Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G2XEE8

Protein Details
Accession G2XEE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-404RERERARKDKMREEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-244EPPKFKHKKIPRGPPSPPPP
385-402RERARKDKMREEERKLRQ
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG vda:VDAG_08533  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASISAALASALPTPKYAGEDDAPAHAQQRGPRIVGAGHLDQTQVVLRVSHPPPRKTTLVQHADVSPQRTGPPPYGQRTGWRPSGQEDFGDGGAFPEVPVAQYPLSMGQKSATASNALAVQVDAEGKVDYGAIARQGHNDSRIIHALTSRAPAATRVAATTEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNINVGNRADPTFVRYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKATAEDQENWRIPPPISNWKNPKGFTIALDKRLAADGRGMQDVTVNDKFAQFSEALHMADRHAREEVRQRAQMQQRLAEKEKEQKEENLRMLAQQAREERAGAGQRDSRSRSRSRSYSGSDSGSDSEEAEVRERERARKDKMREEERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPKANMDDDEDEAAGDKEMAKIQKASRFGEALGRGTFKGAEEAEGDAISSIQPSQHKVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.19
4 0.19
5 0.2
6 0.2
7 0.23
8 0.23
9 0.26
10 0.26
11 0.24
12 0.24
13 0.22
14 0.24
15 0.24
16 0.32
17 0.32
18 0.31
19 0.32
20 0.31
21 0.29
22 0.3
23 0.31
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.22
28 0.2
29 0.2
30 0.18
31 0.15
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.21
36 0.24
37 0.32
38 0.38
39 0.42
40 0.47
41 0.53
42 0.57
43 0.53
44 0.59
45 0.61
46 0.61
47 0.58
48 0.54
49 0.5
50 0.52
51 0.5
52 0.44
53 0.34
54 0.28
55 0.28
56 0.3
57 0.32
58 0.29
59 0.35
60 0.4
61 0.45
62 0.49
63 0.48
64 0.51
65 0.55
66 0.56
67 0.54
68 0.49
69 0.45
70 0.44
71 0.49
72 0.43
73 0.36
74 0.33
75 0.27
76 0.24
77 0.23
78 0.18
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.14
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.15
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.09
120 0.11
121 0.12
122 0.15
123 0.19
124 0.21
125 0.22
126 0.24
127 0.21
128 0.23
129 0.25
130 0.23
131 0.2
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.19
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.07
165 0.07
166 0.1
167 0.12
168 0.13
169 0.2
170 0.23
171 0.26
172 0.32
173 0.37
174 0.38
175 0.4
176 0.39
177 0.34
178 0.31
179 0.32
180 0.27
181 0.21
182 0.19
183 0.17
184 0.19
185 0.24
186 0.29
187 0.26
188 0.22
189 0.25
190 0.29
191 0.34
192 0.33
193 0.32
194 0.29
195 0.3
196 0.32
197 0.37
198 0.33
199 0.34
200 0.38
201 0.4
202 0.45
203 0.49
204 0.54
205 0.49
206 0.49
207 0.45
208 0.41
209 0.39
210 0.41
211 0.43
212 0.42
213 0.42
214 0.5
215 0.54
216 0.53
217 0.6
218 0.6
219 0.62
220 0.67
221 0.76
222 0.74
223 0.76
224 0.78
225 0.77
226 0.75
227 0.7
228 0.64
229 0.54
230 0.5
231 0.47
232 0.47
233 0.47
234 0.47
235 0.45
236 0.46
237 0.48
238 0.44
239 0.4
240 0.4
241 0.4
242 0.39
243 0.37
244 0.38
245 0.39
246 0.39
247 0.37
248 0.34
249 0.26
250 0.2
251 0.22
252 0.21
253 0.27
254 0.3
255 0.36
256 0.42
257 0.47
258 0.51
259 0.48
260 0.45
261 0.39
262 0.36
263 0.31
264 0.34
265 0.3
266 0.3
267 0.3
268 0.28
269 0.24
270 0.25
271 0.23
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.16
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.12
288 0.13
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.15
303 0.24
304 0.31
305 0.32
306 0.35
307 0.36
308 0.42
309 0.49
310 0.51
311 0.44
312 0.42
313 0.42
314 0.44
315 0.46
316 0.41
317 0.37
318 0.42
319 0.45
320 0.44
321 0.41
322 0.41
323 0.45
324 0.49
325 0.47
326 0.41
327 0.36
328 0.32
329 0.34
330 0.31
331 0.24
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.22
337 0.19
338 0.2
339 0.23
340 0.19
341 0.21
342 0.22
343 0.24
344 0.29
345 0.33
346 0.35
347 0.37
348 0.42
349 0.46
350 0.49
351 0.52
352 0.52
353 0.54
354 0.55
355 0.54
356 0.51
357 0.47
358 0.4
359 0.37
360 0.32
361 0.27
362 0.21
363 0.15
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.12
370 0.19
371 0.21
372 0.26
373 0.34
374 0.41
375 0.47
376 0.55
377 0.61
378 0.65
379 0.72
380 0.76
381 0.77
382 0.78
383 0.8
384 0.8
385 0.84
386 0.77
387 0.72
388 0.67
389 0.62
390 0.62
391 0.62
392 0.6
393 0.55
394 0.56
395 0.57
396 0.54
397 0.51
398 0.43
399 0.35
400 0.35
401 0.39
402 0.4
403 0.39
404 0.38
405 0.41
406 0.43
407 0.44
408 0.36
409 0.29
410 0.26
411 0.21
412 0.21
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.15
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.2
421 0.21
422 0.22
423 0.24
424 0.24
425 0.31
426 0.32
427 0.34
428 0.38
429 0.36
430 0.39
431 0.42
432 0.39
433 0.31
434 0.28
435 0.26
436 0.25
437 0.26
438 0.22
439 0.18
440 0.18
441 0.21
442 0.21
443 0.2
444 0.19
445 0.15
446 0.17
447 0.18
448 0.22
449 0.2
450 0.18
451 0.19
452 0.19
453 0.22
454 0.2
455 0.22
456 0.17
457 0.19
458 0.19
459 0.2
460 0.17
461 0.15
462 0.17
463 0.19
464 0.2
465 0.18
466 0.22
467 0.26
468 0.3
469 0.33
470 0.37
471 0.36
472 0.37
473 0.38
474 0.34
475 0.27
476 0.24
477 0.2
478 0.14
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.13
483 0.15
484 0.17
485 0.22
486 0.27
487 0.33
488 0.37
489 0.38
490 0.38
491 0.38
492 0.37
493 0.39
494 0.37
495 0.35
496 0.32
497 0.31
498 0.27
499 0.27
500 0.27
501 0.2
502 0.21
503 0.18
504 0.17
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.08
514 0.07
515 0.1
516 0.13