Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162JK33

Protein Details
Accession A0A162JK33    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-36PEPVSPKADRKAKKSHKSDKKRSREADAVABasic
38-119PEERRHKKSKSVSADNSQQHDDVADKKEKKKKKKKTSKHDSEGEVDKSDKKKSRKKHADGEEKAERKKKKSKKANDDAKAIDBasic
387-412AHALKMRRDTRTNRRLERRRAPEFSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-47KADRKAKKSHKSDKKRSREADAVADPEERRHKKSK
63-111KKEKKKKKKKTSKHDSEGEVDKSDKKKSRKKHADGEEKAERKKKKSKKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPAATSPEPVSPKADRKAKKSHKSDKKRSREADAVADPEERRHKKSKSVSADNSQQHDDVADKKEKKKKKKKTSKHDSEGEVDKSDKKKSRKKHADGEEKAERKKKKSKKANDDAKAIDIDGETALAQSQLESESAQAADAMDIDEPVVNSISDIYQPPDIPAKPQFPFFSQTVSLYEPIYPIGWAQPVTNCEFHYLRHLQNKYVPSLRGVLMNYKNVALGDEPSRVGAASSDEEVTTLKSQREYGVGFGWITADVDLFMPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPSWKWVSNEDPEAEGMEETASIVAPDEHGVVHQIHSTGFWVDANGDKVKGKIRFRIRNFDVGVSGETTYLSLEGTMLDKASEKELVQKEAHALKMRRDTRTNRRLERRRAPEFSMTRFFSEEEKQAHEEREATRAAERAAAAEAETAAAASSEGTKIVFEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.61
4 0.71
5 0.76
6 0.8
7 0.83
8 0.84
9 0.86
10 0.91
11 0.95
12 0.94
13 0.94
14 0.94
15 0.89
16 0.87
17 0.83
18 0.76
19 0.74
20 0.67
21 0.59
22 0.51
23 0.49
24 0.41
25 0.39
26 0.45
27 0.4
28 0.42
29 0.48
30 0.5
31 0.56
32 0.66
33 0.7
34 0.7
35 0.76
36 0.77
37 0.76
38 0.82
39 0.78
40 0.72
41 0.64
42 0.54
43 0.43
44 0.36
45 0.31
46 0.27
47 0.27
48 0.32
49 0.36
50 0.45
51 0.54
52 0.63
53 0.72
54 0.78
55 0.83
56 0.85
57 0.9
58 0.93
59 0.95
60 0.97
61 0.96
62 0.95
63 0.91
64 0.84
65 0.79
66 0.74
67 0.66
68 0.56
69 0.47
70 0.44
71 0.4
72 0.44
73 0.46
74 0.49
75 0.55
76 0.63
77 0.72
78 0.77
79 0.82
80 0.84
81 0.87
82 0.88
83 0.84
84 0.83
85 0.81
86 0.75
87 0.73
88 0.71
89 0.66
90 0.63
91 0.69
92 0.7
93 0.71
94 0.76
95 0.81
96 0.84
97 0.89
98 0.92
99 0.88
100 0.85
101 0.76
102 0.67
103 0.56
104 0.45
105 0.35
106 0.23
107 0.17
108 0.1
109 0.09
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.16
147 0.16
148 0.18
149 0.22
150 0.26
151 0.25
152 0.28
153 0.29
154 0.26
155 0.3
156 0.27
157 0.26
158 0.21
159 0.22
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.22
183 0.24
184 0.26
185 0.33
186 0.34
187 0.32
188 0.37
189 0.39
190 0.35
191 0.35
192 0.31
193 0.24
194 0.25
195 0.24
196 0.21
197 0.19
198 0.22
199 0.21
200 0.22
201 0.21
202 0.19
203 0.18
204 0.15
205 0.15
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.17
279 0.22
280 0.22
281 0.25
282 0.25
283 0.23
284 0.24
285 0.31
286 0.34
287 0.35
288 0.36
289 0.38
290 0.43
291 0.44
292 0.44
293 0.37
294 0.32
295 0.27
296 0.25
297 0.2
298 0.14
299 0.1
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.16
332 0.23
333 0.29
334 0.31
335 0.36
336 0.46
337 0.55
338 0.6
339 0.69
340 0.65
341 0.67
342 0.65
343 0.57
344 0.48
345 0.4
346 0.35
347 0.26
348 0.22
349 0.14
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.11
365 0.13
366 0.12
367 0.21
368 0.24
369 0.28
370 0.27
371 0.28
372 0.31
373 0.34
374 0.38
375 0.38
376 0.37
377 0.39
378 0.49
379 0.54
380 0.55
381 0.59
382 0.64
383 0.66
384 0.74
385 0.76
386 0.77
387 0.82
388 0.86
389 0.88
390 0.89
391 0.88
392 0.87
393 0.83
394 0.78
395 0.77
396 0.73
397 0.69
398 0.66
399 0.59
400 0.52
401 0.48
402 0.43
403 0.37
404 0.37
405 0.36
406 0.31
407 0.34
408 0.36
409 0.37
410 0.39
411 0.36
412 0.36
413 0.31
414 0.32
415 0.29
416 0.26
417 0.26
418 0.26
419 0.24
420 0.23
421 0.22
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.13
427 0.12
428 0.09
429 0.09
430 0.07
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.08