Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168EJE4

Protein Details
Accession A0A168EJE4    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAPELRKRKQAPEPAKPAPKVHydrophilic
59-78APKPAPKKTTKAKEETPKTNHydrophilic
348-370EEPKAKPTKATKAKGGKAKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-84RKRKQAPEPAKPAPKVEKPAPKVEKPAGKGKRKAAEQASPASAKKSKPAKEAPAPKPAPKKTTKAKEETPKTNGKKKPA
249-291RRFKKVPWTSMAGRKLEKPRSESAWGLKVERETKKRADKAAKL
350-370PKAKPTKATKAKGGKAKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRKQAPEPAKPAPKVEKPAPKVEKPAGKGKRKAAEQASPASAKKSKPAKEAPAPKPAPKKTTKAKEETPKTNGKKKPAAPVEEPAEEPADGEEEDEEENNDALVLATELDSGDDEADGVTLFEEGQDVGTIPSVSKAVREGVTSEAASGERGVVYVGRIPHGFYEHEMRQYFSQFGPISRLRLSRNKKTGASKHFAFVEFTERSTAEVVAKTMDNYLLFGHILKCQVVPPARVHEALFKGANRRFKKVPWTSMAGRKLEKPRSESAWGLKVERETKKRADKAAKLKALGYEFEGPEIKAVPAPGAPAAEENAATENGDAVETKEAIEAAPVEEPKVEELKVEEPKAKPTKATKAKGGKAKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.85
3 0.78
4 0.76
5 0.74
6 0.71
7 0.68
8 0.68
9 0.69
10 0.65
11 0.73
12 0.74
13 0.7
14 0.7
15 0.71
16 0.7
17 0.64
18 0.69
19 0.69
20 0.7
21 0.73
22 0.74
23 0.74
24 0.7
25 0.74
26 0.7
27 0.68
28 0.63
29 0.61
30 0.58
31 0.53
32 0.49
33 0.46
34 0.43
35 0.36
36 0.41
37 0.44
38 0.45
39 0.51
40 0.58
41 0.62
42 0.67
43 0.77
44 0.74
45 0.75
46 0.73
47 0.72
48 0.74
49 0.7
50 0.69
51 0.64
52 0.68
53 0.67
54 0.74
55 0.75
56 0.72
57 0.76
58 0.78
59 0.8
60 0.8
61 0.76
62 0.76
63 0.74
64 0.76
65 0.73
66 0.7
67 0.71
68 0.67
69 0.71
70 0.68
71 0.68
72 0.62
73 0.63
74 0.6
75 0.52
76 0.48
77 0.39
78 0.32
79 0.25
80 0.21
81 0.15
82 0.11
83 0.09
84 0.09
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.16
158 0.16
159 0.21
160 0.21
161 0.21
162 0.2
163 0.21
164 0.21
165 0.15
166 0.19
167 0.14
168 0.14
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.23
174 0.22
175 0.31
176 0.37
177 0.41
178 0.46
179 0.48
180 0.51
181 0.56
182 0.61
183 0.59
184 0.58
185 0.49
186 0.45
187 0.43
188 0.39
189 0.32
190 0.24
191 0.23
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.24
224 0.25
225 0.26
226 0.26
227 0.26
228 0.25
229 0.26
230 0.25
231 0.21
232 0.26
233 0.29
234 0.38
235 0.36
236 0.4
237 0.4
238 0.42
239 0.51
240 0.51
241 0.54
242 0.5
243 0.53
244 0.53
245 0.59
246 0.61
247 0.54
248 0.48
249 0.48
250 0.52
251 0.54
252 0.53
253 0.5
254 0.49
255 0.5
256 0.53
257 0.49
258 0.45
259 0.44
260 0.41
261 0.37
262 0.34
263 0.33
264 0.37
265 0.42
266 0.42
267 0.41
268 0.48
269 0.57
270 0.6
271 0.65
272 0.66
273 0.68
274 0.73
275 0.77
276 0.74
277 0.65
278 0.61
279 0.57
280 0.49
281 0.41
282 0.34
283 0.3
284 0.25
285 0.26
286 0.25
287 0.2
288 0.19
289 0.2
290 0.16
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.14
327 0.16
328 0.18
329 0.16
330 0.13
331 0.16
332 0.23
333 0.29
334 0.32
335 0.36
336 0.35
337 0.45
338 0.52
339 0.5
340 0.5
341 0.51
342 0.59
343 0.64
344 0.69
345 0.69
346 0.71
347 0.78
348 0.81
349 0.82
350 0.81