Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A177WU78

Protein Details
Accession A0A177WU78    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-359VQPAKPKTIKSSSSKRKRDNKLESTLSTTPKKKSKNTNVAHTSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-333KSSSSKRKR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 9.5, cyto_mito 7.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPIDSKSMVQKSLKHMEKVGALSAETKKGSLDAHTESKPSASEAVQSAFDSLMHSAAIHTITKEQSTPFLESPFVQIQAQVRICISPSFITTPLEGVKNYLNTFIMRYIAELDGVVLAYENVKLVTKNGHIMNESPFIFFNAQAKFTLFSPKVGSILYGVVNKVSPDHIGLLVYGVFNTSIPSSHICNKKFSWDAEGYAWKFESAIDHSTMFIATNSIIKFSVDSLITANKMLAISGSLTSHPTDTGVIDSTGLPMPTVLQPVEFGNDMTGVETVQPTHFVFNDEVDEPVEECIKDHDTPTHHEIDTKEQSIDISVQPAKPKTIKSSSSKRKRDNKLESTLSTTPKKKSKNTNVAHTSDDKLLNSAAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.51
4 0.52
5 0.48
6 0.43
7 0.33
8 0.27
9 0.3
10 0.3
11 0.31
12 0.26
13 0.24
14 0.2
15 0.21
16 0.22
17 0.19
18 0.21
19 0.22
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.3
25 0.27
26 0.24
27 0.21
28 0.15
29 0.17
30 0.18
31 0.2
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.11
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.17
51 0.16
52 0.19
53 0.22
54 0.26
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.23
59 0.28
60 0.25
61 0.23
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.27
66 0.27
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.2
71 0.19
72 0.18
73 0.11
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.1
113 0.11
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.22
120 0.23
121 0.22
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.07
170 0.09
171 0.16
172 0.23
173 0.24
174 0.27
175 0.28
176 0.32
177 0.33
178 0.31
179 0.31
180 0.25
181 0.26
182 0.24
183 0.29
184 0.24
185 0.22
186 0.21
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.09
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.09
279 0.09
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.2
285 0.22
286 0.28
287 0.33
288 0.35
289 0.31
290 0.34
291 0.34
292 0.38
293 0.42
294 0.37
295 0.33
296 0.28
297 0.28
298 0.26
299 0.27
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.27
305 0.28
306 0.32
307 0.34
308 0.37
309 0.39
310 0.45
311 0.5
312 0.53
313 0.63
314 0.69
315 0.76
316 0.82
317 0.84
318 0.86
319 0.89
320 0.92
321 0.91
322 0.89
323 0.87
324 0.84
325 0.76
326 0.74
327 0.69
328 0.64
329 0.62
330 0.58
331 0.57
332 0.58
333 0.64
334 0.65
335 0.71
336 0.76
337 0.78
338 0.81
339 0.84
340 0.83
341 0.78
342 0.74
343 0.66
344 0.59
345 0.54
346 0.49
347 0.38
348 0.32