Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A168DCX2

Protein Details
Accession A0A168DCX2    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSDQRRDRRPNTRRDWDAPDRRDBasic
127-152RGGGRDRRRRSPSRSRSPPRGPRGRPBasic
217-236GAVRKEKKTEYRQYMNRLGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-100DRRDDGPRGGGGGGGRRSNYRSRSRDRGGRADDRSRSPDRRNNYREHGERDADGRGGRGRGGRGGRGGGGGRGGGGGDGRR
126-151RRGGGRDRRRRSPSRSRSPPRGPRGR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDQRRDRRPNTRRDWDAPDRRDDGPRGGGGGGGRRSNYRSRSRDRGGRADDRSRSPDRRNNYREHGERDADGRGGRGRGGRGGRGGGGGRGGGGGDGRRDGDYRSRRNDDYRRRDYDNDDDGYNRRGGGRDRRRRSPSRSRSPPRGPRGRPDENDDGDRMDRDPTPPPAKSKKTVPVTAGEDGEDDDDEMAAMQAMMGFGGFGTTKDKRVAGNNVGAVRKEKKTEYRQYMNRLGGFNRALSPTRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.81
4 0.82
5 0.76
6 0.73
7 0.66
8 0.61
9 0.61
10 0.54
11 0.48
12 0.42
13 0.38
14 0.33
15 0.29
16 0.27
17 0.23
18 0.26
19 0.25
20 0.22
21 0.23
22 0.24
23 0.28
24 0.34
25 0.41
26 0.44
27 0.49
28 0.55
29 0.64
30 0.69
31 0.73
32 0.73
33 0.74
34 0.72
35 0.72
36 0.71
37 0.69
38 0.66
39 0.63
40 0.63
41 0.6
42 0.6
43 0.6
44 0.6
45 0.6
46 0.66
47 0.66
48 0.67
49 0.67
50 0.7
51 0.68
52 0.67
53 0.64
54 0.55
55 0.51
56 0.46
57 0.39
58 0.31
59 0.25
60 0.2
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.2
70 0.21
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.13
75 0.11
76 0.09
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.17
90 0.25
91 0.31
92 0.38
93 0.41
94 0.43
95 0.51
96 0.59
97 0.61
98 0.63
99 0.64
100 0.63
101 0.62
102 0.63
103 0.59
104 0.57
105 0.5
106 0.42
107 0.34
108 0.3
109 0.27
110 0.27
111 0.22
112 0.15
113 0.11
114 0.11
115 0.15
116 0.25
117 0.34
118 0.43
119 0.49
120 0.58
121 0.65
122 0.71
123 0.75
124 0.76
125 0.76
126 0.76
127 0.81
128 0.79
129 0.81
130 0.85
131 0.86
132 0.84
133 0.84
134 0.75
135 0.73
136 0.75
137 0.73
138 0.65
139 0.63
140 0.6
141 0.53
142 0.52
143 0.44
144 0.37
145 0.29
146 0.27
147 0.21
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.22
153 0.27
154 0.29
155 0.35
156 0.42
157 0.47
158 0.49
159 0.52
160 0.54
161 0.56
162 0.58
163 0.53
164 0.5
165 0.49
166 0.48
167 0.41
168 0.31
169 0.25
170 0.21
171 0.19
172 0.13
173 0.09
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.02
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.1
192 0.12
193 0.15
194 0.18
195 0.19
196 0.21
197 0.28
198 0.35
199 0.35
200 0.39
201 0.41
202 0.43
203 0.44
204 0.42
205 0.41
206 0.39
207 0.38
208 0.36
209 0.39
210 0.44
211 0.52
212 0.62
213 0.66
214 0.71
215 0.75
216 0.79
217 0.81
218 0.77
219 0.71
220 0.64
221 0.56
222 0.52
223 0.46
224 0.39
225 0.34
226 0.31