Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165GHD9

Protein Details
Accession A0A165GHD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-46TDGDRKPELQGPPRKRRRELPQSLQDLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-35PRKRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PF00098  zf-CCHC  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MQHLHQIQLQIQLQQQQQTDGDRKPELQGPPRKRRRELPQSLQDLVKPDFHQVTLNVERDIKDVIGVKLDKDEQICRLNLTPAGCPLGPLHCPLRHTMPSKLNFQPSTGASRGADGDPRFRTTVCKHWLRGLCKKGDSCEFLHEYNLRRMPECWWYAKYGYCSAGDECLYTHPKERRSACPDYQRGFCKLGPGCPRKHARRVACPLYLSGFCPRGSECTNAHPKWTLPTKEDYEPEQGARELGPPPPGFGRFGAGEGFPSGGGGGYGRGDGGAAGGANFERRNLDEVTCFKCGEKGHYANMCRNRNVPGNRGGLERGSGGKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.32
4 0.33
5 0.36
6 0.39
7 0.36
8 0.39
9 0.36
10 0.37
11 0.37
12 0.42
13 0.42
14 0.46
15 0.53
16 0.58
17 0.67
18 0.76
19 0.81
20 0.8
21 0.82
22 0.83
23 0.84
24 0.84
25 0.84
26 0.83
27 0.8
28 0.77
29 0.69
30 0.6
31 0.54
32 0.45
33 0.39
34 0.3
35 0.29
36 0.27
37 0.26
38 0.26
39 0.22
40 0.29
41 0.3
42 0.31
43 0.28
44 0.28
45 0.28
46 0.27
47 0.27
48 0.19
49 0.15
50 0.17
51 0.16
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.21
56 0.22
57 0.22
58 0.21
59 0.23
60 0.21
61 0.25
62 0.25
63 0.24
64 0.25
65 0.24
66 0.25
67 0.24
68 0.21
69 0.18
70 0.21
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.18
77 0.21
78 0.2
79 0.21
80 0.23
81 0.29
82 0.32
83 0.35
84 0.39
85 0.42
86 0.44
87 0.49
88 0.51
89 0.51
90 0.45
91 0.42
92 0.38
93 0.32
94 0.34
95 0.28
96 0.26
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.17
101 0.2
102 0.15
103 0.2
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.21
108 0.26
109 0.25
110 0.33
111 0.35
112 0.38
113 0.37
114 0.44
115 0.51
116 0.52
117 0.57
118 0.54
119 0.51
120 0.5
121 0.5
122 0.45
123 0.43
124 0.39
125 0.32
126 0.3
127 0.29
128 0.25
129 0.27
130 0.26
131 0.25
132 0.28
133 0.3
134 0.26
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.28
139 0.27
140 0.25
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.25
145 0.25
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.17
150 0.15
151 0.16
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.18
159 0.21
160 0.25
161 0.32
162 0.35
163 0.4
164 0.45
165 0.52
166 0.52
167 0.57
168 0.59
169 0.56
170 0.57
171 0.52
172 0.48
173 0.44
174 0.38
175 0.36
176 0.3
177 0.34
178 0.39
179 0.41
180 0.4
181 0.45
182 0.53
183 0.52
184 0.6
185 0.62
186 0.59
187 0.64
188 0.7
189 0.68
190 0.62
191 0.56
192 0.48
193 0.43
194 0.37
195 0.28
196 0.24
197 0.21
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.21
205 0.27
206 0.37
207 0.36
208 0.37
209 0.34
210 0.33
211 0.36
212 0.43
213 0.37
214 0.3
215 0.37
216 0.39
217 0.42
218 0.43
219 0.4
220 0.37
221 0.35
222 0.33
223 0.28
224 0.24
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.13
229 0.14
230 0.19
231 0.17
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.22
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.12
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.23
273 0.27
274 0.32
275 0.32
276 0.31
277 0.28
278 0.3
279 0.3
280 0.31
281 0.36
282 0.34
283 0.4
284 0.47
285 0.52
286 0.56
287 0.64
288 0.64
289 0.58
290 0.56
291 0.54
292 0.56
293 0.57
294 0.55
295 0.53
296 0.53
297 0.51
298 0.51
299 0.47
300 0.39
301 0.35
302 0.31
303 0.26