Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G2WWX9

Protein Details
Accession G2WWX9    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-260EEAVRKYERSERKKKHKHRHRSHRSRRDHSDEEMRDAERDDRHRRRRSRRDESPSAKDRTKDSRRERQRDDGSPBasic
272-333DRERDARDQSRDRRHRGKEDDRERRERRRHSDDEPRRRTHKDDGDDDRSKRRSRSRSPRPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-333VRKYERSERKKKHKHRHRSHRSRRDHSDEEMRDAERDDRHRRRRSRRDESPSAKDRTKDSRRERQRDDGSPHREPRRERVRDDRERDARDQSRDRRHRGKEDDRERRERRRHSDDEPRRRTHKDDGDDDRSKRRSRSRSPRPRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG vda:VDAG_02758  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNQIKAIQALNKQEIENGISPEASWHVDYRDTAFIYFGGLPYEMSEGDVITIFSQFGEPVWLKLARDKETGKAKGFGWLKYEDQRSTDLAVDNLGGATIGSRMVRVDHARYKFRDDEDPDEGKVDWATMTKRESGGGGDDTEDEEDEEAEQRPMLPEERELALLVRDHDEDDPMKAFLIEEKKKEVEEAVRKYERSERKKKHKHRHRSHRSRRDHSDEEMRDAERDDRHRRRRSRRDESPSAKDRTKDSRRERQRDDGSPHREPRRERVRDDRERDARDQSRDRRHRGKEDDRERRERRRHSDDEPRRRTHKDDGDDDRSKRRSRSRSPRPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.32
4 0.28
5 0.24
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.19
16 0.21
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.21
21 0.18
22 0.19
23 0.19
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.22
51 0.28
52 0.27
53 0.32
54 0.33
55 0.36
56 0.44
57 0.49
58 0.47
59 0.44
60 0.4
61 0.43
62 0.44
63 0.39
64 0.33
65 0.31
66 0.32
67 0.35
68 0.4
69 0.33
70 0.32
71 0.32
72 0.3
73 0.29
74 0.28
75 0.22
76 0.17
77 0.16
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.1
92 0.13
93 0.18
94 0.25
95 0.3
96 0.36
97 0.37
98 0.43
99 0.43
100 0.43
101 0.45
102 0.42
103 0.43
104 0.43
105 0.43
106 0.37
107 0.35
108 0.32
109 0.24
110 0.2
111 0.14
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.17
166 0.19
167 0.2
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.24
172 0.22
173 0.21
174 0.27
175 0.3
176 0.34
177 0.36
178 0.36
179 0.38
180 0.45
181 0.47
182 0.48
183 0.55
184 0.58
185 0.67
186 0.78
187 0.87
188 0.9
189 0.91
190 0.93
191 0.93
192 0.95
193 0.95
194 0.96
195 0.96
196 0.95
197 0.95
198 0.92
199 0.89
200 0.86
201 0.79
202 0.72
203 0.71
204 0.61
205 0.56
206 0.49
207 0.41
208 0.33
209 0.3
210 0.29
211 0.24
212 0.3
213 0.36
214 0.44
215 0.53
216 0.63
217 0.72
218 0.79
219 0.85
220 0.89
221 0.89
222 0.9
223 0.89
224 0.9
225 0.88
226 0.86
227 0.83
228 0.77
229 0.7
230 0.62
231 0.57
232 0.57
233 0.59
234 0.59
235 0.61
236 0.66
237 0.74
238 0.81
239 0.82
240 0.82
241 0.81
242 0.79
243 0.78
244 0.77
245 0.74
246 0.73
247 0.75
248 0.72
249 0.7
250 0.65
251 0.68
252 0.69
253 0.68
254 0.66
255 0.69
256 0.72
257 0.76
258 0.79
259 0.79
260 0.77
261 0.76
262 0.73
263 0.71
264 0.67
265 0.65
266 0.68
267 0.67
268 0.7
269 0.73
270 0.79
271 0.79
272 0.81
273 0.82
274 0.83
275 0.84
276 0.84
277 0.86
278 0.88
279 0.87
280 0.89
281 0.87
282 0.88
283 0.87
284 0.86
285 0.85
286 0.84
287 0.82
288 0.8
289 0.84
290 0.84
291 0.85
292 0.84
293 0.82
294 0.79
295 0.77
296 0.74
297 0.73
298 0.71
299 0.68
300 0.68
301 0.7
302 0.73
303 0.76
304 0.74
305 0.73
306 0.7
307 0.67
308 0.67
309 0.68
310 0.69
311 0.72
312 0.8
313 0.82