Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162J7S0

Protein Details
Accession A0A162J7S0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-82SDRAASFKRKAPPSRFRRPLPPLPDHydrophilic
111-131AEAVKKRRRVSKSPEPERPPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-75KRKAPPSRFRR
99-99K
104-131GSKKQPDAEAVKKRRRVSKSPEPERPPV
189-196SPQKRKKG
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSRRLGLTANAPGLLKTVGNRPRKTPTEPIDDDAPPLSTDDEDEDAFSEGTVQAASASDRAASFKRKAPPSRFRRPLPPLPDRDIDTSSDERARRAAIKPTTFGSKKQPDAEAVKKRRRVSKSPEPERPPVEERLKPGSHLMDKYGFIGKRPARSTYGKSRSSQSSQPGSSQGSSKGAKTLRVRSPIESPQKRKKGSKFIVPDKNFQSSPCGSPKKLLTKLHGDSESEGDDSILSFLKSTKATQKGKNGKTKTPGSSPPPPRAVFKLPENFLDRSPGREPRPATDGADDLSKLSSDEEEEAPAADEEGGDRPRLKIPATIPDSSPLSPPPPASAQCPWCGDEVERALLDDFAQGRRLDVRRQRRFCALHKRAAALHTWRDRGYPEIAWDALEPRFAAHAAHLQAVLDGARPSPYHDAYAASRRRTARGEEDNLNPGYYGPRGLVAMGDYLVAEFGDALKRRAVGDGGVIAGKGAAAFVQAVLVAELGVRLIMEDLGVDEEEARRVLEESKALGELVQPEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.14
4 0.22
5 0.29
6 0.39
7 0.42
8 0.46
9 0.55
10 0.6
11 0.64
12 0.65
13 0.64
14 0.64
15 0.65
16 0.63
17 0.59
18 0.54
19 0.49
20 0.4
21 0.33
22 0.23
23 0.21
24 0.18
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.12
48 0.16
49 0.21
50 0.25
51 0.31
52 0.4
53 0.48
54 0.57
55 0.65
56 0.71
57 0.74
58 0.82
59 0.84
60 0.8
61 0.82
62 0.81
63 0.8
64 0.79
65 0.79
66 0.75
67 0.72
68 0.7
69 0.63
70 0.59
71 0.51
72 0.44
73 0.4
74 0.35
75 0.32
76 0.34
77 0.31
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.27
82 0.29
83 0.35
84 0.37
85 0.4
86 0.41
87 0.42
88 0.48
89 0.45
90 0.45
91 0.46
92 0.46
93 0.48
94 0.5
95 0.5
96 0.46
97 0.52
98 0.58
99 0.59
100 0.6
101 0.64
102 0.67
103 0.71
104 0.74
105 0.74
106 0.74
107 0.73
108 0.74
109 0.76
110 0.79
111 0.83
112 0.8
113 0.79
114 0.74
115 0.7
116 0.63
117 0.6
118 0.58
119 0.51
120 0.49
121 0.5
122 0.47
123 0.42
124 0.41
125 0.39
126 0.36
127 0.34
128 0.33
129 0.28
130 0.28
131 0.29
132 0.32
133 0.26
134 0.22
135 0.3
136 0.3
137 0.35
138 0.37
139 0.38
140 0.37
141 0.42
142 0.48
143 0.5
144 0.56
145 0.52
146 0.52
147 0.54
148 0.55
149 0.54
150 0.52
151 0.49
152 0.47
153 0.43
154 0.43
155 0.41
156 0.37
157 0.34
158 0.3
159 0.25
160 0.23
161 0.23
162 0.21
163 0.24
164 0.23
165 0.29
166 0.32
167 0.39
168 0.4
169 0.46
170 0.48
171 0.44
172 0.49
173 0.52
174 0.57
175 0.57
176 0.59
177 0.62
178 0.69
179 0.72
180 0.74
181 0.73
182 0.74
183 0.7
184 0.72
185 0.7
186 0.71
187 0.76
188 0.71
189 0.69
190 0.61
191 0.6
192 0.51
193 0.42
194 0.38
195 0.29
196 0.3
197 0.33
198 0.34
199 0.3
200 0.33
201 0.39
202 0.42
203 0.47
204 0.47
205 0.42
206 0.46
207 0.48
208 0.49
209 0.45
210 0.37
211 0.31
212 0.28
213 0.25
214 0.17
215 0.14
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.17
228 0.25
229 0.31
230 0.36
231 0.46
232 0.53
233 0.6
234 0.68
235 0.65
236 0.61
237 0.62
238 0.63
239 0.56
240 0.51
241 0.49
242 0.46
243 0.52
244 0.51
245 0.5
246 0.5
247 0.47
248 0.44
249 0.43
250 0.41
251 0.35
252 0.36
253 0.36
254 0.32
255 0.35
256 0.37
257 0.33
258 0.29
259 0.32
260 0.26
261 0.24
262 0.27
263 0.3
264 0.28
265 0.32
266 0.33
267 0.3
268 0.34
269 0.3
270 0.28
271 0.23
272 0.21
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.1
277 0.09
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.05
292 0.04
293 0.05
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.18
304 0.26
305 0.31
306 0.31
307 0.28
308 0.3
309 0.31
310 0.28
311 0.27
312 0.19
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.18
319 0.21
320 0.25
321 0.26
322 0.28
323 0.3
324 0.28
325 0.26
326 0.25
327 0.22
328 0.21
329 0.2
330 0.18
331 0.16
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.18
343 0.2
344 0.26
345 0.34
346 0.45
347 0.53
348 0.58
349 0.61
350 0.64
351 0.67
352 0.68
353 0.7
354 0.66
355 0.63
356 0.6
357 0.59
358 0.52
359 0.48
360 0.44
361 0.38
362 0.4
363 0.37
364 0.38
365 0.36
366 0.35
367 0.34
368 0.33
369 0.31
370 0.24
371 0.2
372 0.2
373 0.2
374 0.19
375 0.19
376 0.18
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.09
397 0.09
398 0.12
399 0.17
400 0.18
401 0.19
402 0.19
403 0.22
404 0.24
405 0.34
406 0.36
407 0.34
408 0.39
409 0.39
410 0.42
411 0.43
412 0.45
413 0.44
414 0.47
415 0.51
416 0.5
417 0.52
418 0.53
419 0.5
420 0.45
421 0.35
422 0.26
423 0.23
424 0.18
425 0.15
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.11
443 0.13
444 0.14
445 0.16
446 0.17
447 0.18
448 0.2
449 0.2
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.14
455 0.13
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.06
460 0.05
461 0.03
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.11
492 0.13
493 0.16
494 0.17
495 0.18
496 0.2
497 0.2
498 0.2
499 0.19
500 0.19