FuNGI

A0A177W939

Protein Details

Accession

A0A177W939

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-72	DHDITHKPSKERRQKGTGPNPTGPKKTPPPMSRKVRDQPNSTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-61	PSKERRQKGTGPNPTGPKKTPPPMS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR006224 PsdUridine_synth_RluA-like_CS IPR006225 PsdUridine_synth_RluC/D IPR006145 PsdUridine_synth_RsuA/RluA IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
Pfam	View protein in Pfam PF00849 PseudoU_synth_2 PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS01129 PSI_RLU PS50102 RRM
CDD	cd02557 PseudoU_synth_ScRIB2 cd21608 RRM2_NsCP33_like

Amino Acid Sequences

MSDRIPSIQTPSTHDDPSLGQKRLYSTVCDHDITHKPSKERRQKGTGPNPTGPKKTPPPMSRKVRDQPNSTPPEYIVENGLRKVKPYLYVYQTYAKQRWLGMTVFEVFSKEFHDRPAEVYRQAILKGRIKINGKAVPLDYVIRNSDLVENTVHRHEPVITDTPIEIVHQSDSVLVVNKPSSIPVHPTGRYRYNTVIHLLEYENKMNDLFLVNRIDRLTSGLVLIARDKNKAAYMMQEMRERRIHKTYLARVKGEFPADAIECHEPIETVEFKVGVNIVSPTGKPCSTLFKRLSYNGLTSVVQCEPLTGRTHQIRVHLQFLGHPIANDPIYGCSEWGKDMGKGGLDPKAVTMTANRVTAAVFPSEQELVDHDNVDDADADPIANCVECRLKRSDPIPEQLVIWLHSWKYKGDSGWDFETSMPDWAHESYQGDQQLLVSIQMSFILKRSVLQPALFKAANPLSRALISTSAISLEKKLFIGNLAWSVDEQTLANAFAVHGELIECNIARDRESGRARGFAFVTFQDDDAALKAIEALNGAEIADRAIRVSEAISRDRSADNRGNGGRGGYGGNRGGNRGGFGGNRGDEEGRRGGNDNGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.34
3	0.32
4	0.41
5	0.43
6	0.37
7	0.34
8	0.35
9	0.39
10	0.44
11	0.43
12	0.37
13	0.34
14	0.39
15	0.42
16	0.41
17	0.38
18	0.39
19	0.45
20	0.47
21	0.52
22	0.5
23	0.53
24	0.61
25	0.71
26	0.74
27	0.76
28	0.78
29	0.78
30	0.82
31	0.86
32	0.88
33	0.87
34	0.84
35	0.82
36	0.82
37	0.79
38	0.76
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.65
43	0.68
44	0.68
45	0.7
46	0.74
47	0.81
48	0.81
49	0.82
50	0.82
51	0.83
52	0.82
53	0.8
54	0.79
55	0.79
56	0.78
57	0.69
58	0.61
59	0.51
60	0.47
61	0.41
62	0.33
63	0.27
64	0.25
65	0.26
66	0.28
67	0.34
68	0.31
69	0.31
70	0.34
71	0.32
72	0.33
73	0.36
74	0.4
75	0.39
76	0.44
77	0.45
78	0.48
79	0.51
80	0.52
81	0.49
82	0.44
83	0.41
84	0.38
85	0.37
86	0.34
87	0.29
88	0.23
89	0.23
90	0.23
91	0.21
92	0.19
93	0.18
94	0.14
95	0.14
96	0.16
97	0.17
98	0.15
99	0.17
100	0.22
101	0.21
102	0.25
103	0.33
104	0.32
105	0.3
106	0.31
107	0.3
108	0.27
109	0.28
110	0.3
111	0.28
112	0.31
113	0.36
114	0.38
115	0.43
116	0.45
117	0.47
118	0.5
119	0.49
120	0.43
121	0.4
122	0.37
123	0.33
124	0.3
125	0.29
126	0.22
127	0.19
128	0.19
129	0.17
130	0.17
131	0.16
132	0.18
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.16
137	0.17
138	0.2
139	0.19
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.16
144	0.19
145	0.21
146	0.19
147	0.19
148	0.19
149	0.19
150	0.18
151	0.17
152	0.12
153	0.08
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.17
170	0.2
171	0.26
172	0.28
173	0.32
174	0.36
175	0.42
176	0.42
177	0.41
178	0.41
179	0.38
180	0.37
181	0.36
182	0.32
183	0.25
184	0.24
185	0.22
186	0.2
187	0.2
188	0.19
189	0.16
190	0.16
191	0.15
192	0.13
193	0.13
194	0.11
195	0.09
196	0.11
197	0.15
198	0.14
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.16
204	0.14
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.12
211	0.14
212	0.14
213	0.15
214	0.15
215	0.15
216	0.15
217	0.16
218	0.14
219	0.13
220	0.18
221	0.22
222	0.25
223	0.3
224	0.3
225	0.32
226	0.37
227	0.36
228	0.34
229	0.34
230	0.33
231	0.33
232	0.4
233	0.45
234	0.49
235	0.51
236	0.48
237	0.43
238	0.45
239	0.42
240	0.35
241	0.27
242	0.17
243	0.16
244	0.15
245	0.14
246	0.13
247	0.11
248	0.1
249	0.11
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.2
273	0.22
274	0.3
275	0.31
276	0.34
277	0.36
278	0.36
279	0.39
280	0.31
281	0.29
282	0.23
283	0.22
284	0.17
285	0.15
286	0.16
287	0.13
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.08
292	0.1
293	0.12
294	0.11
295	0.15
296	0.16
297	0.19
298	0.2
299	0.24
300	0.28
301	0.28
302	0.3
303	0.26
304	0.24
305	0.23
306	0.24
307	0.22
308	0.16
309	0.14
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.11
314	0.09
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.14
340	0.14
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.11
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.05
372	0.12
373	0.13
374	0.17
375	0.22
376	0.24
377	0.29
378	0.32
379	0.4
380	0.38
381	0.43
382	0.42
383	0.37
384	0.35
385	0.32
386	0.3
387	0.22
388	0.18
389	0.15
390	0.13
391	0.15
392	0.16
393	0.15
394	0.17
395	0.18
396	0.18
397	0.23
398	0.25
399	0.27
400	0.29
401	0.29
402	0.26
403	0.24
404	0.25
405	0.19
406	0.19
407	0.15
408	0.12
409	0.13
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.14
414	0.13
415	0.18
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.15
420	0.15
421	0.14
422	0.12
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.17
435	0.19
436	0.2
437	0.22
438	0.23
439	0.28
440	0.27
441	0.25
442	0.25
443	0.28
444	0.29
445	0.27
446	0.26
447	0.23
448	0.23
449	0.24
450	0.2
451	0.17
452	0.14
453	0.13
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.12
465	0.14
466	0.13
467	0.15
468	0.14
469	0.14
470	0.14
471	0.16
472	0.14
473	0.13
474	0.11
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.08
489	0.07
490	0.08
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.16
495	0.18
496	0.26
497	0.3
498	0.35
499	0.34
500	0.39
501	0.39
502	0.39
503	0.38
504	0.29
505	0.28
506	0.23
507	0.25
508	0.21
509	0.2
510	0.17
511	0.16
512	0.16
513	0.14
514	0.15
515	0.09
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.13
536	0.17
537	0.21
538	0.24
539	0.24
540	0.27
541	0.3
542	0.32
543	0.35
544	0.38
545	0.37
546	0.42
547	0.43
548	0.43
549	0.4
550	0.38
551	0.3
552	0.24
553	0.23
554	0.17
555	0.2
556	0.21
557	0.24
558	0.24
559	0.26
560	0.27
561	0.25
562	0.25
563	0.22
564	0.22
565	0.18
566	0.2
567	0.24
568	0.22
569	0.23
570	0.25
571	0.25
572	0.24
573	0.28
574	0.3
575	0.26
576	0.27
577	0.28

A0A177W939

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer