Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G2X4D6

Protein Details
Accession G2X4D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-111VSAPAGPPKKKRGRKPKNRNPEGAPDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-105GPPKKKRGRKPKNRN
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG vda:VDAG_05018  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPYAQSPTAISPPYPAHTPLPVSKKRASDGGSQPSLKRRKASTLSVSSATHPLRQTSFPPEARSPLARSPSVDTASHVSGSQVSAPAGPPKKKRGRKPKNRNPEGAPDAGTPTPSLVSGRGGTAGGGADGQNGEDGNDDDDDNDMQMGLVGGETRTQEQKQEEIRLRAMLVECFDEDQMNRYENWRAAKLTDNVVKRVVNATVSQSVPPTVTLAIKSVSKYFIGELIEKAISVQGEWMNATGEKQSEVEFPPQNTDPTVRGDINRLSEKDKRGPLRPEHLREAWRQYKMSGESGWVGTQGLWHEQQSDGVERFPVRTGGKRIFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.31
4 0.29
5 0.29
6 0.27
7 0.29
8 0.34
9 0.37
10 0.44
11 0.47
12 0.51
13 0.54
14 0.55
15 0.54
16 0.55
17 0.51
18 0.51
19 0.53
20 0.56
21 0.56
22 0.54
23 0.55
24 0.58
25 0.63
26 0.57
27 0.54
28 0.49
29 0.53
30 0.56
31 0.62
32 0.62
33 0.61
34 0.61
35 0.58
36 0.55
37 0.48
38 0.48
39 0.41
40 0.36
41 0.3
42 0.29
43 0.29
44 0.3
45 0.31
46 0.31
47 0.38
48 0.37
49 0.41
50 0.4
51 0.41
52 0.43
53 0.43
54 0.4
55 0.38
56 0.4
57 0.35
58 0.35
59 0.36
60 0.37
61 0.37
62 0.32
63 0.28
64 0.27
65 0.27
66 0.25
67 0.2
68 0.15
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.17
77 0.23
78 0.29
79 0.33
80 0.42
81 0.53
82 0.61
83 0.7
84 0.74
85 0.79
86 0.85
87 0.91
88 0.92
89 0.93
90 0.92
91 0.88
92 0.81
93 0.79
94 0.72
95 0.62
96 0.53
97 0.42
98 0.37
99 0.31
100 0.26
101 0.17
102 0.13
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.02
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.13
149 0.18
150 0.19
151 0.26
152 0.29
153 0.29
154 0.3
155 0.27
156 0.26
157 0.23
158 0.21
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.16
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.18
178 0.23
179 0.23
180 0.26
181 0.3
182 0.29
183 0.28
184 0.3
185 0.29
186 0.24
187 0.24
188 0.19
189 0.14
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.15
238 0.21
239 0.23
240 0.23
241 0.28
242 0.29
243 0.28
244 0.27
245 0.27
246 0.22
247 0.24
248 0.28
249 0.24
250 0.24
251 0.27
252 0.29
253 0.33
254 0.37
255 0.33
256 0.34
257 0.39
258 0.44
259 0.48
260 0.53
261 0.53
262 0.55
263 0.62
264 0.64
265 0.69
266 0.72
267 0.71
268 0.7
269 0.7
270 0.67
271 0.64
272 0.67
273 0.64
274 0.59
275 0.54
276 0.47
277 0.48
278 0.47
279 0.45
280 0.35
281 0.3
282 0.28
283 0.28
284 0.27
285 0.2
286 0.17
287 0.13
288 0.15
289 0.14
290 0.16
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.21
296 0.22
297 0.25
298 0.22
299 0.21
300 0.24
301 0.23
302 0.25
303 0.24
304 0.26
305 0.25
306 0.31
307 0.38