Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165JXC6

Protein Details
Accession A0A165JXC6    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-148IAKPAEEKERKPKKKKARATPKRVGEVTBasic
176-201DAKDAPKRKKTARKPKPRRVKSNADABasic
223-246GAEKTPRVKKPRAPPRPRRPAGEDBasic
281-304VVSARVVRRRWPPRRSKGYGFVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-143KPAEEKERKPKKKKARATPKR
180-198APKRKKTARKPKPRRVKSN
214-242KPEATKAEPGAEKTPRVKKPRAPPRPRRP
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 13.333, nucl 9, mito_nucl 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSEPTAPAPQLASTTTDAVPAPADSVKPQESGEAKVNGAAVEEPAGPKVFAGNLSYGTTEESLRGFFKEFEADIVHVNLVHRGPRPAGYAFVTFPALERAQAAVTALNDKELDGRKVAIEIAKPAEEKERKPKKKKARATPKRVGEVTEEEAEGEGAETAPGTEARIDVPDTVAADAKDAPKRKKTARKPKPRRVKSNADAAAPGETDPAEGAKPEATKAEPGAEKTPRVKKPRAPPRPRRPAGEDPVGSLSPNMLFVANLPFTVTDQTLAELFTSANVNVVSARVVRRRWPPRRSKGYGFVDVGDEAAQKKGIEAVNGKEIEGREVAVKVAVNTQLEDAEKEEKEGAAQEGSSPEATVLAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.2
4 0.19
5 0.18
6 0.18
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.18
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.24
17 0.25
18 0.28
19 0.33
20 0.3
21 0.28
22 0.28
23 0.29
24 0.22
25 0.21
26 0.17
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.15
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.2
72 0.23
73 0.21
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.14
98 0.16
99 0.17
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.14
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.23
113 0.25
114 0.28
115 0.37
116 0.46
117 0.55
118 0.64
119 0.74
120 0.76
121 0.83
122 0.89
123 0.89
124 0.89
125 0.9
126 0.91
127 0.9
128 0.86
129 0.81
130 0.72
131 0.62
132 0.54
133 0.47
134 0.4
135 0.32
136 0.25
137 0.18
138 0.18
139 0.16
140 0.12
141 0.08
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.11
165 0.15
166 0.19
167 0.22
168 0.27
169 0.32
170 0.4
171 0.49
172 0.57
173 0.64
174 0.7
175 0.79
176 0.84
177 0.9
178 0.93
179 0.92
180 0.92
181 0.88
182 0.87
183 0.8
184 0.79
185 0.71
186 0.6
187 0.51
188 0.41
189 0.34
190 0.24
191 0.19
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.21
211 0.22
212 0.25
213 0.31
214 0.39
215 0.42
216 0.48
217 0.52
218 0.55
219 0.63
220 0.71
221 0.76
222 0.78
223 0.81
224 0.85
225 0.9
226 0.87
227 0.82
228 0.79
229 0.77
230 0.73
231 0.7
232 0.59
233 0.5
234 0.5
235 0.44
236 0.35
237 0.25
238 0.19
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.15
272 0.18
273 0.21
274 0.27
275 0.37
276 0.48
277 0.57
278 0.65
279 0.72
280 0.77
281 0.86
282 0.87
283 0.84
284 0.84
285 0.81
286 0.78
287 0.68
288 0.58
289 0.49
290 0.41
291 0.34
292 0.24
293 0.18
294 0.12
295 0.11
296 0.12
297 0.09
298 0.1
299 0.14
300 0.15
301 0.18
302 0.21
303 0.23
304 0.3
305 0.3
306 0.3
307 0.28
308 0.28
309 0.26
310 0.23
311 0.2
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.12
318 0.16
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.2
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.19
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.17
340 0.16
341 0.14
342 0.12