FuNGI

A0A177W9J5

Protein Details

Accession

A0A177W9J5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
622-644	IARELEKQKEQRSKKRARMSIAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
635-636	KK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNNGNRKVDGGRDGQQQTQNPMYQNAMQQVISHLLSQGLTPAQAQQQAHAYVQQNLQQLISQQQHAQGQHQQAISQQQQQSATLPESTTEAQRKVQQQPVQQIPAVQPVATYETHRLIAAGAGVMPHHIMKVPNPKFDLKSFKAPVTMVRQDPYKIRQEQYRLDAIRQGKEFKAAGRGDNQIDGNIGLGGINISLDKDKIAPFGNAAKQKQNLFKKKTRTYYLSRDHEDAGNSDRLGDTDMILTSVNARHGDPDRHPWVLQDDDDQYYTGNLEGSQGSNYMLFVFVNGGFKVIPATKFYKFMPRVNYRTLTVDEAEEQMKTKTRSKVSSHSDRWVMRNKEGIDGEKSMSLMDKLRNNIIDDEPKHAVVKTKREAEPGLDYTEEFADDEEINFGIDDAEDAKDAARRMFGEDRANQRFEDEEDVDAELDNLRKGKVAKNSRFTSAWYLLGMLTIQRVSSLDSNCQKIAKSLVKHEKNDVYEMDEENPYVSDEEEDEELNEMEEQKDEKAAQQQAIAAKKEADLIMKIRRDVSGSSTKLQRSGSISGTQSPRVASPTSPSSQPSATSPLSNTSTANGKNRPKSGGSTPGPASSSEIKRRRESSVSTGMTGHNSPPPPPAPAQVIARELEKQKEQRSKKRARMSIASQGDAPSSPFNPTQHQSSSKPSSRPQSSSPASPHNSQVRQPTPRSISHSSAASPSALSVPGSPPRSGDSENTGAVLTEEHIIRVIQAKKGAPITVKDIVAHVRNFLQSNPTNKDLLRQIMRRVVVHDKETGIVTLKDEFKGKY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.53
3	0.52
4	0.53
5	0.53
6	0.51
7	0.44
8	0.44
9	0.41
10	0.39
11	0.39
12	0.37
13	0.33
14	0.29
15	0.28
16	0.27
17	0.28
18	0.25
19	0.21
20	0.17
21	0.15
22	0.15
23	0.14
24	0.14
25	0.11
26	0.11
27	0.11
28	0.14
29	0.17
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.27
34	0.29
35	0.29
36	0.32
37	0.3
38	0.3
39	0.33
40	0.36
41	0.34
42	0.32
43	0.32
44	0.27
45	0.26
46	0.29
47	0.29
48	0.26
49	0.24
50	0.29
51	0.33
52	0.34
53	0.36
54	0.36
55	0.38
56	0.41
57	0.39
58	0.35
59	0.33
60	0.4
61	0.4
62	0.41
63	0.38
64	0.37
65	0.38
66	0.38
67	0.37
68	0.32
69	0.3
70	0.23
71	0.2
72	0.17
73	0.19
74	0.2
75	0.25
76	0.26
77	0.27
78	0.29
79	0.36
80	0.43
81	0.47
82	0.54
83	0.53
84	0.55
85	0.62
86	0.65
87	0.62
88	0.56
89	0.5
90	0.44
91	0.45
92	0.39
93	0.29
94	0.21
95	0.19
96	0.22
97	0.2
98	0.21
99	0.17
100	0.19
101	0.2
102	0.2
103	0.19
104	0.15
105	0.15
106	0.13
107	0.09
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.08
116	0.09
117	0.15
118	0.27
119	0.31
120	0.36
121	0.4
122	0.44
123	0.46
124	0.51
125	0.54
126	0.48
127	0.53
128	0.51
129	0.49
130	0.47
131	0.44
132	0.44
133	0.43
134	0.44
135	0.36
136	0.36
137	0.36
138	0.36
139	0.41
140	0.4
141	0.41
142	0.4
143	0.42
144	0.46
145	0.5
146	0.54
147	0.54
148	0.58
149	0.5
150	0.46
151	0.49
152	0.45
153	0.45
154	0.41
155	0.4
156	0.31
157	0.34
158	0.34
159	0.29
160	0.33
161	0.29
162	0.29
163	0.29
164	0.33
165	0.29
166	0.31
167	0.3
168	0.22
169	0.21
170	0.18
171	0.14
172	0.1
173	0.08
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.03
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.08
185	0.08
186	0.11
187	0.13
188	0.13
189	0.14
190	0.2
191	0.27
192	0.32
193	0.34
194	0.37
195	0.39
196	0.44
197	0.51
198	0.55
199	0.59
200	0.6
201	0.65
202	0.7
203	0.75
204	0.78
205	0.76
206	0.72
207	0.7
208	0.72
209	0.75
210	0.72
211	0.66
212	0.6
213	0.55
214	0.5
215	0.43
216	0.35
217	0.29
218	0.24
219	0.2
220	0.18
221	0.16
222	0.14
223	0.15
224	0.13
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.11
234	0.1
235	0.1
236	0.14
237	0.18
238	0.22
239	0.23
240	0.31
241	0.32
242	0.33
243	0.33
244	0.31
245	0.31
246	0.29
247	0.26
248	0.21
249	0.2
250	0.19
251	0.2
252	0.18
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.09
257	0.07
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.12
282	0.16
283	0.17
284	0.2
285	0.21
286	0.29
287	0.31
288	0.35
289	0.41
290	0.44
291	0.48
292	0.51
293	0.52
294	0.43
295	0.42
296	0.39
297	0.32
298	0.25
299	0.21
300	0.17
301	0.16
302	0.15
303	0.12
304	0.11
305	0.1
306	0.14
307	0.16
308	0.21
309	0.26
310	0.3
311	0.36
312	0.4
313	0.48
314	0.52
315	0.6
316	0.57
317	0.55
318	0.56
319	0.52
320	0.52
321	0.52
322	0.47
323	0.39
324	0.41
325	0.38
326	0.36
327	0.35
328	0.33
329	0.26
330	0.25
331	0.23
332	0.18
333	0.17
334	0.12
335	0.12
336	0.1
337	0.1
338	0.12
339	0.15
340	0.16
341	0.18
342	0.19
343	0.2
344	0.21
345	0.21
346	0.23
347	0.21
348	0.24
349	0.23
350	0.22
351	0.22
352	0.2
353	0.24
354	0.22
355	0.29
356	0.3
357	0.36
358	0.37
359	0.39
360	0.39
361	0.35
362	0.36
363	0.29
364	0.25
365	0.18
366	0.17
367	0.15
368	0.15
369	0.12
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.12
394	0.14
395	0.17
396	0.2
397	0.24
398	0.32
399	0.34
400	0.35
401	0.31
402	0.29
403	0.27
404	0.23
405	0.22
406	0.16
407	0.13
408	0.12
409	0.13
410	0.12
411	0.11
412	0.1
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.08
419	0.1
420	0.15
421	0.23
422	0.33
423	0.39
424	0.47
425	0.49
426	0.51
427	0.5
428	0.47
429	0.44
430	0.36
431	0.3
432	0.21
433	0.2
434	0.16
435	0.15
436	0.13
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.06
444	0.11
445	0.12
446	0.17
447	0.21
448	0.23
449	0.24
450	0.24
451	0.22
452	0.2
453	0.25
454	0.25
455	0.24
456	0.31
457	0.41
458	0.46
459	0.48
460	0.51
461	0.5
462	0.46
463	0.46
464	0.37
465	0.3
466	0.25
467	0.25
468	0.22
469	0.17
470	0.15
471	0.13
472	0.13
473	0.1
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.09
493	0.1
494	0.17
495	0.19
496	0.19
497	0.19
498	0.21
499	0.24
500	0.28
501	0.27
502	0.21
503	0.19
504	0.19
505	0.2
506	0.18
507	0.14
508	0.12
509	0.14
510	0.2
511	0.22
512	0.22
513	0.21
514	0.21
515	0.22
516	0.21
517	0.23
518	0.26
519	0.26
520	0.29
521	0.34
522	0.34
523	0.35
524	0.35
525	0.32
526	0.27
527	0.28
528	0.27
529	0.26
530	0.27
531	0.29
532	0.31
533	0.3
534	0.26
535	0.23
536	0.22
537	0.2
538	0.2
539	0.15
540	0.17
541	0.21
542	0.22
543	0.23
544	0.23
545	0.24
546	0.23
547	0.24
548	0.22
549	0.22
550	0.21
551	0.21
552	0.2
553	0.22
554	0.24
555	0.24
556	0.22
557	0.18
558	0.22
559	0.25
560	0.3
561	0.33
562	0.38
563	0.44
564	0.46
565	0.49
566	0.45
567	0.46
568	0.46
569	0.48
570	0.43
571	0.42
572	0.41
573	0.39
574	0.38
575	0.33
576	0.32
577	0.29
578	0.34
579	0.38
580	0.44
581	0.47
582	0.52
583	0.55
584	0.57
585	0.54
586	0.53
587	0.5
588	0.53
589	0.49
590	0.44
591	0.43
592	0.38
593	0.35
594	0.31
595	0.25
596	0.21
597	0.2
598	0.2
599	0.23
600	0.24
601	0.25
602	0.25
603	0.27
604	0.26
605	0.29
606	0.31
607	0.3
608	0.3
609	0.28
610	0.28
611	0.29
612	0.27
613	0.28
614	0.31
615	0.34
616	0.41
617	0.5
618	0.58
619	0.64
620	0.72
621	0.79
622	0.81
623	0.86
624	0.83
625	0.8
626	0.79
627	0.75
628	0.75
629	0.68
630	0.59
631	0.5
632	0.44
633	0.37
634	0.29
635	0.24
636	0.17
637	0.14
638	0.16
639	0.18
640	0.2
641	0.25
642	0.27
643	0.31
644	0.34
645	0.39
646	0.39
647	0.45
648	0.52
649	0.53
650	0.55
651	0.56
652	0.61
653	0.61
654	0.63
655	0.58
656	0.59
657	0.56
658	0.58
659	0.57
660	0.56
661	0.53
662	0.51
663	0.55
664	0.54
665	0.54
666	0.51
667	0.56
668	0.55
669	0.59
670	0.59
671	0.61
672	0.57
673	0.58
674	0.62
675	0.58
676	0.54
677	0.5
678	0.48
679	0.41
680	0.38
681	0.34
682	0.26
683	0.2
684	0.17
685	0.15
686	0.13
687	0.12
688	0.12
689	0.15
690	0.22
691	0.25
692	0.24
693	0.24
694	0.26
695	0.3
696	0.31
697	0.3
698	0.3
699	0.3
700	0.3
701	0.3
702	0.27
703	0.22
704	0.2
705	0.17
706	0.11
707	0.11
708	0.11
709	0.1
710	0.11
711	0.11
712	0.12
713	0.19
714	0.21
715	0.21
716	0.26
717	0.27
718	0.31
719	0.34
720	0.37
721	0.32
722	0.32
723	0.35
724	0.36
725	0.35
726	0.31
727	0.31
728	0.33
729	0.35
730	0.32
731	0.28
732	0.26
733	0.29
734	0.29
735	0.28
736	0.31
737	0.32
738	0.39
739	0.43
740	0.43
741	0.42
742	0.41
743	0.46
744	0.43
745	0.47
746	0.48
747	0.46
748	0.5
749	0.55
750	0.58
751	0.53
752	0.52
753	0.53
754	0.49
755	0.48
756	0.45
757	0.39
758	0.37
759	0.37
760	0.33
761	0.27
762	0.22
763	0.21
764	0.23
765	0.25
766	0.25

A0A177W9J5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer