Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168HRP1

Protein Details
Accession A0A168HRP1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-377IESVKHLKMKCQRLEKQVINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001514  DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS  
IPR011262  DNA-dir_RNA_pol_insert  
IPR011263  DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3  
IPR036603  RBP11-like  
IPR022842  RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1  
IPR033901  RNAPI/III_AC40  
IPR036643  RNApol_insert_sf  
Gene Ontology GO:0055029  C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0001054  F:RNA polymerase I activity  
GO:0001056  F:RNA polymerase III activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01000  RNA_pol_A_bac  
PF01193  RNA_pol_L  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00446  RNA_POL_D_30KD  
CDD cd07032  RNAP_I_II_AC40  
Amino Acid Sequences MAPSQQAAWRNAPDAEELERRRTVNINKETVTDISSIEYPGHVPGEDAAFTIERFQSDFSVDFHQNEQFHASFSLVGLDASIANAFRRILIAEIPTLAIENVFIENNTSVIQDEVLAHRLGLIPFKGGREGLQSFLKWYKKPADAEDDYTGGFDYNTVRLELNVTCTANKDADRDETDPTKAYHNAHVYARDIVFVPMGEQEKYFSGDDAIAPVNPDILIAKMRPKQTINLSMHMHKGIGADHAKFSPVATASYRLLPTIKILKPIVGVDAEKFQRCFPRGVVGLHKIAKKDATPGSGLEGHVGEMRAVVEDAMKDTVSRECLRHPEFEGKVKLGRRRDHFIFSIESTGQWDSDELFIESVKHLKMKCQRLEKQVINMVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.33
4 0.34
5 0.37
6 0.39
7 0.39
8 0.39
9 0.44
10 0.47
11 0.48
12 0.53
13 0.54
14 0.51
15 0.52
16 0.53
17 0.46
18 0.4
19 0.3
20 0.22
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.13
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.15
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.27
52 0.25
53 0.25
54 0.27
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.18
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.05
70 0.05
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.2
122 0.26
123 0.29
124 0.25
125 0.28
126 0.31
127 0.34
128 0.37
129 0.37
130 0.39
131 0.38
132 0.41
133 0.39
134 0.33
135 0.27
136 0.25
137 0.21
138 0.13
139 0.1
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.19
167 0.19
168 0.18
169 0.18
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.22
176 0.21
177 0.2
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.12
209 0.17
210 0.19
211 0.22
212 0.23
213 0.27
214 0.32
215 0.41
216 0.38
217 0.38
218 0.39
219 0.38
220 0.39
221 0.34
222 0.29
223 0.2
224 0.17
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.11
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.18
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.16
246 0.22
247 0.22
248 0.24
249 0.25
250 0.25
251 0.26
252 0.26
253 0.24
254 0.17
255 0.16
256 0.12
257 0.18
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.22
262 0.27
263 0.29
264 0.3
265 0.25
266 0.3
267 0.31
268 0.33
269 0.37
270 0.34
271 0.38
272 0.41
273 0.42
274 0.35
275 0.34
276 0.33
277 0.27
278 0.3
279 0.28
280 0.25
281 0.24
282 0.24
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.2
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.15
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.1
304 0.13
305 0.17
306 0.19
307 0.19
308 0.23
309 0.32
310 0.35
311 0.37
312 0.39
313 0.43
314 0.44
315 0.51
316 0.5
317 0.44
318 0.48
319 0.51
320 0.54
321 0.54
322 0.58
323 0.57
324 0.61
325 0.62
326 0.63
327 0.59
328 0.55
329 0.51
330 0.44
331 0.42
332 0.34
333 0.29
334 0.26
335 0.24
336 0.2
337 0.16
338 0.15
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.12
346 0.14
347 0.16
348 0.16
349 0.19
350 0.19
351 0.28
352 0.37
353 0.46
354 0.54
355 0.61
356 0.67
357 0.72
358 0.82
359 0.79
360 0.78