Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WMD1

Protein Details
Accession A0A177WMD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-275LTNTTDTIQKPARKRRRRRKPNSAAEGIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
169-199KKRKRASEPNPLSVKRKKPVNPAQKTLKSDK
256-267KPARKRRRRRKP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd08553  PIN_Fcf1-like  
Amino Acid Sequences MCCQHITITLVDGNFLQIAKQTKKDLDTALPTLLNGQVRMMTTYCCYAELRKLGGELRPTAAMAKTFEKRRCTHQPAVSAKECLKEIIGETNQFNYAVATQDQELRAYLRSIPGVPLIYINKSVMILEPISIATLKKVDEIEVSKTLPKSNEIAISKEEQDQILQVPVKKRKRASEPNPLSVKRKKPVNPAQKTLKSDKKPLIKTTQDGANTELIAQSSECMPLDQSNKDCDTLDEFCKDSAEKEPLTNTTDTIQKPARKRRRRRKPNSAAEGIAGESDKAEDKSDCLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.1
4 0.11
5 0.19
6 0.23
7 0.28
8 0.31
9 0.35
10 0.37
11 0.41
12 0.4
13 0.39
14 0.4
15 0.38
16 0.36
17 0.32
18 0.29
19 0.27
20 0.27
21 0.22
22 0.17
23 0.15
24 0.14
25 0.15
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.14
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.23
36 0.25
37 0.26
38 0.23
39 0.25
40 0.25
41 0.28
42 0.29
43 0.24
44 0.22
45 0.21
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.18
50 0.16
51 0.2
52 0.24
53 0.32
54 0.37
55 0.42
56 0.44
57 0.5
58 0.58
59 0.61
60 0.64
61 0.61
62 0.65
63 0.65
64 0.7
65 0.64
66 0.56
67 0.49
68 0.43
69 0.38
70 0.29
71 0.22
72 0.16
73 0.14
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.11
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.2
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.19
154 0.28
155 0.35
156 0.4
157 0.43
158 0.48
159 0.56
160 0.65
161 0.66
162 0.68
163 0.68
164 0.71
165 0.74
166 0.69
167 0.65
168 0.62
169 0.62
170 0.56
171 0.58
172 0.55
173 0.59
174 0.67
175 0.72
176 0.71
177 0.71
178 0.75
179 0.73
180 0.73
181 0.71
182 0.7
183 0.63
184 0.64
185 0.64
186 0.63
187 0.62
188 0.63
189 0.63
190 0.58
191 0.56
192 0.53
193 0.51
194 0.44
195 0.4
196 0.36
197 0.28
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.12
211 0.16
212 0.2
213 0.21
214 0.25
215 0.26
216 0.27
217 0.27
218 0.24
219 0.26
220 0.25
221 0.26
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.24
226 0.23
227 0.19
228 0.21
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.26
233 0.27
234 0.31
235 0.29
236 0.24
237 0.21
238 0.27
239 0.25
240 0.29
241 0.34
242 0.37
243 0.46
244 0.56
245 0.65
246 0.7
247 0.8
248 0.85
249 0.89
250 0.94
251 0.96
252 0.96
253 0.96
254 0.96
255 0.95
256 0.89
257 0.79
258 0.7
259 0.6
260 0.48
261 0.38
262 0.27
263 0.17
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.13