FuNGI

A0A177WLW0

Protein Details

Accession

A0A177WLW0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
323-349	TETVSSTSSKKRKRKSKSVARLNATEK	Hydrophilic
479-503	FVTASARRPNSKRNKKNKKGKQMRK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
332-340	KKRKRKSKS
485-503	RRPNSKRNKKNKKGKQMRK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MSDKPLVQQSLAQDLAQAATKLPISEGLRYICCFWKILIKEWYNIDRLRLDKFYFLCRQFHFWTFRLIIDHEWDKDIIDKVMIILEQGPLSINVASVPNSLQYHTSKAFFEELIKAIKSVDNDMQLPLDAFERLIAPCFGVLERSYNQVYFKHVIDDIFSLWLFKDTNADEDKSADDMTSSTAMMVQSCISPKQLLERLGLLAKSDNILKNNKKELHAFNKTLAKLIGVEYTDPTFSIGMKAAPIPTARKNDESGKNMNSKSKKQKVTMVVMDEAVEACADIALWNVDEVERESTNTDCDTVVTTDDKDDVSKTMPVQEMDSTETVSSTSSKKRKRKSKSVARLNATEKSDSDAAPDCENDAAKESNEVFEDSVAEDVESFAIAESVDCDDNELISDALDASQHKSPDRKSVSWGQKLRVKTFFKLKPICALSEVKTPVHPPAPKSALRESPAVFPPPPEFDGVDMDFFESTPTEMLDFVTASARRPNSKRNKKNKKGKQMRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.22
3	0.21
4	0.18
5	0.11
6	0.13
7	0.14
8	0.13
9	0.13
10	0.18
11	0.19
12	0.22
13	0.26
14	0.27
15	0.29
16	0.3
17	0.33
18	0.31
19	0.3
20	0.28
21	0.25
22	0.3
23	0.3
24	0.37
25	0.43
26	0.41
27	0.44
28	0.49
29	0.52
30	0.49
31	0.47
32	0.43
33	0.38
34	0.38
35	0.39
36	0.38
37	0.35
38	0.35
39	0.36
40	0.4
41	0.44
42	0.45
43	0.46
44	0.44
45	0.49
46	0.48
47	0.52
48	0.51
49	0.43
50	0.47
51	0.43
52	0.41
53	0.38
54	0.35
55	0.3
56	0.3
57	0.33
58	0.27
59	0.27
60	0.25
61	0.22
62	0.24
63	0.24
64	0.18
65	0.14
66	0.13
67	0.11
68	0.13
69	0.12
70	0.09
71	0.08
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.09
76	0.07
77	0.09
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.12
86	0.13
87	0.14
88	0.17
89	0.17
90	0.22
91	0.24
92	0.25
93	0.22
94	0.23
95	0.24
96	0.21
97	0.22
98	0.19
99	0.19
100	0.21
101	0.2
102	0.18
103	0.17
104	0.19
105	0.17
106	0.18
107	0.19
108	0.19
109	0.19
110	0.2
111	0.19
112	0.17
113	0.17
114	0.13
115	0.11
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.08
127	0.09
128	0.09
129	0.12
130	0.12
131	0.16
132	0.17
133	0.17
134	0.19
135	0.18
136	0.23
137	0.21
138	0.21
139	0.2
140	0.2
141	0.19
142	0.19
143	0.18
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.08
152	0.11
153	0.11
154	0.15
155	0.18
156	0.18
157	0.17
158	0.18
159	0.18
160	0.16
161	0.15
162	0.1
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.15
181	0.19
182	0.2
183	0.2
184	0.2
185	0.21
186	0.22
187	0.22
188	0.16
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.12
193	0.12
194	0.14
195	0.22
196	0.26
197	0.3
198	0.38
199	0.41
200	0.4
201	0.43
202	0.47
203	0.49
204	0.51
205	0.47
206	0.44
207	0.46
208	0.44
209	0.4
210	0.33
211	0.24
212	0.18
213	0.18
214	0.15
215	0.09
216	0.1
217	0.09
218	0.1
219	0.09
220	0.09
221	0.08
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.11
233	0.15
234	0.21
235	0.22
236	0.23
237	0.26
238	0.32
239	0.37
240	0.38
241	0.37
242	0.36
243	0.39
244	0.39
245	0.43
246	0.4
247	0.42
248	0.48
249	0.53
250	0.55
251	0.53
252	0.59
253	0.58
254	0.6
255	0.55
256	0.47
257	0.39
258	0.33
259	0.31
260	0.24
261	0.17
262	0.11
263	0.07
264	0.04
265	0.03
266	0.03
267	0.02
268	0.02
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.04
276	0.05
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.08
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.11
300	0.11
301	0.14
302	0.16
303	0.16
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.17
308	0.17
309	0.13
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.1
315	0.11
316	0.19
317	0.27
318	0.37
319	0.45
320	0.55
321	0.65
322	0.73
323	0.81
324	0.84
325	0.87
326	0.89
327	0.91
328	0.9
329	0.85
330	0.81
331	0.74
332	0.69
333	0.59
334	0.5
335	0.39
336	0.34
337	0.3
338	0.23
339	0.22
340	0.2
341	0.19
342	0.19
343	0.19
344	0.16
345	0.16
346	0.16
347	0.14
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.15
355	0.15
356	0.12
357	0.11
358	0.12
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.05
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.1
389	0.13
390	0.15
391	0.18
392	0.23
393	0.26
394	0.35
395	0.41
396	0.4
397	0.43
398	0.51
399	0.59
400	0.63
401	0.65
402	0.62
403	0.6
404	0.64
405	0.64
406	0.63
407	0.57
408	0.54
409	0.59
410	0.59
411	0.63
412	0.64
413	0.6
414	0.6
415	0.58
416	0.54
417	0.48
418	0.45
419	0.39
420	0.4
421	0.42
422	0.34
423	0.33
424	0.33
425	0.34
426	0.37
427	0.38
428	0.32
429	0.39
430	0.44
431	0.46
432	0.5
433	0.52
434	0.51
435	0.5
436	0.53
437	0.45
438	0.45
439	0.45
440	0.45
441	0.38
442	0.33
443	0.34
444	0.34
445	0.33
446	0.29
447	0.26
448	0.23
449	0.28
450	0.27
451	0.24
452	0.19
453	0.19
454	0.16
455	0.16
456	0.15
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.15
468	0.15
469	0.16
470	0.24
471	0.27
472	0.35
473	0.4
474	0.5
475	0.55
476	0.66
477	0.75
478	0.79
479	0.87
480	0.89
481	0.96
482	0.96
483	0.96

A0A177WLW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer