Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162LJU4

Protein Details
Accession A0A162LJU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-218LFPPAKKAPRTPKKVSGKRADAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-215AKKAPRTPKKVSGKR
255-269RPAGKRSKSGTPKAK
Subcellular Location(s) extr 16, plas 6, E.R. 2, cyto 1, pero 1, vacu 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005595  TRAP_alpha  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03896  TRAP_alpha  
Amino Acid Sequences MLFTSSLLALLAVPVFGAAAKDPEPAAAEPPAALKATVTATFPDAEELLGLRLVNGRPTRAVLEVTNRDDVPIQVAFVSGALSSDKLALADGPAYQAIVRNLTASQLDLAVAAGQSAQVPYAFALDMQPQDVRVVLTALVTDARGGIFPVTAYNGTASIVEAPTSFLDPQIIFLYLVLSAAFAGVLYFVYKTWIEALFPPAKKAPRTPKKVSGKRADADAAAAALSGSESATSATATGSSKGYDESWIPDHHIARPAGKRSKSGTPKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.05
6 0.08
7 0.08
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.15
19 0.13
20 0.12
21 0.09
22 0.1
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.06
39 0.1
40 0.1
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.21
46 0.22
47 0.2
48 0.22
49 0.17
50 0.24
51 0.29
52 0.31
53 0.32
54 0.3
55 0.29
56 0.27
57 0.25
58 0.2
59 0.14
60 0.12
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.18
184 0.23
185 0.23
186 0.25
187 0.28
188 0.32
189 0.34
190 0.41
191 0.47
192 0.5
193 0.58
194 0.63
195 0.69
196 0.76
197 0.82
198 0.83
199 0.82
200 0.8
201 0.73
202 0.69
203 0.6
204 0.49
205 0.41
206 0.32
207 0.22
208 0.14
209 0.11
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.17
233 0.2
234 0.21
235 0.25
236 0.29
237 0.3
238 0.31
239 0.37
240 0.34
241 0.38
242 0.44
243 0.49
244 0.53
245 0.55
246 0.56
247 0.54
248 0.63
249 0.65