Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A165CIP1

Protein Details
Accession A0A165CIP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-98ASTSVGSSPKTPRKKRKKDDPDTPQVEKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-8RKR
78-87PKTPRKKRKK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 10, mito 7, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MAAGKRKRRPSPSESESESAEEEEGDILLRATNAAAAVARSFVRPRPGEAQPSTSTAAFSFASPARAGRASTSVGSSPKTPRKKRKKDDPDTPQVEKRLARIRKSCPQNVLDRVDRVLTQRFYLVDRERDGDELRETFKVLGSTGNIYTVTVDKVPACNCPDALKGNHCKHILFVMLKVLNVSQYSTYYYQKALLSTELAEIFNNAPSAPSVLAAERVRAAYASASASSTSTAAAPPAAASKRLPEEGDDCPICYESLPPGAEDGLVFCKSCGNGLHRGCFVQWAKTPNGRSCVTCRAAWPHEGAVNGIGVGVGGEGEGDDQAGVNAEGYINVAGPAGISPVRDTSTCAYFRLWRLMLAGVRGVLTRELL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.67
3 0.6
4 0.53
5 0.45
6 0.35
7 0.28
8 0.19
9 0.14
10 0.12
11 0.1
12 0.08
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.14
29 0.17
30 0.25
31 0.26
32 0.31
33 0.35
34 0.41
35 0.47
36 0.47
37 0.5
38 0.44
39 0.46
40 0.43
41 0.37
42 0.32
43 0.23
44 0.23
45 0.17
46 0.15
47 0.16
48 0.14
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.29
65 0.36
66 0.46
67 0.54
68 0.63
69 0.72
70 0.82
71 0.89
72 0.92
73 0.94
74 0.93
75 0.94
76 0.93
77 0.92
78 0.88
79 0.83
80 0.76
81 0.67
82 0.62
83 0.52
84 0.48
85 0.47
86 0.45
87 0.48
88 0.5
89 0.55
90 0.6
91 0.67
92 0.67
93 0.64
94 0.62
95 0.62
96 0.61
97 0.59
98 0.53
99 0.46
100 0.42
101 0.36
102 0.33
103 0.28
104 0.28
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.2
110 0.25
111 0.26
112 0.24
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.27
117 0.26
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.2
151 0.23
152 0.3
153 0.32
154 0.38
155 0.37
156 0.35
157 0.32
158 0.32
159 0.28
160 0.2
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.06
171 0.06
172 0.09
173 0.11
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.14
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.16
233 0.19
234 0.2
235 0.26
236 0.22
237 0.2
238 0.19
239 0.2
240 0.18
241 0.14
242 0.13
243 0.09
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.24
262 0.27
263 0.31
264 0.3
265 0.31
266 0.29
267 0.34
268 0.31
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.34
273 0.39
274 0.44
275 0.41
276 0.45
277 0.41
278 0.4
279 0.41
280 0.45
281 0.43
282 0.39
283 0.37
284 0.39
285 0.41
286 0.4
287 0.37
288 0.31
289 0.3
290 0.29
291 0.26
292 0.19
293 0.16
294 0.13
295 0.11
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.03
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.17
332 0.19
333 0.25
334 0.26
335 0.27
336 0.28
337 0.32
338 0.35
339 0.41
340 0.37
341 0.32
342 0.32
343 0.36
344 0.34
345 0.31
346 0.28
347 0.2
348 0.2
349 0.19
350 0.19