Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2X1W2

Protein Details
Accession G2X1W2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-254SAAAKQPKKHHGKRGGHNHKENFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-247KQPKKHHGKRGG
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.166, nucl 10, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013899  DUF1771  
IPR002625  Smr_dom  
IPR036063  Smr_dom_sf  
IPR045124  Su(sable)-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG vda:VDAG_04286  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08590  DUF1771  
PF01713  Smr  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50828  SMR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSPYDMLRSILGQSRTDDEIEAALAVHGYDLSAAIVAIMESQAQDGSFPSLQAEETKSIVIGKSMATEARPATPAGQQRSGVICKFYMSTGQCLRSDCRFSHDLSNHLCKYWVMGNCLAGDTCIFSHDPAYLMNKLALDGASTPPTKQATIQVSDYNSFPLLQPGTPEHGVGQTNGGYPFVGITPPPGLKPFQAGESPRSRSRPGSRQQQPREAVVIAPSLDDADAFPSLGSAAAKQPKKHHGKRGGHNHKENFVAPSSLAEIVKMSPSPAPAVLRQDLKKIGRNGSSTNIRNGENSLAAQAIQSPKHIPWLETGERANKLYLKARQEAIKHGGLRNKFLQSAAQAWNRNDARAAKALSLRGQSENDLMRKAHREAARELYEERNRANSTSAEMYVDLHGLHPEEAVEYLERVLAENSKEGRPIYAITGTGHHSKSGKDKVGKAIRNFLNEWRYAYREFSVPGDRNNMGGILGIDATSYDKSLARSGAASPSGSSSKEEVDILSQGVEIGDGKVRLLVRDPPKGPSARRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.29
4 0.26
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.1
10 0.08
11 0.07
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.04
26 0.04
27 0.04
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.16
40 0.19
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.12
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.19
58 0.17
59 0.18
60 0.23
61 0.29
62 0.32
63 0.35
64 0.33
65 0.34
66 0.39
67 0.41
68 0.37
69 0.32
70 0.26
71 0.23
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.2
76 0.26
77 0.29
78 0.33
79 0.34
80 0.36
81 0.39
82 0.38
83 0.41
84 0.35
85 0.35
86 0.33
87 0.34
88 0.41
89 0.4
90 0.4
91 0.42
92 0.5
93 0.44
94 0.43
95 0.41
96 0.31
97 0.31
98 0.31
99 0.29
100 0.24
101 0.25
102 0.26
103 0.26
104 0.27
105 0.23
106 0.17
107 0.13
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.23
136 0.24
137 0.27
138 0.29
139 0.28
140 0.29
141 0.29
142 0.29
143 0.23
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.19
153 0.18
154 0.18
155 0.15
156 0.17
157 0.18
158 0.16
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.05
170 0.06
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.19
181 0.2
182 0.24
183 0.3
184 0.34
185 0.34
186 0.37
187 0.37
188 0.39
189 0.45
190 0.49
191 0.5
192 0.57
193 0.62
194 0.69
195 0.73
196 0.76
197 0.7
198 0.62
199 0.56
200 0.46
201 0.37
202 0.27
203 0.22
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.09
221 0.16
222 0.18
223 0.21
224 0.27
225 0.36
226 0.46
227 0.52
228 0.58
229 0.62
230 0.68
231 0.75
232 0.82
233 0.83
234 0.81
235 0.81
236 0.74
237 0.66
238 0.59
239 0.5
240 0.41
241 0.3
242 0.22
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.14
261 0.16
262 0.2
263 0.2
264 0.22
265 0.26
266 0.27
267 0.31
268 0.31
269 0.33
270 0.33
271 0.34
272 0.33
273 0.34
274 0.39
275 0.35
276 0.35
277 0.33
278 0.3
279 0.28
280 0.27
281 0.23
282 0.16
283 0.14
284 0.11
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.12
294 0.19
295 0.19
296 0.17
297 0.18
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.29
302 0.26
303 0.27
304 0.27
305 0.25
306 0.2
307 0.21
308 0.24
309 0.28
310 0.29
311 0.3
312 0.32
313 0.35
314 0.35
315 0.38
316 0.36
317 0.35
318 0.33
319 0.33
320 0.36
321 0.33
322 0.35
323 0.34
324 0.31
325 0.27
326 0.25
327 0.23
328 0.2
329 0.24
330 0.26
331 0.28
332 0.3
333 0.29
334 0.38
335 0.36
336 0.35
337 0.33
338 0.29
339 0.26
340 0.26
341 0.27
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.25
346 0.26
347 0.25
348 0.23
349 0.22
350 0.21
351 0.22
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.25
358 0.26
359 0.29
360 0.28
361 0.3
362 0.32
363 0.4
364 0.4
365 0.37
366 0.37
367 0.39
368 0.4
369 0.38
370 0.36
371 0.33
372 0.31
373 0.3
374 0.31
375 0.23
376 0.22
377 0.23
378 0.22
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.16
404 0.19
405 0.19
406 0.21
407 0.2
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.18
416 0.2
417 0.24
418 0.23
419 0.22
420 0.22
421 0.23
422 0.31
423 0.37
424 0.42
425 0.43
426 0.47
427 0.55
428 0.63
429 0.68
430 0.63
431 0.64
432 0.6
433 0.59
434 0.57
435 0.54
436 0.5
437 0.44
438 0.45
439 0.39
440 0.39
441 0.35
442 0.36
443 0.31
444 0.28
445 0.28
446 0.28
447 0.33
448 0.32
449 0.33
450 0.36
451 0.34
452 0.32
453 0.31
454 0.27
455 0.18
456 0.16
457 0.13
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.12
469 0.16
470 0.17
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.23
475 0.23
476 0.22
477 0.19
478 0.22
479 0.23
480 0.23
481 0.24
482 0.2
483 0.2
484 0.21
485 0.21
486 0.18
487 0.18
488 0.18
489 0.16
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.11
498 0.1
499 0.11
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.19
504 0.27
505 0.31
506 0.4
507 0.42
508 0.43
509 0.5
510 0.55