Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168JM79

Protein Details
Accession A0A168JM79    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-432LSPNRDSSPPKAVPRKKKTVNIFMKRPVKRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-295PRKATKKPSAPPPPARAQPVPA
300-307KLSAPARK
412-431KAVPRKKKTVNIFMKRPVKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 13, mito 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPKSLSEMASAVATKNIKSIISIGDLHFPAVRHILIKIDSAAQLRRIELNCPQLQGETGELWLRLIEKDFPLELKANGYKPKSEDKWYKVWSKYKAEHDHSLQASEEQLRAAFMGLQKNKEQNTSKIVEGRFLPQDAIRHKKRNTGPKDNTSSVFNFGAGSRTKTLTAAGVMRKARREAKEVRNIQGALSRSVTTPIRVLERQHLKAPPPAMVREARIAAQPAFRTPEAEKREQHIQEMEKRRSATLSAHALRAAYITDSEDENSDEDEAPPPRKATKKPSAPPPPARAQPVPAASQAKLSAPARKLPGSGGSMFQRKFAPGKGTAKVSPPKPLRTTNTTVAAAQALPTGKKRTNSEANLDAGPSTPTKRPATGQQPALVSPELSPLTKQRSSSQEIRESLSPNRDSSPPKAVPRKKKTVNIFMKRPVKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.19
8 0.17
9 0.2
10 0.22
11 0.21
12 0.26
13 0.26
14 0.26
15 0.26
16 0.23
17 0.21
18 0.21
19 0.21
20 0.15
21 0.16
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.18
26 0.18
27 0.21
28 0.23
29 0.25
30 0.26
31 0.26
32 0.26
33 0.31
34 0.29
35 0.3
36 0.33
37 0.4
38 0.37
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.31
43 0.28
44 0.24
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.14
55 0.13
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.22
63 0.25
64 0.27
65 0.33
66 0.34
67 0.35
68 0.37
69 0.46
70 0.44
71 0.49
72 0.54
73 0.53
74 0.6
75 0.63
76 0.67
77 0.65
78 0.69
79 0.68
80 0.67
81 0.69
82 0.7
83 0.73
84 0.71
85 0.7
86 0.66
87 0.66
88 0.57
89 0.51
90 0.42
91 0.33
92 0.29
93 0.24
94 0.2
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.19
103 0.21
104 0.25
105 0.28
106 0.33
107 0.34
108 0.39
109 0.4
110 0.35
111 0.39
112 0.39
113 0.38
114 0.38
115 0.37
116 0.33
117 0.3
118 0.3
119 0.26
120 0.24
121 0.22
122 0.18
123 0.24
124 0.27
125 0.35
126 0.38
127 0.44
128 0.45
129 0.53
130 0.59
131 0.64
132 0.67
133 0.69
134 0.7
135 0.71
136 0.77
137 0.71
138 0.64
139 0.58
140 0.49
141 0.42
142 0.34
143 0.24
144 0.18
145 0.15
146 0.17
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.16
154 0.13
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.19
159 0.21
160 0.23
161 0.25
162 0.28
163 0.33
164 0.32
165 0.37
166 0.4
167 0.47
168 0.55
169 0.57
170 0.55
171 0.53
172 0.5
173 0.44
174 0.39
175 0.31
176 0.23
177 0.2
178 0.18
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.23
189 0.3
190 0.31
191 0.34
192 0.35
193 0.33
194 0.35
195 0.34
196 0.31
197 0.25
198 0.24
199 0.23
200 0.22
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.15
212 0.14
213 0.16
214 0.15
215 0.23
216 0.26
217 0.31
218 0.31
219 0.32
220 0.4
221 0.38
222 0.38
223 0.34
224 0.33
225 0.37
226 0.45
227 0.44
228 0.39
229 0.39
230 0.38
231 0.34
232 0.31
233 0.25
234 0.21
235 0.27
236 0.25
237 0.25
238 0.24
239 0.24
240 0.22
241 0.2
242 0.15
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.2
262 0.26
263 0.31
264 0.37
265 0.45
266 0.53
267 0.59
268 0.69
269 0.74
270 0.77
271 0.79
272 0.76
273 0.72
274 0.66
275 0.65
276 0.56
277 0.49
278 0.45
279 0.4
280 0.35
281 0.33
282 0.31
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.19
287 0.22
288 0.21
289 0.24
290 0.23
291 0.28
292 0.29
293 0.29
294 0.29
295 0.25
296 0.29
297 0.25
298 0.25
299 0.23
300 0.24
301 0.3
302 0.3
303 0.3
304 0.27
305 0.26
306 0.27
307 0.27
308 0.28
309 0.29
310 0.34
311 0.35
312 0.39
313 0.39
314 0.44
315 0.47
316 0.44
317 0.46
318 0.47
319 0.51
320 0.51
321 0.57
322 0.56
323 0.57
324 0.61
325 0.57
326 0.57
327 0.51
328 0.46
329 0.39
330 0.34
331 0.26
332 0.2
333 0.17
334 0.12
335 0.13
336 0.16
337 0.21
338 0.24
339 0.3
340 0.34
341 0.4
342 0.48
343 0.51
344 0.53
345 0.52
346 0.51
347 0.46
348 0.42
349 0.34
350 0.25
351 0.22
352 0.17
353 0.17
354 0.18
355 0.23
356 0.26
357 0.29
358 0.32
359 0.4
360 0.47
361 0.52
362 0.52
363 0.5
364 0.49
365 0.47
366 0.47
367 0.38
368 0.29
369 0.21
370 0.22
371 0.19
372 0.18
373 0.19
374 0.22
375 0.29
376 0.32
377 0.34
378 0.35
379 0.41
380 0.48
381 0.54
382 0.57
383 0.58
384 0.56
385 0.59
386 0.56
387 0.52
388 0.51
389 0.52
390 0.46
391 0.39
392 0.4
393 0.42
394 0.43
395 0.45
396 0.48
397 0.47
398 0.54
399 0.63
400 0.7
401 0.75
402 0.8
403 0.86
404 0.85
405 0.87
406 0.87
407 0.87
408 0.89
409 0.88
410 0.86
411 0.86
412 0.86