	0.61
72	0.58
73	0.58
74	0.59
75	0.63
76	0.62
77	0.56
78	0.52
79	0.49
80	0.46
81	0.39
82	0.35
83	0.29
84	0.26
85	0.3
86	0.3
87	0.29
88	0.29
89	0.28
90	0.28
91	0.26
92	0.21
93	0.18
94	0.18
95	0.16
96	0.18
97	0.2
98	0.19
99	0.2
100	0.21
101	0.17
102	0.13
103	0.11
104	0.09
105	0.08
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.12
110	0.12
111	0.14
112	0.14
113	0.13
114	0.12
115	0.13
116	0.16
117	0.16
118	0.16
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.18
123	0.18
124	0.2
125	0.26
126	0.33
127	0.41
128	0.49
129	0.56
130	0.59
131	0.65
132	0.68
133	0.62
134	0.62
135	0.63
136	0.61
137	0.6
138	0.58
139	0.52
140	0.49
141	0.51
142	0.48
143	0.44
144	0.39
145	0.35
146	0.38
147	0.41
148	0.39
149	0.38
150	0.38
151	0.33
152	0.35
153	0.34
154	0.26
155	0.24
156	0.24
157	0.25
158	0.22
159	0.2
160	0.19
161	0.18
162	0.18
163	0.19
164	0.2
165	0.2
166	0.25
167	0.29
168	0.32
169	0.38
170	0.48
171	0.55
172	0.6
173	0.64
174	0.68
175	0.75
176	0.79
177	0.8
178	0.79
179	0.77
180	0.71
181	0.66
182	0.61
183	0.54
184	0.49
185	0.45
186	0.38
187	0.34
188	0.35
189	0.33
190	0.3
191	0.28
192	0.27
193	0.29
194	0.28
195	0.26
196	0.25
197	0.3
198	0.29
199	0.36
200	0.36
201	0.38
202	0.42
203	0.48
204	0.53
205	0.58
206	0.65
207	0.64
208	0.72
209	0.68
210	0.68
211	0.7
212	0.67
213	0.64
214	0.6
215	0.61
216	0.55
217	0.55
218	0.59
219	0.6
220	0.63
221	0.64
222	0.68
223	0.68
224	0.74
225	0.81
226	0.8
227	0.78
228	0.74
229	0.75
230	0.75
231	0.72
232	0.64
233	0.58
234	0.51
235	0.43
236	0.41
237	0.33
238	0.23
239	0.17
240	0.16
241	0.14
242	0.14
243	0.18
244	0.18
245	0.18
246	0.19
247	0.19
248	0.2
249	0.21
250	0.23
251	0.24
252	0.26
253	0.26
254	0.26
255	0.27
256	0.26
257	0.23
258	0.18
259	0.14
260	0.1
261	0.13
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.12
268	0.11
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.12
275	0.13
276	0.13
277	0.16
278	0.16
279	0.18
280	0.2
281	0.23
282	0.21
283	0.22
284	0.25
285	0.24
286	0.27
287	0.25
288	0.3
289	0.31
290	0.31
291	0.3
292	0.3
293	0.3
294	0.33
295	0.37
296	0.36
297	0.32
298	0.34
299	0.33
300	0.31
301	0.29
302	0.23
303	0.17
304	0.13
305	0.12
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.09
319	0.11
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.09
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.11
350	0.13
351	0.24
352	0.32
353	0.34
354	0.41
355	0.49
356	0.58
357	0.64
358	0.68
359	0.66
360	0.67
361	0.68
362	0.64
363	0.61
364	0.52
365	0.45
366	0.42
367	0.42
368	0.33
369	0.28
370	0.25
371	0.2
372	0.2
373	0.19
374	0.19
375	0.18
376	0.19
377	0.2
378	0.2
379	0.19
380	0.18
381	0.18
382	0.14
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.11
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.12
406	0.16
407	0.16
408	0.16
409	0.17
410	0.17
411	0.2
412	0.22
413	0.22
414	0.26
415	0.33
416	0.37
417	0.38
418	0.39
419	0.42
420	0.45
421	0.44
422	0.41
423	0.33
424	0.34
425	0.35
426	0.36
427	0.3
428	0.24
429	0.23
430	0.17
431	0.16
432	0.12
433	0.08
434	0.07
435	0.09
436	0.11
437	0.1
438	0.09
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.16
446	0.21
447	0.24
448	0.29
449	0.32
450	0.29
451	0.36
452	0.39
453	0.45
454	0.43
455	0.4
456	0.36
457	0.37
458	0.37
459	0.38
460	0.41
461	0.4
462	0.48
463	0.55
464	0.6
465	0.62
466	0.67
467	0.63
468	0.63
469	0.61
470	0.55
471	0.55
472	0.52
473	0.46
474	0.41
475	0.39
476	0.31
477	0.26
478	0.22
479	0.13
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.11
493	0.11
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.09
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.07
504	0.07
505	0.08
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.09
510	0.11
511	0.11
512	0.12
513	0.13
514	0.17
515	0.21
516	0.21
517	0.21
518	0.23
519	0.27
520	0.33
521	0.35
522	0.31
523	0.33
524	0.34
525	0.35
526	0.38
527	0.32
528	0.25
529	0.25
530	0.25
531	0.17
532	0.17
533	0.16
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.06
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.12
542	0.14
543	0.14
544	0.17
545	0.18
546	0.17
547	0.19
548	0.16
549	0.13
550	0.11
551	0.12
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.06
556	0.06
557	0.1
558	0.11
559	0.13
560	0.14
561	0.14
562	0.14
563	0.19
564	0.23
565	0.21
566	0.21
567	0.21
568	0.19
569	0.22
570	0.23
571	0.19
572	0.19
573	0.22
574	0.22
575	0.21
576	0.23
577	0.23
578	0.25
579	0.28
580	0.31
581	0.29
582	0.3
583	0.31
584	0.31
585	0.29
586	0.26
587	0.25
588	0.21
589	0.21
590	0.24
591	0.22
592	0.2
593	0.2
594	0.19
595	0.16
596	0.14
597	0.13
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.1
603	0.13
604	0.13
605	0.11
606	0.13
607	0.12
608	0.11
609	0.11
610	0.1
611	0.06
612	0.06
613	0.07
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.12
618	0.13
619	0.16
620	0.17
621	0.17
622	0.2
623	0.27
624	0.3
625	0.3
626	0.33
627	0.32
628	0.34
629	0.34
630	0.31
631	0.26
632	0.22
633	0.18
634	0.16
635	0.16
636	0.13
637	0.14
638	0.14
639	0.15
640	0.17
641	0.16
642	0.14
643	0.14
644	0.15
645	0.14
646	0.15
647	0.13
648	0.1
649	0.11
650	0.11
651	0.15
652	0.19
653	0.19
654	0.19
655	0.19
656	0.19
657	0.24
658	0.26
659	0.24
660	0.22
661	0.28
662	0.3
663	0.37
664	0.44
665	0.42
666	0.46
667	0.44
668	0.43
669	0.37
670	0.37
671	0.32
672	0.31
673	0.37
674	0.33
675	0.36
676	0.33
677	0.34
678	0.32
679	0.33
680	0.29
681	0.2
682	0.19
683	0.15
684	0.16
685	0.19
686	0.21
687	0.21
688	0.21
689	0.21
690	0.19
691	0.2
692	0.2
693	0.18
694	0.17
695	0.17
696	0.18
697	0.19
698	0.19
699	0.18
700	0.18
701	0.17
702	0.14
703	0.13
704	0.08
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.08
709	0.11
710	0.14
711	0.18
712	0.2
713	0.22
714	0.25
715	0.3
716	0.35
717	0.32
718	0.31
719	0.26
720	0.25
721	0.25
722	0.22
723	0.15
724	0.09
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.08
730	0.07
731	0.08
732	0.08
733	0.09
734	0.09
735	0.09
736	0.08
737	0.07
738	0.07
739	0.06
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.07
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.09
754	0.11
755	0.12
756	0.14
757	0.16
758	0.23
759	0.27
760	0.32
761	0.33
762	0.31
763	0.32
764	0.3
765	0.29
766	0.22
767	0.21
768	0.17
769	0.14
770	0.14
771	0.12
772	0.12
773	0.11
774	0.11
775	0.1
776	0.15
777	0.16
778	0.18
779	0.18
780	0.19
781	0.21
782	0.27
783	0.33
784	0.3
785	0.33
786	0.34
787	0.33
788	0.35
789	0.41
790	0.34
791	0.31
792	0.26
793	0.24
794	0.22
795	0.22
796	0.23
797	0.19
798	0.2
799	0.17
800	0.19
801	0.19
802	0.19
803	0.18
804	0.16
805	0.16
806	0.15
807	0.16
808	0.15
809	0.16
810	0.15
811	0.16
812	0.16
813	0.13
814	0.15
815	0.15
816	0.15
817	0.13
818	0.14
819	0.15
820	0.19
821	0.2
822	0.22
823	0.25
824	0.26
825	0.28
826	0.29
827	0.33
828	0.34
829	0.38
830	0.38
831	0.35
832	0.34
833	0.31
834	0.31
835	0.3
836	0.26
837	0.22
838	0.21
839	0.26
840	0.35
841	0.43
842	0.51
843	0.56
844	0.64
845	0.71
846	0.76
847	0.8
848	0.79
849	0.8
850	0.81
851	0.83
852	0.78
853	0.77
854	0.75
855	0.74
856	0.71
857	0.7
858	0.64
859	0.56
860	0.54
861	0.5
862	0.44
863	0.36
864	0.38
865	0.37
866	0.32
867	0.3
868	0.27
869	0.24
870	0.25
871	0.26
872	0.22
873	0.18
874	0.17
875	0.17
876	0.18
877	0.18
878	0.15
879	0.13
880	0.11
881	0.09
882	0.09
883	0.08
884	0.08
885	0.08
886	0.08
887	0.07
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.07
895	0.09
896	0.09
897	0.08
898	0.08
899	0.07
900	0.08
901	0.12
902	0.13
903	0.14
904	0.13
905	0.13
906	0.14
907	0.14
908	0.13
909	0.13
910	0.12
911	0.13
912	0.15
913	0.15
914	0.14
915	0.15
916	0.15
917	0.13
918	0.14
919	0.13
920	0.14
921	0.14
922	0.15
923	0.15
924	0.15
925	0.15
926	0.14
927	0.11
928	0.09
929	0.09
930	0.1
931	0.1
932	0.09
933	0.11
934	0.11
935	0.13
936	0.17
937	0.17
938	0.16
939	0.16
940	0.16
941	0.14
942	0.13
943	0.12
944	0.08
945	0.07
946	0.06
947	0.06
948	0.06
949	0.07
950	0.07
951	0.07
952	0.08
953	0.09
954	0.1
955	0.1
956	0.14
957	0.14
958	0.14
959	0.16
960	0.23
961	0.27
962	0.28
963	0.29
964	0.24
965	0.25
966	0.26
967	0.22
968	0.15
969	0.11
970	0.11
971	0.1
972	0.11
973	0.1
974	0.09
975	0.09
976	0.08
977	0.08
978	0.07
979	0.07
980	0.12
981	0.12
982	0.13
983	0.13
984	0.13
985	0.14
986	0.13
987	0.14
988	0.11
989	0.09
990	0.08
991	0.08
992	0.07
993	0.07
994	0.06
995	0.06
996	0.06
997	0.06
998	0.05
999	0.06
1000	0.06
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.15
1015	0.23
1016	0.24
1017	0.25
1018	0.28
1019	0.34
1020	0.37
1021	0.44
1022	0.44
1023	0.39
1024	0.38
1025	0.37
1026	0.34
1027	0.27
1028	0.2
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.2
1036	0.21
1037	0.24
1038	0.28
1039	0.32
1040	0.32
1041	0.33
1042	0.32
1043	0.28
1044	0.27
1045	0.28
1046	0.23
1047	0.16
1048	0.15
1049	0.11
1050	0.1
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.07
1056	0.08
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.1
1061	0.11
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.09
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.1
1070	0.09
1071	0.13
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.11
1075	0.13
1076	0.14
1077	0.18
1078	0.19
1079	0.21
1080	0.22
1081	0.24
1082	0.24
1083	0.23
1084	0.22
1085	0.19
1086	0.21
1087	0.17
1088	0.18
1089	0.16
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.14
1094	0.11
1095	0.15
1096	0.18
1097	0.18
1098	0.15
1099	0.16
1100	0.18
1101	0.2
1102	0.25
1103	0.22
1104	0.19
1105	0.24
1106	0.25
1107	0.33
1108	0.36
1109	0.42
1110	0.41
1111	0.42
1112	0.42
1113	0.39
1114	0.43
1115	0.37
1116	0.34
1117	0.29
1118	0.28
1119	0.36
1120	0.36
1121	0.33
1122	0.3
1123	0.3
1124	0.32
1125	0.31
1126	0.31
1127	0.24
1128	0.27
1129	0.27
1130	0.26
1131	0.25
1132	0.23
1133	0.21
1134	0.19
1135	0.2
1136	0.16
1137	0.18
1138	0.18
1139	0.23
1140	0.23
1141	0.23
1142	0.27
1143	0.29
1144	0.33
1145	0.31
1146	0.35
1147	0.31
1148	0.32
1149	0.31
1150	0.27
1151	0.22
1152	0.18
1153	0.21
1154	0.19
1155	0.21
1156	0.2
1157	0.22
1158	0.23
1159	0.24
1160	0.25
1161	0.26
1162	0.29

A0A177WX34

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer