FuNGI

A0A165IL18

Protein Details

Accession

A0A165IL18

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-44	PMELKPLGRRPQQPVRPPPPRPPPNRSGQSKA	Hydrophilic
98-122	PMDWIRPVKLNRKELKKNYKAVEKE	Hydrophilic
161-190	KDIGKGKDKDAPKRKFKRTKTRQVFRVSDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-35	PVRPPPPRPP
156-181	GRPRPKDIGKGKDKDAPKRKFKRTKT
349-352	RRRE

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAARLKAEFKNEPMELKPLGRRPQQPVRPPPPRPPPNRSGQSKAFVHSDVKPKVESKPLPEDPPGTYTDFVITSSGISEWRHDMMRFKPTNVNQVVNPMDWIRPVKLNRKELKKNYKAVEKEQPAKPLLGLDGKPVIGPDGKIVMVGGPDGLLPNGRPRPKDIGKGKDKDAPKRKFKRTKTRQVFRVSDEVRQVRREERHPWVMQSGDGTQVWEGRLEDRGPQLQVLLFQSQKEGFVAVPLNKWYTFKEPPKHTILTLDQAEQFEKDMAKNSDIQRWMMRKTGGKVSEATQLTLKRESSAEPARPRTTSDGSILSRSGTRMLQVRTGNTADYGDNGDDDEGAEGAGSRRRRERERGGGGDGDYDEFEYEEEFQDDDEGAVLPDDEEEDEETKELKEKEARMMRAANAVNDENRMDNDNQEEEDDDDEDELNDAGKAMKKALRLWEKGAYADEDDDDNKNPYLSSEEEEEEEEGTASGTSTPLPTGVLPQASTPAKSGTPRPSGSGSKPGSRSISRAGSPVGGRSSNGISGASVLAHRATSPPPGTSRLPAVGGVAPRALSPLAAEAGGRRASSPTRTTPATGSLKRKAPDDVASPPGGRGSSPGAVTAASPGSSTTPNKRPRTLPKVTVPASLVFEKAIPPGPIIAFLRMKPRTTGDCVKNFKDWFKEDARNKNVLSFWIKQIAKLDNSSGESVLKLHDDAKLAQMGIEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.37
3	0.38
4	0.42
5	0.42
6	0.5
7	0.54
8	0.59
9	0.64
10	0.72
11	0.76
12	0.79
13	0.81
14	0.83
15	0.85
16	0.84
17	0.85
18	0.86
19	0.86
20	0.85
21	0.83
22	0.8
23	0.8
24	0.83
25	0.8
26	0.77
27	0.74
28	0.74
29	0.68
30	0.64
31	0.56
32	0.49
33	0.46
34	0.44
35	0.47
36	0.43
37	0.43
38	0.42
39	0.41
40	0.44
41	0.5
42	0.48
43	0.45
44	0.51
45	0.54
46	0.55
47	0.57
48	0.54
49	0.47
50	0.45
51	0.41
52	0.34
53	0.29
54	0.25
55	0.23
56	0.2
57	0.18
58	0.15
59	0.13
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.11
65	0.13
66	0.15
67	0.17
68	0.2
69	0.2
70	0.25
71	0.28
72	0.38
73	0.38
74	0.39
75	0.45
76	0.46
77	0.55
78	0.54
79	0.51
80	0.41
81	0.46
82	0.45
83	0.36
84	0.34
85	0.26
86	0.23
87	0.23
88	0.25
89	0.21
90	0.26
91	0.31
92	0.39
93	0.47
94	0.56
95	0.62
96	0.69
97	0.77
98	0.81
99	0.86
100	0.85
101	0.84
102	0.81
103	0.82
104	0.77
105	0.74
106	0.73
107	0.71
108	0.7
109	0.66
110	0.64
111	0.57
112	0.52
113	0.45
114	0.36
115	0.31
116	0.28
117	0.24
118	0.21
119	0.22
120	0.21
121	0.21
122	0.19
123	0.18
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.14
142	0.21
143	0.25
144	0.27
145	0.31
146	0.41
147	0.45
148	0.55
149	0.56
150	0.59
151	0.65
152	0.69
153	0.67
154	0.65
155	0.66
156	0.67
157	0.69
158	0.68
159	0.69
160	0.74
161	0.82
162	0.85
163	0.89
164	0.9
165	0.91
166	0.92
167	0.93
168	0.92
169	0.89
170	0.88
171	0.82
172	0.75
173	0.74
174	0.64
175	0.57
176	0.55
177	0.53
178	0.47
179	0.45
180	0.44
181	0.41
182	0.45
183	0.45
184	0.44
185	0.46
186	0.52
187	0.5
188	0.5
189	0.46
190	0.41
191	0.36
192	0.31
193	0.24
194	0.18
195	0.16
196	0.15
197	0.12
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.12
204	0.12
205	0.14
206	0.16
207	0.18
208	0.18
209	0.17
210	0.17
211	0.15
212	0.16
213	0.16
214	0.16
215	0.14
216	0.14
217	0.16
218	0.15
219	0.15
220	0.13
221	0.12
222	0.08
223	0.1
224	0.13
225	0.12
226	0.13
227	0.14
228	0.16
229	0.16
230	0.17
231	0.18
232	0.21
233	0.29
234	0.35
235	0.43
236	0.46
237	0.51
238	0.56
239	0.54
240	0.48
241	0.45
242	0.39
243	0.36
244	0.32
245	0.29
246	0.24
247	0.24
248	0.24
249	0.19
250	0.17
251	0.12
252	0.12
253	0.1
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.21
258	0.23
259	0.27
260	0.28
261	0.29
262	0.29
263	0.31
264	0.31
265	0.29
266	0.3
267	0.28
268	0.3
269	0.36
270	0.32
271	0.3
272	0.3
273	0.28
274	0.33
275	0.29
276	0.27
277	0.23
278	0.23
279	0.24
280	0.25
281	0.23
282	0.17
283	0.17
284	0.17
285	0.21
286	0.25
287	0.29
288	0.31
289	0.36
290	0.37
291	0.37
292	0.37
293	0.36
294	0.33
295	0.29
296	0.26
297	0.25
298	0.24
299	0.25
300	0.23
301	0.19
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.1
306	0.1
307	0.14
308	0.15
309	0.2
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.23
314	0.21
315	0.17
316	0.17
317	0.11
318	0.1
319	0.11
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.08
333	0.09
334	0.11
335	0.16
336	0.21
337	0.26
338	0.34
339	0.41
340	0.48
341	0.53
342	0.54
343	0.51
344	0.48
345	0.43
346	0.36
347	0.28
348	0.18
349	0.11
350	0.08
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.1
380	0.1
381	0.12
382	0.15
383	0.17
384	0.25
385	0.3
386	0.31
387	0.3
388	0.32
389	0.3
390	0.32
391	0.31
392	0.24
393	0.2
394	0.2
395	0.18
396	0.17
397	0.16
398	0.11
399	0.11
400	0.13
401	0.11
402	0.11
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.12
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.08
422	0.08
423	0.1
424	0.13
425	0.14
426	0.18
427	0.26
428	0.33
429	0.33
430	0.36
431	0.39
432	0.37
433	0.36
434	0.35
435	0.27
436	0.2
437	0.18
438	0.15
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.12
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.14
453	0.15
454	0.16
455	0.16
456	0.13
457	0.12
458	0.1
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.08
472	0.1
473	0.11
474	0.1
475	0.11
476	0.16
477	0.16
478	0.17
479	0.15
480	0.15
481	0.16
482	0.18
483	0.24
484	0.26
485	0.32
486	0.32
487	0.34
488	0.37
489	0.4
490	0.41
491	0.45
492	0.4
493	0.4
494	0.41
495	0.41
496	0.42
497	0.38
498	0.38
499	0.35
500	0.37
501	0.31
502	0.31
503	0.29
504	0.27
505	0.26
506	0.26
507	0.23
508	0.18
509	0.17
510	0.18
511	0.18
512	0.16
513	0.16
514	0.13
515	0.1
516	0.1
517	0.11
518	0.09
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.09
526	0.15
527	0.16
528	0.18
529	0.2
530	0.25
531	0.27
532	0.27
533	0.29
534	0.25
535	0.25
536	0.22
537	0.22
538	0.2
539	0.19
540	0.17
541	0.14
542	0.13
543	0.12
544	0.13
545	0.1
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.12
554	0.13
555	0.13
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.22
560	0.26
561	0.28
562	0.31
563	0.33
564	0.34
565	0.33
566	0.39
567	0.43
568	0.45
569	0.46
570	0.49
571	0.54
572	0.53
573	0.54
574	0.49
575	0.44
576	0.42
577	0.39
578	0.38
579	0.36
580	0.36
581	0.35
582	0.31
583	0.29
584	0.24
585	0.19
586	0.16
587	0.17
588	0.17
589	0.17
590	0.17
591	0.16
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.12
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.11
600	0.15
601	0.19
602	0.26
603	0.34
604	0.44
605	0.5
606	0.55
607	0.62
608	0.68
609	0.74
610	0.74
611	0.73
612	0.72
613	0.76
614	0.72
615	0.68
616	0.59
617	0.52
618	0.47
619	0.4
620	0.32
621	0.22
622	0.21
623	0.18
624	0.18
625	0.2
626	0.16
627	0.15
628	0.18
629	0.17
630	0.21
631	0.22
632	0.25
633	0.24
634	0.25
635	0.34
636	0.35
637	0.37
638	0.35
639	0.39
640	0.39
641	0.44
642	0.52
643	0.51
644	0.57
645	0.63
646	0.63
647	0.65
648	0.63
649	0.61
650	0.59
651	0.54
652	0.51
653	0.52
654	0.58
655	0.59
656	0.67
657	0.67
658	0.65
659	0.62
660	0.61
661	0.54
662	0.51
663	0.48
664	0.42
665	0.4
666	0.44
667	0.43
668	0.4
669	0.44
670	0.45
671	0.42
672	0.41
673	0.39
674	0.34
675	0.38
676	0.37
677	0.32
678	0.26
679	0.22
680	0.21
681	0.19
682	0.16
683	0.14
684	0.14
685	0.16
686	0.19
687	0.19
688	0.23
689	0.24
690	0.22

A0A165IL18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer