Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168J9Q3

Protein Details
Accession A0A168J9Q3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219GSANGQKRHPQRPQPLHRSSHydrophilic
263-286DHGRDQRNNKRKHDHQNRPKDIKEBasic
485-510GDGRPPMRFRRSSRDRSRSTSRNRDIHydrophilic
512-540DLPPLDRRRSRSLQRRSSPSRSPRSRTSSHydrophilic
565-595TDSGARRRPERIAPPKAKRRKPTNSAFSRRWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-230K
237-237K
254-257KPPK
265-293GRDQRNNKRKHDHQNRPKDIKEHHPGRHH
519-523RRSRS
526-527RR
568-588GARRRPERIAPPKAKRRKPTN
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTHQVATQSSRPEEPQCYNCGGMGHWAVACPEPTRETPAGLAAWRTASATRPGSGRAQQSDGRKSKGPIITKYGPPPPPVGYSAHYPPPPGYPPPPHSYPAPPPQPPPYPPQYHYPPGHGQPPPPPPPNHGQHHYPPSSYPPPSESYPAQHPRPSYPRPSQEYGTATGVPQSYGGYPYLAQDSQQFVAPRPAYSGSYAQGSANGQKRHPQRPQPLHRSSASSPPKPQAPKVASSPPKPAASSPPAPITHALPPKPPKSVHEIDHGRDQRNNKRKHDHQNRPKDIKEHHPGRHHGSPKAIPVIHNHNQGNTNGQHQQGAQNRQGKQGSNRRRSSAGNHGSNQPPMQRQLSKDSLNERTPSAQRSPHVNNEGRRRSSNSEQTHGRANHSKPGDGTRQDSHTPKAVEKTPTLLQSIPSLPPKPVTVVEARVLKPTDEHATSAFSNSSQLSERNVRSINGHKDRDNDDRSSTARNRTKSESSVQDDVEGDGRPPMRFRRSSRDRSRSTSRNRDIDDLPPLDRRRSRSLQRRSSPSRSPRSRTSSVSSRSSDLNSLEAELLGVSARRPSTDSGARRRPERIAPPKAKRRKPTNSAFSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.44
4 0.45
5 0.42
6 0.4
7 0.35
8 0.29
9 0.27
10 0.24
11 0.21
12 0.18
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.15
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.28
22 0.27
23 0.27
24 0.27
25 0.28
26 0.27
27 0.24
28 0.24
29 0.18
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.22
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.27
40 0.32
41 0.37
42 0.4
43 0.37
44 0.4
45 0.43
46 0.49
47 0.56
48 0.56
49 0.55
50 0.52
51 0.51
52 0.54
53 0.56
54 0.55
55 0.5
56 0.54
57 0.56
58 0.57
59 0.61
60 0.62
61 0.58
62 0.53
63 0.51
64 0.46
65 0.43
66 0.39
67 0.36
68 0.3
69 0.32
70 0.34
71 0.37
72 0.35
73 0.33
74 0.32
75 0.34
76 0.35
77 0.35
78 0.37
79 0.39
80 0.44
81 0.49
82 0.52
83 0.49
84 0.48
85 0.5
86 0.52
87 0.53
88 0.55
89 0.52
90 0.53
91 0.58
92 0.6
93 0.56
94 0.55
95 0.54
96 0.53
97 0.52
98 0.56
99 0.56
100 0.57
101 0.57
102 0.56
103 0.53
104 0.5
105 0.56
106 0.5
107 0.46
108 0.45
109 0.52
110 0.54
111 0.54
112 0.52
113 0.49
114 0.55
115 0.6
116 0.6
117 0.55
118 0.54
119 0.55
120 0.63
121 0.6
122 0.52
123 0.46
124 0.46
125 0.48
126 0.43
127 0.37
128 0.31
129 0.33
130 0.34
131 0.37
132 0.32
133 0.29
134 0.37
135 0.43
136 0.43
137 0.43
138 0.42
139 0.46
140 0.52
141 0.53
142 0.52
143 0.54
144 0.59
145 0.62
146 0.64
147 0.58
148 0.56
149 0.53
150 0.47
151 0.41
152 0.33
153 0.26
154 0.25
155 0.23
156 0.17
157 0.14
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.18
173 0.16
174 0.24
175 0.24
176 0.21
177 0.21
178 0.22
179 0.2
180 0.22
181 0.23
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.15
187 0.15
188 0.18
189 0.23
190 0.24
191 0.23
192 0.3
193 0.37
194 0.45
195 0.52
196 0.55
197 0.59
198 0.68
199 0.78
200 0.81
201 0.79
202 0.74
203 0.67
204 0.64
205 0.55
206 0.55
207 0.52
208 0.46
209 0.44
210 0.42
211 0.47
212 0.44
213 0.44
214 0.43
215 0.38
216 0.38
217 0.39
218 0.46
219 0.45
220 0.46
221 0.5
222 0.44
223 0.43
224 0.4
225 0.37
226 0.34
227 0.34
228 0.34
229 0.3
230 0.31
231 0.3
232 0.3
233 0.3
234 0.26
235 0.26
236 0.28
237 0.27
238 0.28
239 0.34
240 0.35
241 0.38
242 0.37
243 0.32
244 0.35
245 0.39
246 0.35
247 0.39
248 0.4
249 0.38
250 0.46
251 0.48
252 0.41
253 0.4
254 0.44
255 0.45
256 0.51
257 0.57
258 0.54
259 0.6
260 0.67
261 0.74
262 0.79
263 0.8
264 0.81
265 0.85
266 0.87
267 0.84
268 0.77
269 0.71
270 0.64
271 0.62
272 0.61
273 0.58
274 0.54
275 0.55
276 0.56
277 0.57
278 0.61
279 0.55
280 0.47
281 0.43
282 0.39
283 0.35
284 0.36
285 0.3
286 0.24
287 0.23
288 0.3
289 0.3
290 0.35
291 0.33
292 0.3
293 0.32
294 0.31
295 0.32
296 0.24
297 0.23
298 0.19
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.23
303 0.25
304 0.29
305 0.32
306 0.35
307 0.36
308 0.4
309 0.42
310 0.38
311 0.4
312 0.46
313 0.5
314 0.54
315 0.56
316 0.53
317 0.54
318 0.54
319 0.5
320 0.51
321 0.49
322 0.44
323 0.43
324 0.45
325 0.44
326 0.43
327 0.39
328 0.32
329 0.25
330 0.24
331 0.26
332 0.25
333 0.25
334 0.31
335 0.34
336 0.34
337 0.35
338 0.37
339 0.38
340 0.38
341 0.37
342 0.31
343 0.31
344 0.3
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.26
349 0.33
350 0.36
351 0.39
352 0.44
353 0.45
354 0.48
355 0.54
356 0.6
357 0.56
358 0.54
359 0.52
360 0.51
361 0.54
362 0.58
363 0.51
364 0.49
365 0.49
366 0.48
367 0.51
368 0.46
369 0.43
370 0.4
371 0.38
372 0.39
373 0.38
374 0.37
375 0.3
376 0.35
377 0.37
378 0.32
379 0.34
380 0.3
381 0.33
382 0.36
383 0.37
384 0.34
385 0.33
386 0.32
387 0.3
388 0.32
389 0.33
390 0.32
391 0.31
392 0.33
393 0.3
394 0.3
395 0.3
396 0.26
397 0.22
398 0.22
399 0.23
400 0.22
401 0.24
402 0.23
403 0.21
404 0.22
405 0.23
406 0.22
407 0.2
408 0.2
409 0.19
410 0.2
411 0.24
412 0.28
413 0.28
414 0.3
415 0.29
416 0.26
417 0.24
418 0.24
419 0.25
420 0.2
421 0.2
422 0.17
423 0.2
424 0.2
425 0.21
426 0.18
427 0.13
428 0.14
429 0.13
430 0.14
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.23
435 0.24
436 0.28
437 0.29
438 0.28
439 0.31
440 0.38
441 0.44
442 0.45
443 0.49
444 0.46
445 0.5
446 0.55
447 0.59
448 0.55
449 0.47
450 0.41
451 0.4
452 0.4
453 0.43
454 0.42
455 0.44
456 0.45
457 0.47
458 0.49
459 0.53
460 0.56
461 0.52
462 0.54
463 0.52
464 0.51
465 0.51
466 0.46
467 0.42
468 0.37
469 0.34
470 0.29
471 0.21
472 0.15
473 0.15
474 0.16
475 0.15
476 0.18
477 0.24
478 0.31
479 0.38
480 0.43
481 0.51
482 0.59
483 0.7
484 0.77
485 0.81
486 0.78
487 0.79
488 0.83
489 0.81
490 0.82
491 0.82
492 0.79
493 0.77
494 0.74
495 0.72
496 0.65
497 0.6
498 0.57
499 0.49
500 0.43
501 0.42
502 0.42
503 0.44
504 0.47
505 0.48
506 0.49
507 0.55
508 0.63
509 0.66
510 0.75
511 0.77
512 0.82
513 0.86
514 0.86
515 0.85
516 0.84
517 0.84
518 0.84
519 0.83
520 0.81
521 0.8
522 0.8
523 0.77
524 0.73
525 0.71
526 0.69
527 0.66
528 0.66
529 0.59
530 0.53
531 0.5
532 0.47
533 0.43
534 0.34
535 0.3
536 0.23
537 0.22
538 0.2
539 0.17
540 0.15
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.14
550 0.17
551 0.25
552 0.34
553 0.42
554 0.48
555 0.58
556 0.62
557 0.64
558 0.66
559 0.64
560 0.64
561 0.67
562 0.67
563 0.68
564 0.74
565 0.8
566 0.87
567 0.91
568 0.91
569 0.91
570 0.91
571 0.91
572 0.9
573 0.9
574 0.9
575 0.9