FuNGI

A0A162JLV0

Protein Details

Accession

A0A162JLV0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-38	MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVAAKRP	Hydrophilic
182-206	PVAKEVVPKKPKKQKEERAVFNRGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-46	NGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVAAKRPGQKPPTKP
186-208	EVVPKKPKKQKEERAVFNRGPRT
471-475	GKPKG
484-544	PQGKHKHGDKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAATAPGSRSGTPIPGAARKKKL

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPKNTNGPPKRKPNPLRPMRPKPRPNPLVAAKRPGQKPPTKPDAAGPSRLNAPNGSRQSLEELRRQYGGWSEPPPPYQYSDIPIMTTKKALLDGIRHHLMKLSSTKADGKPIDPTDQEEFARPVTLHRRDARLPPPGRVVKEEAPQRPPVDEQEREKLAQVKAEKEAQRAINQAKIAPVAKEVVPKKPKKQKEERAVFNRGPRTAAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDGAVFRMVPLEKWYRFTAKPHFQAFTLDQAEEYMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGQEDLQATRRMLYGAGMIKTESDTFKAASRAEKMEHDEIDMSGDEFQDDDETPMFERNDDEDTKDSKDRIRREQLGANLFGDGDEGQVDQELQQQLREELERQKFGKATRKALIKRDREDIYESDDSEDNPWSSSSDDDSSDEENEEKKDDEKKDGENKDDKDDKGKPKGSGTQGSTTPQGKHKHGDKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAATAPGSRSGTPIPGAARKKKLGAGSTSDGEATAGEMSDGAGPRKKIKLVGSTKGTPSASRAGSPAPAGASPPPSSAGIEPWEILEKIPDGGISIVELIKPFQSRVGIKPGQMAKADWIKLVTRLCEYGPDKLLRKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.87
3	0.89
4	0.88
5	0.89
6	0.89
7	0.91
8	0.91
9	0.93
10	0.93
11	0.95
12	0.94
13	0.93
14	0.93
15	0.89
16	0.84
17	0.82
18	0.81
19	0.81
20	0.75
21	0.74
22	0.69
23	0.71
24	0.69
25	0.68
26	0.68
27	0.66
28	0.7
29	0.71
30	0.74
31	0.69
32	0.66
33	0.65
34	0.66
35	0.62
36	0.6
37	0.52
38	0.46
39	0.5
40	0.51
41	0.45
42	0.38
43	0.38
44	0.4
45	0.43
46	0.42
47	0.36
48	0.35
49	0.41
50	0.45
51	0.45
52	0.42
53	0.42
54	0.42
55	0.42
56	0.41
57	0.35
58	0.33
59	0.33
60	0.31
61	0.31
62	0.33
63	0.35
64	0.38
65	0.39
66	0.36
67	0.35
68	0.34
69	0.32
70	0.32
71	0.33
72	0.31
73	0.29
74	0.31
75	0.31
76	0.27
77	0.27
78	0.23
79	0.19
80	0.2
81	0.2
82	0.19
83	0.23
84	0.27
85	0.33
86	0.37
87	0.36
88	0.35
89	0.37
90	0.34
91	0.32
92	0.32
93	0.3
94	0.26
95	0.29
96	0.36
97	0.34
98	0.41
99	0.38
100	0.35
101	0.38
102	0.39
103	0.4
104	0.34
105	0.37
106	0.33
107	0.35
108	0.34
109	0.29
110	0.27
111	0.23
112	0.25
113	0.2
114	0.21
115	0.28
116	0.33
117	0.38
118	0.41
119	0.46
120	0.48
121	0.56
122	0.57
123	0.58
124	0.54
125	0.5
126	0.55
127	0.55
128	0.53
129	0.5
130	0.49
131	0.44
132	0.49
133	0.53
134	0.49
135	0.48
136	0.5
137	0.47
138	0.43
139	0.4
140	0.4
141	0.4
142	0.4
143	0.4
144	0.43
145	0.45
146	0.43
147	0.44
148	0.43
149	0.36
150	0.36
151	0.34
152	0.3
153	0.31
154	0.38
155	0.38
156	0.34
157	0.39
158	0.36
159	0.36
160	0.38
161	0.37
162	0.33
163	0.31
164	0.29
165	0.25
166	0.25
167	0.23
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.16
172	0.23
173	0.23
174	0.3
175	0.39
176	0.44
177	0.53
178	0.61
179	0.68
180	0.71
181	0.8
182	0.81
183	0.83
184	0.86
185	0.86
186	0.84
187	0.83
188	0.76
189	0.72
190	0.67
191	0.56
192	0.48
193	0.39
194	0.39
195	0.36
196	0.38
197	0.36
198	0.33
199	0.33
200	0.4
201	0.41
202	0.36
203	0.34
204	0.31
205	0.29
206	0.28
207	0.29
208	0.22
209	0.23
210	0.2
211	0.17
212	0.15
213	0.13
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.1
250	0.16
251	0.16
252	0.2
253	0.22
254	0.26
255	0.27
256	0.32
257	0.37
258	0.4
259	0.45
260	0.45
261	0.44
262	0.39
263	0.42
264	0.38
265	0.34
266	0.27
267	0.21
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.15
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.22
282	0.23
283	0.24
284	0.25
285	0.28
286	0.28
287	0.26
288	0.28
289	0.24
290	0.24
291	0.24
292	0.24
293	0.21
294	0.21
295	0.22
296	0.21
297	0.24
298	0.24
299	0.23
300	0.22
301	0.22
302	0.18
303	0.15
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.1
311	0.11
312	0.12
313	0.09
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.1
318	0.12
319	0.12
320	0.13
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.2
328	0.18
329	0.16
330	0.15
331	0.14
332	0.12
333	0.09
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.09
349	0.1
350	0.13
351	0.13
352	0.15
353	0.15
354	0.17
355	0.2
356	0.21
357	0.21
358	0.22
359	0.28
360	0.32
361	0.38
362	0.44
363	0.46
364	0.48
365	0.51
366	0.52
367	0.49
368	0.44
369	0.36
370	0.27
371	0.22
372	0.18
373	0.14
374	0.09
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.08
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.13
391	0.19
392	0.24
393	0.27
394	0.27
395	0.3
396	0.31
397	0.34
398	0.41
399	0.38
400	0.4
401	0.42
402	0.49
403	0.51
404	0.59
405	0.64
406	0.61
407	0.6
408	0.6
409	0.56
410	0.5
411	0.49
412	0.41
413	0.38
414	0.32
415	0.29
416	0.25
417	0.23
418	0.21
419	0.19
420	0.19
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.12
430	0.13
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.15
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.12
440	0.14
441	0.21
442	0.23
443	0.28
444	0.29
445	0.36
446	0.44
447	0.47
448	0.51
449	0.51
450	0.51
451	0.53
452	0.55
453	0.49
454	0.47
455	0.51
456	0.52
457	0.54
458	0.57
459	0.51
460	0.5
461	0.57
462	0.55
463	0.54
464	0.51
465	0.46
466	0.43
467	0.43
468	0.43
469	0.38
470	0.35
471	0.35
472	0.37
473	0.36
474	0.41
475	0.48
476	0.54
477	0.6
478	0.68
479	0.67
480	0.72
481	0.79
482	0.79
483	0.77
484	0.75
485	0.73
486	0.7
487	0.7
488	0.62
489	0.56
490	0.5
491	0.46
492	0.4
493	0.33
494	0.25
495	0.21
496	0.23
497	0.22
498	0.21
499	0.23
500	0.22
501	0.27
502	0.36
503	0.41
504	0.39
505	0.45
506	0.53
507	0.59
508	0.64
509	0.68
510	0.69
511	0.69
512	0.69
513	0.64
514	0.62
515	0.55
516	0.48
517	0.4
518	0.32
519	0.28
520	0.25
521	0.24
522	0.2
523	0.25
524	0.33
525	0.39
526	0.44
527	0.45
528	0.47
529	0.49
530	0.51
531	0.48
532	0.45
533	0.44
534	0.42
535	0.41
536	0.38
537	0.33
538	0.28
539	0.23
540	0.18
541	0.12
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.08
548	0.1
549	0.12
550	0.15
551	0.17
552	0.22
553	0.27
554	0.28
555	0.31
556	0.35
557	0.43
558	0.47
559	0.54
560	0.57
561	0.57
562	0.57
563	0.58
564	0.53
565	0.43
566	0.39
567	0.37
568	0.31
569	0.28
570	0.28
571	0.24
572	0.25
573	0.25
574	0.22
575	0.17
576	0.16
577	0.16
578	0.17
579	0.2
580	0.19
581	0.19
582	0.2
583	0.19
584	0.21
585	0.2
586	0.21
587	0.19
588	0.19
589	0.18
590	0.18
591	0.2
592	0.18
593	0.18
594	0.17
595	0.14
596	0.14
597	0.14
598	0.12
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.13
609	0.14
610	0.14
611	0.16
612	0.22
613	0.25
614	0.29
615	0.38
616	0.38
617	0.38
618	0.46
619	0.47
620	0.45
621	0.44
622	0.4
623	0.38
624	0.42
625	0.42
626	0.35
627	0.33
628	0.3
629	0.34
630	0.36
631	0.32
632	0.27
633	0.28
634	0.27
635	0.34
636	0.35
637	0.37
638	0.4
639	0.43
640	0.47

A0A162JLV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer