FuNGI

A0A168JY42

Protein Details

Accession

A0A168JY42

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
670-689	GSLTPWSRRHPRKALPGPVH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 5.5, cyto_nucl 5.5, extr 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011048 Haem_d1_sf IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MTAIDIHRCRFVPFQPSAINAVAFSHPRTRDSKHAAIARLAVGRANGDIEIWNAAAGIWHQELVIRGGKDRSIDGLVWINEPDQDLGEGRILIGKSRLFSIGYTSTVTEWDLETGKPKRHASGQHGDIWCIAAQPALIDERGSSVTDTQGSNKLVAGTIDGELVMYSVEDDDLRFQRILVKSPTKKAQMVSIIFQSRKVVIVGCSDSTIRAYDITKGHMLRRMTLGSDLVGGSKDIIVWSVKCLPNGNIVSGDSTGQVCIWDGKTYTQMQRLQSHKQDVLSLAISADGSTIMSGGMDRRTVLYKQNSGAGQRWGKVWGRRYHEHDVKAMATFEHARISVVVSGGPDSNLVVVPLKEMGRENHRMVSSLPQQPPLISASKARFMVSWWDREIHLWLLQQSASDLTKLNGDSDYDINQNRRLLKTIVVKGDSNISSASINADGTLLVASTSTDVKAFALEHSNPIKPADVTLSSLELPERLTKLGASRVQISPDGSWLCFVQDGSRVVIASITPDSGSHTISTSRHLRRLHRSVPKYILNGGLGSYERNVTHISFSPDSKLLAVADLAGYVDTWVLRVPGDATANGHANGNEDGDASASDSDSSDDDVESTGTSEVGRWVRNPNAKLMPKLPAAPSVLAFSDSVPGQGGTEDYTLAAVTSSWNVVAFNVLQGSLTPWSRRHPRKALPGPVHDLLDLAKGAFWQGPRFWIYGVSFLFMLDMSQDLPAPEKDAGDQLVPGTKRKRTNATSGAGGRMEKEGLKPQQIRKYAANKWEDVDVDGPSLSGENDNDSDDDMIDATDSELTQLRSATAASGTQSGGAEDESGRKKWWITYKYRPVLGVVSFSGQEGLEVALVERPTWDIDMQDSYYTGEEWERR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.41
3	0.42
4	0.43
5	0.4
6	0.35
7	0.26
8	0.26
9	0.23
10	0.22
11	0.23
12	0.27
13	0.27
14	0.31
15	0.36
16	0.39
17	0.45
18	0.52
19	0.56
20	0.56
21	0.61
22	0.59
23	0.57
24	0.54
25	0.48
26	0.42
27	0.35
28	0.28
29	0.22
30	0.2
31	0.18
32	0.16
33	0.12
34	0.1
35	0.11
36	0.1
37	0.11
38	0.1
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.13
50	0.16
51	0.21
52	0.18
53	0.2
54	0.22
55	0.24
56	0.24
57	0.24
58	0.23
59	0.21
60	0.2
61	0.21
62	0.25
63	0.24
64	0.24
65	0.24
66	0.2
67	0.18
68	0.19
69	0.17
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.13
75	0.11
76	0.1
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.16
81	0.17
82	0.16
83	0.18
84	0.2
85	0.16
86	0.17
87	0.21
88	0.2
89	0.2
90	0.21
91	0.2
92	0.19
93	0.19
94	0.19
95	0.14
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.2
101	0.24
102	0.3
103	0.37
104	0.38
105	0.4
106	0.46
107	0.53
108	0.54
109	0.59
110	0.57
111	0.58
112	0.57
113	0.53
114	0.46
115	0.4
116	0.31
117	0.22
118	0.17
119	0.09
120	0.08
121	0.07
122	0.09
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.1
128	0.11
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.12
133	0.15
134	0.16
135	0.16
136	0.21
137	0.22
138	0.21
139	0.21
140	0.2
141	0.18
142	0.17
143	0.16
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.05
152	0.04
153	0.03
154	0.03
155	0.04
156	0.04
157	0.05
158	0.1
159	0.12
160	0.14
161	0.14
162	0.14
163	0.21
164	0.23
165	0.28
166	0.31
167	0.4
168	0.43
169	0.5
170	0.57
171	0.55
172	0.56
173	0.52
174	0.51
175	0.48
176	0.46
177	0.42
178	0.41
179	0.42
180	0.39
181	0.39
182	0.34
183	0.26
184	0.25
185	0.22
186	0.17
187	0.13
188	0.17
189	0.18
190	0.17
191	0.18
192	0.17
193	0.17
194	0.16
195	0.15
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.15
200	0.16
201	0.19
202	0.23
203	0.24
204	0.26
205	0.3
206	0.3
207	0.27
208	0.29
209	0.27
210	0.23
211	0.23
212	0.21
213	0.16
214	0.16
215	0.14
216	0.1
217	0.09
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.11
227	0.18
228	0.2
229	0.21
230	0.23
231	0.23
232	0.3
233	0.3
234	0.28
235	0.22
236	0.21
237	0.21
238	0.19
239	0.18
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.06
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.15
252	0.19
253	0.23
254	0.28
255	0.31
256	0.34
257	0.41
258	0.44
259	0.48
260	0.49
261	0.51
262	0.46
263	0.42
264	0.4
265	0.33
266	0.31
267	0.24
268	0.18
269	0.12
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.07
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.08
286	0.11
287	0.13
288	0.19
289	0.24
290	0.26
291	0.27
292	0.31
293	0.31
294	0.31
295	0.32
296	0.32
297	0.29
298	0.26
299	0.26
300	0.26
301	0.29
302	0.32
303	0.37
304	0.38
305	0.42
306	0.47
307	0.53
308	0.59
309	0.61
310	0.58
311	0.51
312	0.46
313	0.4
314	0.35
315	0.28
316	0.18
317	0.14
318	0.13
319	0.12
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.11
325	0.1
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.1
344	0.12
345	0.17
346	0.22
347	0.23
348	0.25
349	0.26
350	0.26
351	0.25
352	0.29
353	0.3
354	0.33
355	0.33
356	0.31
357	0.31
358	0.3
359	0.3
360	0.26
361	0.21
362	0.14
363	0.17
364	0.16
365	0.2
366	0.21
367	0.2
368	0.17
369	0.16
370	0.25
371	0.23
372	0.25
373	0.22
374	0.23
375	0.22
376	0.23
377	0.24
378	0.16
379	0.16
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.09
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.11
399	0.12
400	0.14
401	0.14
402	0.17
403	0.19
404	0.2
405	0.19
406	0.2
407	0.19
408	0.22
409	0.28
410	0.3
411	0.31
412	0.3
413	0.29
414	0.27
415	0.3
416	0.25
417	0.18
418	0.14
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.06
443	0.09
444	0.09
445	0.13
446	0.16
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.13
452	0.13
453	0.11
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.1
469	0.15
470	0.17
471	0.16
472	0.19
473	0.19
474	0.21
475	0.21
476	0.21
477	0.15
478	0.16
479	0.15
480	0.12
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.07
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.1
495	0.07
496	0.07
497	0.06
498	0.05
499	0.06
500	0.08
501	0.09
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.12
506	0.12
507	0.17
508	0.23
509	0.25
510	0.31
511	0.35
512	0.4
513	0.47
514	0.55
515	0.59
516	0.61
517	0.62
518	0.61
519	0.63
520	0.61
521	0.53
522	0.46
523	0.39
524	0.3
525	0.26
526	0.21
527	0.16
528	0.12
529	0.11
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.12
537	0.14
538	0.19
539	0.19
540	0.19
541	0.21
542	0.2
543	0.2
544	0.18
545	0.16
546	0.11
547	0.09
548	0.09
549	0.06
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.03
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.05
564	0.07
565	0.09
566	0.09
567	0.1
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.13
572	0.11
573	0.12
574	0.12
575	0.11
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.07
580	0.07
581	0.06
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.06
595	0.07
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.1
601	0.12
602	0.13
603	0.14
604	0.19
605	0.26
606	0.33
607	0.34
608	0.36
609	0.42
610	0.45
611	0.46
612	0.44
613	0.42
614	0.38
615	0.4
616	0.34
617	0.29
618	0.28
619	0.25
620	0.23
621	0.2
622	0.18
623	0.16
624	0.15
625	0.11
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.06
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.04
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.08
651	0.07
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.09
658	0.11
659	0.12
660	0.14
661	0.16
662	0.24
663	0.35
664	0.43
665	0.51
666	0.57
667	0.63
668	0.72
669	0.8
670	0.82
671	0.8
672	0.77
673	0.74
674	0.67
675	0.59
676	0.48
677	0.38
678	0.28
679	0.22
680	0.17
681	0.1
682	0.08
683	0.07
684	0.08
685	0.1
686	0.11
687	0.12
688	0.13
689	0.16
690	0.19
691	0.19
692	0.19
693	0.21
694	0.2
695	0.23
696	0.22
697	0.2
698	0.18
699	0.17
700	0.17
701	0.12
702	0.11
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.09
710	0.09
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.13
715	0.15
716	0.16
717	0.14
718	0.14
719	0.12
720	0.17
721	0.18
722	0.23
723	0.27
724	0.33
725	0.4
726	0.46
727	0.54
728	0.53
729	0.62
730	0.64
731	0.61
732	0.62
733	0.57
734	0.54
735	0.46
736	0.41
737	0.32
738	0.26
739	0.24
740	0.18
741	0.19
742	0.24
743	0.27
744	0.36
745	0.42
746	0.49
747	0.56
748	0.6
749	0.62
750	0.61
751	0.66
752	0.64
753	0.66
754	0.62
755	0.55
756	0.51
757	0.5
758	0.42
759	0.36
760	0.3
761	0.22
762	0.18
763	0.16
764	0.14
765	0.11
766	0.11
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.11
771	0.12
772	0.14
773	0.14
774	0.14
775	0.14
776	0.12
777	0.12
778	0.09
779	0.08
780	0.07
781	0.07
782	0.06
783	0.07
784	0.06
785	0.07
786	0.1
787	0.11
788	0.12
789	0.13
790	0.12
791	0.12
792	0.13
793	0.12
794	0.11
795	0.11
796	0.11
797	0.13
798	0.12
799	0.13
800	0.13
801	0.12
802	0.12
803	0.11
804	0.11
805	0.1
806	0.17
807	0.2
808	0.21
809	0.23
810	0.24
811	0.26
812	0.32
813	0.41
814	0.43
815	0.48
816	0.58
817	0.67
818	0.73
819	0.74
820	0.67
821	0.6
822	0.56
823	0.48
824	0.41
825	0.31
826	0.26
827	0.23
828	0.22
829	0.2
830	0.15
831	0.13
832	0.1
833	0.09
834	0.07
835	0.07
836	0.08
837	0.1
838	0.1
839	0.1
840	0.1
841	0.11
842	0.12
843	0.14
844	0.14
845	0.12
846	0.15
847	0.19
848	0.2
849	0.2
850	0.19
851	0.18
852	0.18
853	0.17
854	0.16

A0A168JY42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer