Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JRD5

Protein Details
Accession A0A162JRD5    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-56LEAPEPPSKRARRAMKKGKSATSKSKKDNDIHydrophilic
293-321EDEDEEKEKKKKKNNGQQQKQFKTRKWYVHydrophilic
335-356EDDQARYRKRFGKDRPANAREGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-52PSKRARRAMKKGKSATSKSKK
300-306EKKKKKN
342-376RKRFGKDRPANAREGAGGQRGPREGGGERRQQHKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSPVDSAPETNASKRKADVDEIEVDLEAPEPPSKRARRAMKKGKSATSKSKKDNDIDDLEEDETTDKKDDKAVARSEHGVWIGNLRFSVTPQELRKWLIDNSGGVLTGDMITRLKLPLSKTPGRDKSAAPLNKGFAYVDFSDIGGKVAAIALSETEWNGRRLLIKDSKSFEGRPKKESEAKEDGEGGRSGTRGQPAVDPNASRKIFVGNMSFKTTEDDVLRNFEKCGEIEWAKVATFEDTGKCKGYGWVKFKDPEAAAWAVKGFVKIKEAVETEEDFRDDDDKVKSGDEDEDEDEDEEKEKKKKKNNGQQQKQFKTRKWYVNRMLGRELKLQLAEDDQARYRKRFGKDRPANAREGAGGQRGPREGGGERRQQHKKAETAEDIQTARLTGRVVESTGTKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.44
3 0.41
4 0.45
5 0.42
6 0.41
7 0.42
8 0.4
9 0.38
10 0.31
11 0.27
12 0.21
13 0.17
14 0.12
15 0.1
16 0.12
17 0.13
18 0.17
19 0.26
20 0.32
21 0.4
22 0.49
23 0.58
24 0.65
25 0.75
26 0.83
27 0.83
28 0.88
29 0.88
30 0.88
31 0.86
32 0.83
33 0.83
34 0.83
35 0.83
36 0.81
37 0.82
38 0.79
39 0.75
40 0.73
41 0.69
42 0.63
43 0.57
44 0.5
45 0.43
46 0.36
47 0.31
48 0.24
49 0.19
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.17
56 0.23
57 0.28
58 0.35
59 0.39
60 0.41
61 0.43
62 0.45
63 0.42
64 0.39
65 0.33
66 0.27
67 0.21
68 0.23
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.21
76 0.19
77 0.24
78 0.26
79 0.31
80 0.32
81 0.34
82 0.35
83 0.32
84 0.3
85 0.28
86 0.26
87 0.22
88 0.22
89 0.2
90 0.18
91 0.15
92 0.13
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.11
103 0.14
104 0.21
105 0.29
106 0.34
107 0.38
108 0.48
109 0.54
110 0.55
111 0.55
112 0.48
113 0.48
114 0.52
115 0.5
116 0.43
117 0.39
118 0.37
119 0.35
120 0.35
121 0.28
122 0.18
123 0.2
124 0.16
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.08
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.15
149 0.22
150 0.27
151 0.29
152 0.33
153 0.37
154 0.39
155 0.39
156 0.39
157 0.4
158 0.44
159 0.43
160 0.42
161 0.43
162 0.45
163 0.5
164 0.5
165 0.49
166 0.46
167 0.44
168 0.41
169 0.39
170 0.34
171 0.28
172 0.26
173 0.18
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.18
186 0.18
187 0.26
188 0.25
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.23
195 0.18
196 0.2
197 0.22
198 0.22
199 0.2
200 0.22
201 0.2
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.13
206 0.17
207 0.18
208 0.16
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.12
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.18
232 0.24
233 0.29
234 0.32
235 0.35
236 0.38
237 0.4
238 0.4
239 0.41
240 0.35
241 0.27
242 0.26
243 0.24
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.17
286 0.23
287 0.3
288 0.37
289 0.47
290 0.57
291 0.66
292 0.75
293 0.82
294 0.86
295 0.89
296 0.92
297 0.93
298 0.92
299 0.91
300 0.88
301 0.82
302 0.81
303 0.79
304 0.79
305 0.77
306 0.79
307 0.77
308 0.8
309 0.8
310 0.74
311 0.72
312 0.68
313 0.62
314 0.57
315 0.5
316 0.42
317 0.37
318 0.33
319 0.26
320 0.23
321 0.21
322 0.17
323 0.19
324 0.21
325 0.27
326 0.3
327 0.31
328 0.36
329 0.42
330 0.48
331 0.55
332 0.61
333 0.66
334 0.72
335 0.81
336 0.84
337 0.81
338 0.77
339 0.68
340 0.6
341 0.49
342 0.43
343 0.35
344 0.29
345 0.26
346 0.24
347 0.27
348 0.27
349 0.26
350 0.23
351 0.24
352 0.24
353 0.31
354 0.38
355 0.43
356 0.47
357 0.56
358 0.64
359 0.66
360 0.71
361 0.69
362 0.68
363 0.66
364 0.68
365 0.64
366 0.61
367 0.6
368 0.56
369 0.49
370 0.42
371 0.35
372 0.28
373 0.22
374 0.19
375 0.16
376 0.12
377 0.15
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.19
382 0.21
383 0.24