Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168CH27

Protein Details
Accession A0A168CH27    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-106SSSSPAGKRISKRRRARGLLSRFRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-34R
88-99GKRISKRRRARG
Subcellular Location(s) plas 24, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MATSDAASDKEPFPLLNTSLDPFAMEEDSPPRRRRKSSGLGGEIRAGDTGAPAFASSRASLSAGDSFSNHTDPSSPVTAVSSSSSPAGKRISKRRRARGLLSRFRQLMVRRTFVLPAVLLVLFLAGYAVNPTESNVLHHFIFLSYPLPQDDPSKPVMYGKGKWDIAFVAFYIIVLSFTREFIMQELLRPWARRTGLSRAKQARFMEQAYTAVYFAFLGPAGLYVMSRTPVWYYNTTGMYEAFPHRAHEAVVKFYYLFQAAYWAQQAIVLVLGLEKPRKDYYELVGHHVVSLALIGLSYRFHFTYIGIAVYTSHDISDFFLATSKVLNYLDHFLIGPYFFVFVCVWVYLRHYINLKIIVSMFTEFRTVGPFELNWETEQYKCWISQYITTALLTSLQALNLFWLFYILRIAYRFVRDSSATDDRSDDEEDETTTTKQSVPILKINGEKPNGKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.23
8 0.2
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.12
13 0.13
14 0.19
15 0.27
16 0.34
17 0.41
18 0.49
19 0.55
20 0.62
21 0.67
22 0.71
23 0.73
24 0.76
25 0.8
26 0.79
27 0.76
28 0.71
29 0.67
30 0.57
31 0.47
32 0.36
33 0.26
34 0.17
35 0.12
36 0.11
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.1
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.17
54 0.18
55 0.2
56 0.17
57 0.14
58 0.15
59 0.16
60 0.2
61 0.2
62 0.18
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.18
68 0.14
69 0.12
70 0.14
71 0.16
72 0.14
73 0.18
74 0.23
75 0.27
76 0.35
77 0.45
78 0.54
79 0.63
80 0.73
81 0.8
82 0.84
83 0.85
84 0.85
85 0.85
86 0.85
87 0.85
88 0.79
89 0.76
90 0.66
91 0.59
92 0.56
93 0.5
94 0.48
95 0.44
96 0.42
97 0.38
98 0.39
99 0.39
100 0.34
101 0.31
102 0.21
103 0.15
104 0.14
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.02
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.11
122 0.12
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.26
144 0.26
145 0.28
146 0.29
147 0.34
148 0.33
149 0.33
150 0.32
151 0.26
152 0.22
153 0.19
154 0.15
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.12
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.21
180 0.25
181 0.32
182 0.39
183 0.43
184 0.51
185 0.53
186 0.54
187 0.57
188 0.54
189 0.49
190 0.43
191 0.39
192 0.32
193 0.24
194 0.23
195 0.18
196 0.17
197 0.13
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.09
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.11
243 0.1
244 0.06
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.11
263 0.12
264 0.14
265 0.17
266 0.18
267 0.22
268 0.29
269 0.3
270 0.32
271 0.32
272 0.3
273 0.28
274 0.25
275 0.21
276 0.11
277 0.1
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.12
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.1
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.13
334 0.15
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.22
339 0.25
340 0.29
341 0.26
342 0.23
343 0.22
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.15
348 0.12
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.14
356 0.13
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.18
361 0.21
362 0.21
363 0.2
364 0.22
365 0.21
366 0.19
367 0.18
368 0.19
369 0.21
370 0.22
371 0.26
372 0.28
373 0.29
374 0.29
375 0.28
376 0.27
377 0.21
378 0.21
379 0.16
380 0.14
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.12
393 0.1
394 0.13
395 0.14
396 0.17
397 0.19
398 0.24
399 0.26
400 0.24
401 0.28
402 0.27
403 0.29
404 0.34
405 0.38
406 0.35
407 0.33
408 0.33
409 0.31
410 0.33
411 0.33
412 0.26
413 0.21
414 0.2
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.16
422 0.18
423 0.23
424 0.28
425 0.31
426 0.37
427 0.4
428 0.44
429 0.49
430 0.52
431 0.54
432 0.52
433 0.52