Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A162N1J8

Protein Details
Accession A0A162N1J8    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29CGDVLTKKKLDPHRNRCHGATHydrophilic
56-77KYQGALYKEKPKKNSNNTQTQAHydrophilic
216-244APKTERRRSKDGDKKDKKRKRLHIEVAGDBasic
282-302TPASPLKKSKHSKHGKSSHGHBasic
309-348MITGGSKKSKKSKDKKRHRRSKSPKSPKKLEFHKEPPKTEBasic
377-397CSMNKALKRYHRERKSSGSSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-236KTERRRSKDGDKKDKKRKR
289-296KSKHSKHG
313-342GSKKSKKSKDKKRHRRSKSPKSPKKLEFHK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCEECGDVLTKKKLDPHRNRCHGATFTCIDCMVHFPGVQYRSHTSCMTEDQKYQGALYKEKPKKNSNNTQTQAQSRNTSSKHDSNPQPTKKTKMMAHQSYVQDVPDDASFGHWAEYAGQTEDERSPVDHMPEAPTPPPAHREQPFNVFDYLVATGQTPNASNVDLAKPMPVESQSTSLVRYEHNADGYLVDDEPYVQYGSGPVHTDAYVTPAPKTERRRSKDGDKKDKKRKRLHIEVAGDEEMVDAPPVLHSGLTGNLKSLMRFPPSPEYSGDAAEATPASPLKKSKHSKHGKSSHGHSHSIFDMITGGSKKSKKSKDKKRHRRSKSPKSPKKLEFHKEPPKTETEGQMVLFKPRADMFLGFVNKGPESDRGCSMNKALKRYHRERKSSGSSVSKVKDEKELWRSLRLRRNERGEIVVFALDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.33
3 0.42
4 0.5
5 0.58
6 0.66
7 0.7
8 0.74
9 0.81
10 0.84
11 0.79
12 0.76
13 0.71
14 0.62
15 0.58
16 0.5
17 0.41
18 0.38
19 0.34
20 0.27
21 0.22
22 0.23
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.29
32 0.31
33 0.34
34 0.33
35 0.29
36 0.3
37 0.37
38 0.38
39 0.36
40 0.35
41 0.36
42 0.38
43 0.36
44 0.34
45 0.32
46 0.29
47 0.3
48 0.35
49 0.42
50 0.48
51 0.54
52 0.6
53 0.65
54 0.72
55 0.78
56 0.82
57 0.8
58 0.82
59 0.79
60 0.79
61 0.75
62 0.71
63 0.68
64 0.61
65 0.57
66 0.49
67 0.53
68 0.47
69 0.48
70 0.48
71 0.49
72 0.51
73 0.55
74 0.59
75 0.61
76 0.7
77 0.72
78 0.73
79 0.7
80 0.71
81 0.67
82 0.66
83 0.61
84 0.6
85 0.63
86 0.61
87 0.6
88 0.61
89 0.57
90 0.53
91 0.48
92 0.38
93 0.28
94 0.22
95 0.19
96 0.12
97 0.11
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.24
129 0.23
130 0.28
131 0.29
132 0.34
133 0.34
134 0.41
135 0.41
136 0.39
137 0.36
138 0.29
139 0.26
140 0.21
141 0.2
142 0.11
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.13
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.16
204 0.21
205 0.29
206 0.34
207 0.43
208 0.48
209 0.55
210 0.57
211 0.66
212 0.69
213 0.73
214 0.75
215 0.75
216 0.81
217 0.85
218 0.87
219 0.87
220 0.87
221 0.87
222 0.85
223 0.85
224 0.83
225 0.81
226 0.77
227 0.69
228 0.62
229 0.51
230 0.41
231 0.3
232 0.22
233 0.13
234 0.09
235 0.07
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.17
252 0.17
253 0.19
254 0.2
255 0.23
256 0.28
257 0.3
258 0.31
259 0.29
260 0.3
261 0.27
262 0.27
263 0.24
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.14
274 0.18
275 0.28
276 0.37
277 0.44
278 0.54
279 0.64
280 0.71
281 0.78
282 0.83
283 0.81
284 0.78
285 0.76
286 0.75
287 0.69
288 0.63
289 0.53
290 0.46
291 0.39
292 0.34
293 0.27
294 0.17
295 0.13
296 0.1
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.16
301 0.19
302 0.24
303 0.33
304 0.43
305 0.51
306 0.61
307 0.72
308 0.77
309 0.86
310 0.92
311 0.94
312 0.95
313 0.94
314 0.95
315 0.95
316 0.95
317 0.95
318 0.95
319 0.94
320 0.93
321 0.93
322 0.9
323 0.89
324 0.87
325 0.84
326 0.83
327 0.83
328 0.84
329 0.82
330 0.77
331 0.72
332 0.66
333 0.63
334 0.56
335 0.51
336 0.44
337 0.39
338 0.36
339 0.36
340 0.32
341 0.3
342 0.29
343 0.24
344 0.22
345 0.2
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.22
351 0.25
352 0.23
353 0.24
354 0.25
355 0.22
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.24
360 0.26
361 0.29
362 0.3
363 0.33
364 0.34
365 0.37
366 0.39
367 0.38
368 0.41
369 0.45
370 0.5
371 0.58
372 0.66
373 0.72
374 0.74
375 0.79
376 0.79
377 0.81
378 0.81
379 0.77
380 0.75
381 0.72
382 0.67
383 0.66
384 0.63
385 0.6
386 0.53
387 0.49
388 0.5
389 0.45
390 0.5
391 0.5
392 0.56
393 0.52
394 0.59
395 0.63
396 0.63
397 0.69
398 0.7
399 0.71
400 0.71
401 0.77
402 0.75
403 0.73
404 0.71
405 0.64
406 0.56
407 0.48
408 0.4
409 0.31