Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168J402

Protein Details
Accession A0A168J402    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRISHydrophilic
618-644VDKVQAQMPRRVKKKRRVEGEDTYEEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
627-634RRVKKKRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.833, cyto 8, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESTRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEGGIQAPQQRFSDLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRISLRNWTQYAAWELEQKEFARARSVFERALDVHPNSVQLWVRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTRLPRVDKLWYKYAYMEEMLGNIPGTRQIFDRWMQWQPDEAAWSSYIKLEKRYGEFERAREIFAMFTQIHPEPRNWIKWAKFEEEFGTSDLVRDVFGNAVEALGDELADEKLFIAYARFESKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSATLHKSYTTFEKQFGDQDGVEDVVLSKRRVYYEGLVRENPKNYDAWFDFAALEEASRDADRVRDVYERAVAQVPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMEGQDAERARQIYTTCLGLLPHKKFTFAKMWLLAAQFEIRQGQLTAARKLLGRALGTCPKDRLFVGYVDLERRLYEFARCRTLYEKHVEYNPANCTTWIRFAELECALEDIDRARAIFELAVGQDQLDMPELLWKAYIDFEEGEGEYDRARTLYERLLEKTDHVKVWISYAHFEVNIPEGGDEEENEEEEQEQPVSEEAKERTRRVFERAHKSMRDKDLKEERVALLNAWLSFERTHGAEADVDKVQAQMPRRVKKKRRVEGEDTYEEYVDYVFPADDKQAGNLSNMLAMAQSWKQTGGSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.23
24 0.26
25 0.28
26 0.31
27 0.33
28 0.31
29 0.31
30 0.3
31 0.31
32 0.34
33 0.27
34 0.29
35 0.32
36 0.33
37 0.34
38 0.38
39 0.34
40 0.33
41 0.41
42 0.43
43 0.4
44 0.43
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.69
55 0.68
56 0.66
57 0.62
58 0.62
59 0.61
60 0.61
61 0.62
62 0.62
63 0.55
64 0.49
65 0.47
66 0.39
67 0.31
68 0.28
69 0.27
70 0.28
71 0.31
72 0.28
73 0.31
74 0.3
75 0.29
76 0.32
77 0.31
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.33
82 0.31
83 0.34
84 0.29
85 0.33
86 0.34
87 0.29
88 0.28
89 0.27
90 0.28
91 0.24
92 0.26
93 0.24
94 0.18
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.24
103 0.23
104 0.25
105 0.28
106 0.29
107 0.36
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.38
117 0.34
118 0.34
119 0.34
120 0.32
121 0.3
122 0.32
123 0.34
124 0.34
125 0.36
126 0.4
127 0.4
128 0.44
129 0.51
130 0.46
131 0.45
132 0.43
133 0.42
134 0.36
135 0.29
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.22
152 0.23
153 0.28
154 0.3
155 0.29
156 0.3
157 0.28
158 0.27
159 0.26
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.14
165 0.15
166 0.18
167 0.17
168 0.21
169 0.24
170 0.27
171 0.3
172 0.36
173 0.36
174 0.42
175 0.44
176 0.42
177 0.46
178 0.42
179 0.4
180 0.34
181 0.31
182 0.22
183 0.18
184 0.21
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.23
193 0.28
194 0.31
195 0.31
196 0.36
197 0.35
198 0.41
199 0.45
200 0.43
201 0.39
202 0.37
203 0.36
204 0.32
205 0.3
206 0.24
207 0.21
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.16
242 0.22
243 0.23
244 0.29
245 0.28
246 0.34
247 0.39
248 0.39
249 0.38
250 0.33
251 0.33
252 0.28
253 0.29
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.33
262 0.35
263 0.35
264 0.35
265 0.42
266 0.46
267 0.44
268 0.42
269 0.41
270 0.39
271 0.37
272 0.39
273 0.37
274 0.3
275 0.29
276 0.28
277 0.27
278 0.27
279 0.27
280 0.23
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.18
297 0.24
298 0.3
299 0.32
300 0.32
301 0.35
302 0.36
303 0.36
304 0.32
305 0.25
306 0.2
307 0.17
308 0.21
309 0.18
310 0.18
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.08
317 0.08
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.14
381 0.21
382 0.22
383 0.28
384 0.27
385 0.3
386 0.3
387 0.33
388 0.36
389 0.31
390 0.32
391 0.27
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.23
396 0.17
397 0.15
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.13
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.14
416 0.18
417 0.24
418 0.26
419 0.27
420 0.27
421 0.26
422 0.27
423 0.25
424 0.24
425 0.19
426 0.17
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.19
431 0.19
432 0.16
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.11
437 0.16
438 0.21
439 0.24
440 0.31
441 0.31
442 0.32
443 0.36
444 0.39
445 0.39
446 0.38
447 0.38
448 0.34
449 0.37
450 0.39
451 0.36
452 0.36
453 0.35
454 0.31
455 0.29
456 0.26
457 0.26
458 0.24
459 0.29
460 0.25
461 0.23
462 0.21
463 0.21
464 0.25
465 0.22
466 0.21
467 0.15
468 0.14
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.15
516 0.2
517 0.23
518 0.26
519 0.29
520 0.29
521 0.3
522 0.34
523 0.33
524 0.29
525 0.27
526 0.27
527 0.24
528 0.26
529 0.27
530 0.22
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.18
535 0.18
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.15
560 0.17
561 0.26
562 0.32
563 0.35
564 0.4
565 0.47
566 0.49
567 0.5
568 0.57
569 0.58
570 0.62
571 0.68
572 0.7
573 0.69
574 0.73
575 0.75
576 0.75
577 0.75
578 0.67
579 0.68
580 0.71
581 0.68
582 0.65
583 0.6
584 0.52
585 0.48
586 0.47
587 0.37
588 0.3
589 0.28
590 0.25
591 0.22
592 0.21
593 0.17
594 0.16
595 0.17
596 0.16
597 0.14
598 0.15
599 0.13
600 0.14
601 0.16
602 0.16
603 0.19
604 0.18
605 0.17
606 0.16
607 0.16
608 0.17
609 0.18
610 0.22
611 0.27
612 0.36
613 0.45
614 0.55
615 0.65
616 0.73
617 0.79
618 0.86
619 0.87
620 0.88
621 0.88
622 0.88
623 0.87
624 0.86
625 0.81
626 0.74
627 0.65
628 0.54
629 0.45
630 0.36
631 0.26
632 0.17
633 0.11
634 0.09
635 0.07
636 0.07
637 0.09
638 0.1
639 0.13
640 0.13
641 0.15
642 0.19
643 0.2
644 0.21
645 0.21
646 0.2
647 0.18
648 0.17
649 0.14
650 0.1
651 0.09
652 0.12
653 0.13
654 0.14
655 0.14
656 0.15
657 0.15